Protein–RNA interactions for Protein: B8JJZ9

Zfp563, Zinc finger protein 563, mousemouse

Predictions only

Length 448 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Zfp563B8JJZ9 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Zfp563B8JJZ9 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Zfp563B8JJZ9 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Zfp563B8JJZ9 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Zfp563B8JJZ9 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Zfp563B8JJZ9 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Zfp563B8JJZ9 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Zfp563B8JJZ9 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Zfp563B8JJZ9 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Zfp563B8JJZ9 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Zfp563B8JJZ9 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Zfp563B8JJZ9 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Zfp563B8JJZ9 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Zfp563B8JJZ9 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Zfp563B8JJZ9 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Zfp563B8JJZ9 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Zfp563B8JJZ9 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Zfp563B8JJZ9 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Zfp563B8JJZ9 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Zfp563B8JJZ9 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Zfp563B8JJZ9 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
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