Protein–RNA interactions for Protein: B1AS29

Grik3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik3B1AS29 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Grik3B1AS29 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Grik3B1AS29 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Grik3B1AS29 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Grik3B1AS29 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Grik3B1AS29 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Grik3B1AS29 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Grik3B1AS29 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Grik3B1AS29 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Grik3B1AS29 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Grik3B1AS29 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Grik3B1AS29 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Grik3B1AS29 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Grik3B1AS29 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Grik3B1AS29 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Grik3B1AS29 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Grik3B1AS29 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Grik3B1AS29 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Grik3B1AS29 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Grik3B1AS29 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Grik3B1AS29 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Grik3B1AS29 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Grik3B1AS29 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Grik3B1AS29 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Grik3B1AS29 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Grik3B1AS29 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Grik3B1AS29 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Grik3B1AS29 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Grik3B1AS29 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Grik3B1AS29 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Grik3B1AS29 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Grik3B1AS29 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Grik3B1AS29 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Grik3B1AS29 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Grik3B1AS29 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Grik3B1AS29 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Grik3B1AS29 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Grik3B1AS29 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Grik3B1AS29 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Grik3B1AS29 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Grik3B1AS29 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Grik3B1AS29 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Grik3B1AS29 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Grik3B1AS29 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Grik3B1AS29 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Grik3B1AS29 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Grik3B1AS29 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Grik3B1AS29 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Grik3B1AS29 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Grik3B1AS29 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Grik3B1AS29 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Grik3B1AS29 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Grik3B1AS29 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Grik3B1AS29 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Grik3B1AS29 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Grik3B1AS29 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Grik3B1AS29 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Grik3B1AS29 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Grik3B1AS29 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Grik3B1AS29 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Grik3B1AS29 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Grik3B1AS29 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Grik3B1AS29 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Grik3B1AS29 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Grik3B1AS29 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Grik3B1AS29 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Grik3B1AS29 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Grik3B1AS29 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Grik3B1AS29 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Grik3B1AS29 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Grik3B1AS29 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Grik3B1AS29 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Grik3B1AS29 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Grik3B1AS29 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Grik3B1AS29 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Grik3B1AS29 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Grik3B1AS29 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Grik3B1AS29 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Grik3B1AS29 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Grik3B1AS29 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Grik3B1AS29 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Grik3B1AS29 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Grik3B1AS29 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Grik3B1AS29 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Grik3B1AS29 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Grik3B1AS29 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Grik3B1AS29 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Grik3B1AS29 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Grik3B1AS29 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Grik3B1AS29 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Grik3B1AS29 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Grik3B1AS29 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Grik3B1AS29 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Grik3B1AS29 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Grik3B1AS29 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Grik3B1AS29 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Grik3B1AS29 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Grik3B1AS29 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Grik3B1AS29 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Grik3B1AS29 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms