Protein–RNA interactions for Protein: B1AWZ3

Nipsnap3a, Nipsnap homolog 3A, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Nipsnap3aB1AWZ3 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nipsnap3aB1AWZ3 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nipsnap3aB1AWZ3 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nipsnap3aB1AWZ3 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nipsnap3aB1AWZ3 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Nipsnap3aB1AWZ3 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nipsnap3aB1AWZ3 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nipsnap3aB1AWZ3 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nipsnap3aB1AWZ3 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nipsnap3aB1AWZ3 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nipsnap3aB1AWZ3 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nipsnap3aB1AWZ3 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nipsnap3aB1AWZ3 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nipsnap3aB1AWZ3 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nipsnap3aB1AWZ3 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nipsnap3aB1AWZ3 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nipsnap3aB1AWZ3 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nipsnap3aB1AWZ3 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nipsnap3aB1AWZ3 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nipsnap3aB1AWZ3 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nipsnap3aB1AWZ3 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nipsnap3aB1AWZ3 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nipsnap3aB1AWZ3 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nipsnap3aB1AWZ3 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nipsnap3aB1AWZ3 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nipsnap3aB1AWZ3 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nipsnap3aB1AWZ3 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nipsnap3aB1AWZ3 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nipsnap3aB1AWZ3 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nipsnap3aB1AWZ3 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nipsnap3aB1AWZ3 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nipsnap3aB1AWZ3 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nipsnap3aB1AWZ3 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Nipsnap3aB1AWZ3 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Nipsnap3aB1AWZ3 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Nipsnap3aB1AWZ3 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Nipsnap3aB1AWZ3 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Nipsnap3aB1AWZ3 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Nipsnap3aB1AWZ3 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Nipsnap3aB1AWZ3 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Nipsnap3aB1AWZ3 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Nipsnap3aB1AWZ3 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Nipsnap3aB1AWZ3 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Nipsnap3aB1AWZ3 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Nipsnap3aB1AWZ3 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Nipsnap3aB1AWZ3 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nipsnap3aB1AWZ3 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nipsnap3aB1AWZ3 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nipsnap3aB1AWZ3 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nipsnap3aB1AWZ3 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nipsnap3aB1AWZ3 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nipsnap3aB1AWZ3 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nipsnap3aB1AWZ3 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nipsnap3aB1AWZ3 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nipsnap3aB1AWZ3 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nipsnap3aB1AWZ3 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nipsnap3aB1AWZ3 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nipsnap3aB1AWZ3 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nipsnap3aB1AWZ3 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nipsnap3aB1AWZ3 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nipsnap3aB1AWZ3 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nipsnap3aB1AWZ3 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nipsnap3aB1AWZ3 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nipsnap3aB1AWZ3 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nipsnap3aB1AWZ3 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nipsnap3aB1AWZ3 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nipsnap3aB1AWZ3 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nipsnap3aB1AWZ3 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nipsnap3aB1AWZ3 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nipsnap3aB1AWZ3 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nipsnap3aB1AWZ3 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nipsnap3aB1AWZ3 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nipsnap3aB1AWZ3 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nipsnap3aB1AWZ3 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Nipsnap3aB1AWZ3 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nipsnap3aB1AWZ3 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nipsnap3aB1AWZ3 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nipsnap3aB1AWZ3 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nipsnap3aB1AWZ3 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nipsnap3aB1AWZ3 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nipsnap3aB1AWZ3 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nipsnap3aB1AWZ3 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nipsnap3aB1AWZ3 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nipsnap3aB1AWZ3 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nipsnap3aB1AWZ3 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nipsnap3aB1AWZ3 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nipsnap3aB1AWZ3 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nipsnap3aB1AWZ3 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nipsnap3aB1AWZ3 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nipsnap3aB1AWZ3 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nipsnap3aB1AWZ3 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nipsnap3aB1AWZ3 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms