Protein–RNA interactions for Protein: B2RT89

Slc22a28, Predicted gene, EG434674, mousemouse

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc22a28B2RT89 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Slc22a28B2RT89 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Slc22a28B2RT89 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Slc22a28B2RT89 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Slc22a28B2RT89 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Slc22a28B2RT89 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc22a28B2RT89 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc22a28B2RT89 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc22a28B2RT89 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc22a28B2RT89 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc22a28B2RT89 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc22a28B2RT89 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc22a28B2RT89 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc22a28B2RT89 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc22a28B2RT89 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc22a28B2RT89 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc22a28B2RT89 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc22a28B2RT89 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc22a28B2RT89 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc22a28B2RT89 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc22a28B2RT89 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc22a28B2RT89 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc22a28B2RT89 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc22a28B2RT89 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc22a28B2RT89 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc22a28B2RT89 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc22a28B2RT89 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc22a28B2RT89 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc22a28B2RT89 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc22a28B2RT89 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc22a28B2RT89 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc22a28B2RT89 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc22a28B2RT89 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc22a28B2RT89 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc22a28B2RT89 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc22a28B2RT89 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc22a28B2RT89 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc22a28B2RT89 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc22a28B2RT89 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc22a28B2RT89 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc22a28B2RT89 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc22a28B2RT89 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc22a28B2RT89 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc22a28B2RT89 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc22a28B2RT89 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc22a28B2RT89 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc22a28B2RT89 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Slc22a28B2RT89 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Slc22a28B2RT89 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Slc22a28B2RT89 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Slc22a28B2RT89 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Slc22a28B2RT89 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Slc22a28B2RT89 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Slc22a28B2RT89 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Slc22a28B2RT89 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Slc22a28B2RT89 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Slc22a28B2RT89 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Slc22a28B2RT89 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Slc22a28B2RT89 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Slc22a28B2RT89 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Slc22a28B2RT89 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Slc22a28B2RT89 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Slc22a28B2RT89 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Slc22a28B2RT89 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Slc22a28B2RT89 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Slc22a28B2RT89 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Slc22a28B2RT89 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Slc22a28B2RT89 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc22a28B2RT89 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc22a28B2RT89 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc22a28B2RT89 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc22a28B2RT89 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc22a28B2RT89 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc22a28B2RT89 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc22a28B2RT89 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc22a28B2RT89 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc22a28B2RT89 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc22a28B2RT89 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc22a28B2RT89 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc22a28B2RT89 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc22a28B2RT89 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc22a28B2RT89 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc22a28B2RT89 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc22a28B2RT89 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc22a28B2RT89 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc22a28B2RT89 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc22a28B2RT89 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc22a28B2RT89 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc22a28B2RT89 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc22a28B2RT89 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc22a28B2RT89 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc22a28B2RT89 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc22a28B2RT89 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc22a28B2RT89 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc22a28B2RT89 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc22a28B2RT89 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc22a28B2RT89 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc22a28B2RT89 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc22a28B2RT89 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc22a28B2RT89 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.8 ms