Protein–RNA interactions for Protein: B2RUS7

Abcc8, ATP-binding cassette, sub-family C (CFTR/MRP), member 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,588 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcc8B2RUS7 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
Abcc8B2RUS7 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC34.37■■■■□ 3.09
Abcc8B2RUS7 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.37■■■■□ 3.09
Abcc8B2RUS7 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
Abcc8B2RUS7 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC34.37■■■■□ 3.09
Abcc8B2RUS7 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC34.37■■■■□ 3.09
Abcc8B2RUS7 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
Abcc8B2RUS7 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC34.37■■■■□ 3.09
Abcc8B2RUS7 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
Abcc8B2RUS7 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
Abcc8B2RUS7 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
Abcc8B2RUS7 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
Abcc8B2RUS7 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
Abcc8B2RUS7 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
Abcc8B2RUS7 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
Abcc8B2RUS7 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC34.36■■■■□ 3.09
Abcc8B2RUS7 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC34.36■■■■□ 3.09
Abcc8B2RUS7 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC34.36■■■■□ 3.09
Abcc8B2RUS7 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC34.36■■■■□ 3.09
Abcc8B2RUS7 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
Abcc8B2RUS7 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
Abcc8B2RUS7 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.36■■■■□ 3.09
Abcc8B2RUS7 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
Abcc8B2RUS7 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
Abcc8B2RUS7 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
Abcc8B2RUS7 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
Abcc8B2RUS7 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
Abcc8B2RUS7 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC34.36■■■■□ 3.09
Abcc8B2RUS7 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
Abcc8B2RUS7 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC34.35■■■■□ 3.09
Abcc8B2RUS7 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
Abcc8B2RUS7 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.34■■■■□ 3.09
Abcc8B2RUS7 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
Abcc8B2RUS7 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
Abcc8B2RUS7 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC34.34■■■■□ 3.09
Abcc8B2RUS7 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
Abcc8B2RUS7 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.34■■■■□ 3.09
Abcc8B2RUS7 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
Abcc8B2RUS7 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
Abcc8B2RUS7 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC34.33■■■■□ 3.09
Abcc8B2RUS7 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
Abcc8B2RUS7 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC34.33■■■■□ 3.09
Abcc8B2RUS7 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
Abcc8B2RUS7 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
Abcc8B2RUS7 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
Abcc8B2RUS7 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.09
Abcc8B2RUS7 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC34.32■■■■□ 3.09
Abcc8B2RUS7 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.09
Abcc8B2RUS7 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.09
Abcc8B2RUS7 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC34.32■■■■□ 3.09
Abcc8B2RUS7 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC34.32■■■■□ 3.09
Abcc8B2RUS7 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC34.32■■■■□ 3.08
Abcc8B2RUS7 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.32■■■■□ 3.08
Abcc8B2RUS7 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
Abcc8B2RUS7 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC34.32■■■■□ 3.08
Abcc8B2RUS7 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC34.32■■■■□ 3.08
Abcc8B2RUS7 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
Abcc8B2RUS7 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC34.31■■■■□ 3.08
Abcc8B2RUS7 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
Abcc8B2RUS7 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
Abcc8B2RUS7 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
Abcc8B2RUS7 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.31■■■■□ 3.08
Abcc8B2RUS7 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
Abcc8B2RUS7 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
Abcc8B2RUS7 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC34.3■■■■□ 3.08
Abcc8B2RUS7 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
Abcc8B2RUS7 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
Abcc8B2RUS7 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC34.3■■■■□ 3.08
Abcc8B2RUS7 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC34.3■■■■□ 3.08
Abcc8B2RUS7 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC34.3■■■■□ 3.08
Abcc8B2RUS7 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC34.3■■■■□ 3.08
Abcc8B2RUS7 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
Abcc8B2RUS7 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
Abcc8B2RUS7 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC34.3■■■■□ 3.08
Abcc8B2RUS7 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
Abcc8B2RUS7 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
Abcc8B2RUS7 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.29■■■■□ 3.08
Abcc8B2RUS7 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
Abcc8B2RUS7 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
Abcc8B2RUS7 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC34.29■■■■□ 3.08
Abcc8B2RUS7 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC34.29■■■■□ 3.08
Abcc8B2RUS7 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC34.29■■■■□ 3.08
Abcc8B2RUS7 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
Abcc8B2RUS7 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
Abcc8B2RUS7 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.28■■■■□ 3.08
Abcc8B2RUS7 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC34.28■■■■□ 3.08
Abcc8B2RUS7 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
Abcc8B2RUS7 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
Abcc8B2RUS7 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
Abcc8B2RUS7 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
Abcc8B2RUS7 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
Abcc8B2RUS7 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC34.28■■■■□ 3.08
Abcc8B2RUS7 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
Abcc8B2RUS7 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
Abcc8B2RUS7 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
Abcc8B2RUS7 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
Abcc8B2RUS7 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
Abcc8B2RUS7 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
Abcc8B2RUS7 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.27■■■■□ 3.08
Abcc8B2RUS7 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.27■■■■□ 3.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms