Protein–RNA interactions for Protein: B2RRE4

Znf518b, Zinc finger protein 518B, mousemouse

Predictions only

Length 1,077 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf518bB2RRE4 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Znf518bB2RRE4 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Znf518bB2RRE4 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Znf518bB2RRE4 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Znf518bB2RRE4 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Znf518bB2RRE4 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Znf518bB2RRE4 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Znf518bB2RRE4 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Znf518bB2RRE4 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Znf518bB2RRE4 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
Znf518bB2RRE4 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Znf518bB2RRE4 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Znf518bB2RRE4 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Znf518bB2RRE4 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Znf518bB2RRE4 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Znf518bB2RRE4 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Znf518bB2RRE4 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Znf518bB2RRE4 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Znf518bB2RRE4 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Znf518bB2RRE4 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Znf518bB2RRE4 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Znf518bB2RRE4 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Znf518bB2RRE4 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Znf518bB2RRE4 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Znf518bB2RRE4 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Znf518bB2RRE4 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Znf518bB2RRE4 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Znf518bB2RRE4 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Znf518bB2RRE4 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Znf518bB2RRE4 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Znf518bB2RRE4 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Znf518bB2RRE4 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Znf518bB2RRE4 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Znf518bB2RRE4 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Znf518bB2RRE4 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Znf518bB2RRE4 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Znf518bB2RRE4 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Znf518bB2RRE4 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Znf518bB2RRE4 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Znf518bB2RRE4 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Znf518bB2RRE4 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Znf518bB2RRE4 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Znf518bB2RRE4 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Znf518bB2RRE4 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Znf518bB2RRE4 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Znf518bB2RRE4 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Znf518bB2RRE4 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Znf518bB2RRE4 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Znf518bB2RRE4 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Znf518bB2RRE4 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Znf518bB2RRE4 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Znf518bB2RRE4 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Znf518bB2RRE4 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Znf518bB2RRE4 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Znf518bB2RRE4 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Znf518bB2RRE4 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Znf518bB2RRE4 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Znf518bB2RRE4 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Znf518bB2RRE4 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Znf518bB2RRE4 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Znf518bB2RRE4 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Znf518bB2RRE4 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Znf518bB2RRE4 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Znf518bB2RRE4 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Znf518bB2RRE4 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Znf518bB2RRE4 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Znf518bB2RRE4 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Znf518bB2RRE4 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Znf518bB2RRE4 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Znf518bB2RRE4 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Znf518bB2RRE4 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Znf518bB2RRE4 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Znf518bB2RRE4 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Znf518bB2RRE4 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Znf518bB2RRE4 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Znf518bB2RRE4 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Znf518bB2RRE4 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Znf518bB2RRE4 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Znf518bB2RRE4 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Znf518bB2RRE4 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Znf518bB2RRE4 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Znf518bB2RRE4 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Znf518bB2RRE4 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Znf518bB2RRE4 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Znf518bB2RRE4 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Znf518bB2RRE4 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Znf518bB2RRE4 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Znf518bB2RRE4 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Znf518bB2RRE4 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Znf518bB2RRE4 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Znf518bB2RRE4 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Znf518bB2RRE4 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Znf518bB2RRE4 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Znf518bB2RRE4 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Znf518bB2RRE4 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Znf518bB2RRE4 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Znf518bB2RRE4 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Znf518bB2RRE4 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Znf518bB2RRE4 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Znf518bB2RRE4 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.1 ms