Protein–RNA interactions for Protein: B1B213

H60c, Histocompatibility antigen 60c, mousemouse

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H60cB1B213 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
H60cB1B213 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
H60cB1B213 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
H60cB1B213 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
H60cB1B213 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
H60cB1B213 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
H60cB1B213 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
H60cB1B213 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
H60cB1B213 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
H60cB1B213 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
H60cB1B213 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
H60cB1B213 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
H60cB1B213 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
H60cB1B213 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
H60cB1B213 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
H60cB1B213 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
H60cB1B213 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
H60cB1B213 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
H60cB1B213 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
H60cB1B213 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
H60cB1B213 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
H60cB1B213 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
H60cB1B213 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
H60cB1B213 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
H60cB1B213 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
H60cB1B213 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
H60cB1B213 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
H60cB1B213 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
H60cB1B213 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
H60cB1B213 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
H60cB1B213 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
H60cB1B213 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
H60cB1B213 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
H60cB1B213 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
H60cB1B213 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
H60cB1B213 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
H60cB1B213 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
H60cB1B213 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
H60cB1B213 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
H60cB1B213 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
H60cB1B213 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
H60cB1B213 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
H60cB1B213 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
H60cB1B213 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
H60cB1B213 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
H60cB1B213 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
H60cB1B213 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
H60cB1B213 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
H60cB1B213 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
H60cB1B213 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
H60cB1B213 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
H60cB1B213 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
H60cB1B213 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
H60cB1B213 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
H60cB1B213 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
H60cB1B213 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
H60cB1B213 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
H60cB1B213 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
H60cB1B213 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
H60cB1B213 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
H60cB1B213 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
H60cB1B213 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
H60cB1B213 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
H60cB1B213 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
H60cB1B213 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
H60cB1B213 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
H60cB1B213 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
H60cB1B213 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
H60cB1B213 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
H60cB1B213 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
H60cB1B213 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
H60cB1B213 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
H60cB1B213 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
H60cB1B213 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
H60cB1B213 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
H60cB1B213 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
H60cB1B213 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
H60cB1B213 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
H60cB1B213 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
H60cB1B213 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
H60cB1B213 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
H60cB1B213 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
H60cB1B213 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
H60cB1B213 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
H60cB1B213 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
H60cB1B213 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
H60cB1B213 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
H60cB1B213 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
H60cB1B213 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
H60cB1B213 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
H60cB1B213 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
H60cB1B213 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
H60cB1B213 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
H60cB1B213 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
H60cB1B213 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
H60cB1B213 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
H60cB1B213 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
H60cB1B213 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
H60cB1B213 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
H60cB1B213 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms