Protein–RNA interactions for Protein: B0V2N1

Ptprs, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase S, mousemouse

Predictions only

Length 1,907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprsB0V2N1 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PtprsB0V2N1 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PtprsB0V2N1 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PtprsB0V2N1 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PtprsB0V2N1 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PtprsB0V2N1 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PtprsB0V2N1 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PtprsB0V2N1 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
PtprsB0V2N1 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PtprsB0V2N1 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PtprsB0V2N1 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PtprsB0V2N1 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
PtprsB0V2N1 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PtprsB0V2N1 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PtprsB0V2N1 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PtprsB0V2N1 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PtprsB0V2N1 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PtprsB0V2N1 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PtprsB0V2N1 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PtprsB0V2N1 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PtprsB0V2N1 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PtprsB0V2N1 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PtprsB0V2N1 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PtprsB0V2N1 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PtprsB0V2N1 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
PtprsB0V2N1 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PtprsB0V2N1 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
PtprsB0V2N1 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PtprsB0V2N1 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PtprsB0V2N1 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PtprsB0V2N1 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PtprsB0V2N1 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PtprsB0V2N1 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PtprsB0V2N1 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PtprsB0V2N1 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PtprsB0V2N1 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PtprsB0V2N1 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PtprsB0V2N1 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PtprsB0V2N1 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PtprsB0V2N1 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
PtprsB0V2N1 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PtprsB0V2N1 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PtprsB0V2N1 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PtprsB0V2N1 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PtprsB0V2N1 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PtprsB0V2N1 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PtprsB0V2N1 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PtprsB0V2N1 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PtprsB0V2N1 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PtprsB0V2N1 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PtprsB0V2N1 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PtprsB0V2N1 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PtprsB0V2N1 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PtprsB0V2N1 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PtprsB0V2N1 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PtprsB0V2N1 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PtprsB0V2N1 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PtprsB0V2N1 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PtprsB0V2N1 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PtprsB0V2N1 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PtprsB0V2N1 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PtprsB0V2N1 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PtprsB0V2N1 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PtprsB0V2N1 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PtprsB0V2N1 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
PtprsB0V2N1 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PtprsB0V2N1 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PtprsB0V2N1 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PtprsB0V2N1 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PtprsB0V2N1 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PtprsB0V2N1 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PtprsB0V2N1 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PtprsB0V2N1 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PtprsB0V2N1 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PtprsB0V2N1 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PtprsB0V2N1 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PtprsB0V2N1 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
PtprsB0V2N1 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PtprsB0V2N1 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PtprsB0V2N1 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PtprsB0V2N1 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PtprsB0V2N1 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PtprsB0V2N1 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
PtprsB0V2N1 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PtprsB0V2N1 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PtprsB0V2N1 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PtprsB0V2N1 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PtprsB0V2N1 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PtprsB0V2N1 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PtprsB0V2N1 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PtprsB0V2N1 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PtprsB0V2N1 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PtprsB0V2N1 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PtprsB0V2N1 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PtprsB0V2N1 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PtprsB0V2N1 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PtprsB0V2N1 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PtprsB0V2N1 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PtprsB0V2N1 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PtprsB0V2N1 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms