Protein–RNA interactions for Protein: B1AYL1

Scn7a, Sodium channel protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,681 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn7aB1AYL1 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Scn7aB1AYL1 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Scn7aB1AYL1 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Scn7aB1AYL1 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Scn7aB1AYL1 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Scn7aB1AYL1 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Scn7aB1AYL1 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Scn7aB1AYL1 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Scn7aB1AYL1 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Scn7aB1AYL1 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Scn7aB1AYL1 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Scn7aB1AYL1 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Scn7aB1AYL1 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Scn7aB1AYL1 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Scn7aB1AYL1 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Scn7aB1AYL1 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Scn7aB1AYL1 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Scn7aB1AYL1 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Scn7aB1AYL1 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Scn7aB1AYL1 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Scn7aB1AYL1 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Scn7aB1AYL1 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Scn7aB1AYL1 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Scn7aB1AYL1 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Scn7aB1AYL1 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Scn7aB1AYL1 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Scn7aB1AYL1 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Scn7aB1AYL1 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Scn7aB1AYL1 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Scn7aB1AYL1 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Scn7aB1AYL1 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Scn7aB1AYL1 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Scn7aB1AYL1 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Scn7aB1AYL1 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Scn7aB1AYL1 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Scn7aB1AYL1 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Scn7aB1AYL1 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Scn7aB1AYL1 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Scn7aB1AYL1 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Scn7aB1AYL1 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Scn7aB1AYL1 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Scn7aB1AYL1 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Scn7aB1AYL1 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Scn7aB1AYL1 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Scn7aB1AYL1 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Scn7aB1AYL1 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Scn7aB1AYL1 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Scn7aB1AYL1 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Scn7aB1AYL1 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Scn7aB1AYL1 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Scn7aB1AYL1 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Scn7aB1AYL1 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Scn7aB1AYL1 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Scn7aB1AYL1 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Scn7aB1AYL1 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Scn7aB1AYL1 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Scn7aB1AYL1 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Scn7aB1AYL1 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Scn7aB1AYL1 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Scn7aB1AYL1 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Scn7aB1AYL1 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Scn7aB1AYL1 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Scn7aB1AYL1 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Scn7aB1AYL1 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Scn7aB1AYL1 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Scn7aB1AYL1 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Scn7aB1AYL1 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Scn7aB1AYL1 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Scn7aB1AYL1 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Scn7aB1AYL1 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Scn7aB1AYL1 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Scn7aB1AYL1 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Scn7aB1AYL1 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Scn7aB1AYL1 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Scn7aB1AYL1 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Scn7aB1AYL1 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Scn7aB1AYL1 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Scn7aB1AYL1 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Scn7aB1AYL1 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Scn7aB1AYL1 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Scn7aB1AYL1 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Scn7aB1AYL1 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Scn7aB1AYL1 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Scn7aB1AYL1 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Scn7aB1AYL1 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Scn7aB1AYL1 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Scn7aB1AYL1 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Scn7aB1AYL1 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Scn7aB1AYL1 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Scn7aB1AYL1 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Scn7aB1AYL1 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Scn7aB1AYL1 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Scn7aB1AYL1 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Scn7aB1AYL1 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Scn7aB1AYL1 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Scn7aB1AYL1 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Scn7aB1AYL1 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Scn7aB1AYL1 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Scn7aB1AYL1 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Scn7aB1AYL1 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.7 ms