Protein–RNA interactions for Protein: C0LLJ0

Kpna7, Importin subunit alpha-8, mousemouse

Predictions only

Length 499 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kpna7C0LLJ0 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Kpna7C0LLJ0 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Kpna7C0LLJ0 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Kpna7C0LLJ0 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Kpna7C0LLJ0 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Kpna7C0LLJ0 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Kpna7C0LLJ0 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Kpna7C0LLJ0 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Kpna7C0LLJ0 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Kpna7C0LLJ0 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Kpna7C0LLJ0 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Kpna7C0LLJ0 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Kpna7C0LLJ0 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Kpna7C0LLJ0 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Kpna7C0LLJ0 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Kpna7C0LLJ0 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Kpna7C0LLJ0 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Kpna7C0LLJ0 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Kpna7C0LLJ0 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Kpna7C0LLJ0 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Kpna7C0LLJ0 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Kpna7C0LLJ0 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Kpna7C0LLJ0 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Kpna7C0LLJ0 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Kpna7C0LLJ0 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Kpna7C0LLJ0 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Kpna7C0LLJ0 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Kpna7C0LLJ0 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Kpna7C0LLJ0 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Kpna7C0LLJ0 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Kpna7C0LLJ0 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Kpna7C0LLJ0 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Kpna7C0LLJ0 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Kpna7C0LLJ0 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Kpna7C0LLJ0 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Kpna7C0LLJ0 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Kpna7C0LLJ0 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Kpna7C0LLJ0 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Kpna7C0LLJ0 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Kpna7C0LLJ0 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Kpna7C0LLJ0 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Kpna7C0LLJ0 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Kpna7C0LLJ0 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Kpna7C0LLJ0 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Kpna7C0LLJ0 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Kpna7C0LLJ0 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Kpna7C0LLJ0 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Kpna7C0LLJ0 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Kpna7C0LLJ0 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Kpna7C0LLJ0 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Kpna7C0LLJ0 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Kpna7C0LLJ0 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Kpna7C0LLJ0 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Kpna7C0LLJ0 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Kpna7C0LLJ0 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Kpna7C0LLJ0 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Kpna7C0LLJ0 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Kpna7C0LLJ0 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Kpna7C0LLJ0 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Kpna7C0LLJ0 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Kpna7C0LLJ0 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Kpna7C0LLJ0 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Kpna7C0LLJ0 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Kpna7C0LLJ0 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Kpna7C0LLJ0 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Kpna7C0LLJ0 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Kpna7C0LLJ0 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Kpna7C0LLJ0 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Kpna7C0LLJ0 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Kpna7C0LLJ0 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Kpna7C0LLJ0 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Kpna7C0LLJ0 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Kpna7C0LLJ0 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Kpna7C0LLJ0 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Kpna7C0LLJ0 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Kpna7C0LLJ0 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Kpna7C0LLJ0 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Kpna7C0LLJ0 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Kpna7C0LLJ0 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Kpna7C0LLJ0 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Kpna7C0LLJ0 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Kpna7C0LLJ0 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Kpna7C0LLJ0 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Kpna7C0LLJ0 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Kpna7C0LLJ0 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Kpna7C0LLJ0 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Kpna7C0LLJ0 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Kpna7C0LLJ0 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Kpna7C0LLJ0 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Kpna7C0LLJ0 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Kpna7C0LLJ0 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Kpna7C0LLJ0 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Kpna7C0LLJ0 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Kpna7C0LLJ0 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Kpna7C0LLJ0 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Kpna7C0LLJ0 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Kpna7C0LLJ0 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Kpna7C0LLJ0 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Kpna7C0LLJ0 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Kpna7C0LLJ0 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms