Protein–RNA interactions for Protein: B2RQY6

BC035947, BC035947 protein, mousemouse

Predictions only

Length 695 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC035947B2RQY6 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BC035947B2RQY6 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BC035947B2RQY6 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
BC035947B2RQY6 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BC035947B2RQY6 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
BC035947B2RQY6 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BC035947B2RQY6 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BC035947B2RQY6 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BC035947B2RQY6 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BC035947B2RQY6 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
BC035947B2RQY6 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BC035947B2RQY6 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BC035947B2RQY6 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BC035947B2RQY6 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BC035947B2RQY6 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BC035947B2RQY6 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BC035947B2RQY6 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BC035947B2RQY6 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BC035947B2RQY6 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BC035947B2RQY6 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BC035947B2RQY6 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BC035947B2RQY6 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
BC035947B2RQY6 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BC035947B2RQY6 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BC035947B2RQY6 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BC035947B2RQY6 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BC035947B2RQY6 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BC035947B2RQY6 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BC035947B2RQY6 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BC035947B2RQY6 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BC035947B2RQY6 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BC035947B2RQY6 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BC035947B2RQY6 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BC035947B2RQY6 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BC035947B2RQY6 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BC035947B2RQY6 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
BC035947B2RQY6 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BC035947B2RQY6 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BC035947B2RQY6 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BC035947B2RQY6 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BC035947B2RQY6 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BC035947B2RQY6 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BC035947B2RQY6 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
BC035947B2RQY6 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BC035947B2RQY6 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
BC035947B2RQY6 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
BC035947B2RQY6 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BC035947B2RQY6 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BC035947B2RQY6 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BC035947B2RQY6 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BC035947B2RQY6 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BC035947B2RQY6 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BC035947B2RQY6 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BC035947B2RQY6 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BC035947B2RQY6 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
BC035947B2RQY6 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BC035947B2RQY6 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BC035947B2RQY6 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
BC035947B2RQY6 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BC035947B2RQY6 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BC035947B2RQY6 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BC035947B2RQY6 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BC035947B2RQY6 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BC035947B2RQY6 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BC035947B2RQY6 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BC035947B2RQY6 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
BC035947B2RQY6 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BC035947B2RQY6 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BC035947B2RQY6 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BC035947B2RQY6 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BC035947B2RQY6 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BC035947B2RQY6 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BC035947B2RQY6 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BC035947B2RQY6 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BC035947B2RQY6 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BC035947B2RQY6 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
BC035947B2RQY6 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BC035947B2RQY6 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
BC035947B2RQY6 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
BC035947B2RQY6 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
BC035947B2RQY6 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
BC035947B2RQY6 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BC035947B2RQY6 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
BC035947B2RQY6 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
BC035947B2RQY6 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
BC035947B2RQY6 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
BC035947B2RQY6 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
BC035947B2RQY6 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
BC035947B2RQY6 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BC035947B2RQY6 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BC035947B2RQY6 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BC035947B2RQY6 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BC035947B2RQY6 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BC035947B2RQY6 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BC035947B2RQY6 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BC035947B2RQY6 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BC035947B2RQY6 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BC035947B2RQY6 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BC035947B2RQY6 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BC035947B2RQY6 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.9 ms