Protein–RNA interactions for Protein: A3FIN4

Atp8b5, Phospholipid-transporting ATPase FetA, mousemouse

Predictions only

Length 1,183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp8b5A3FIN4 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Atp8b5A3FIN4 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Atp8b5A3FIN4 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Atp8b5A3FIN4 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Atp8b5A3FIN4 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Atp8b5A3FIN4 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Atp8b5A3FIN4 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Atp8b5A3FIN4 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Atp8b5A3FIN4 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Atp8b5A3FIN4 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Atp8b5A3FIN4 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Atp8b5A3FIN4 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Atp8b5A3FIN4 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Atp8b5A3FIN4 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Atp8b5A3FIN4 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Atp8b5A3FIN4 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Atp8b5A3FIN4 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Atp8b5A3FIN4 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Atp8b5A3FIN4 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Atp8b5A3FIN4 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Atp8b5A3FIN4 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Atp8b5A3FIN4 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Atp8b5A3FIN4 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Atp8b5A3FIN4 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
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Atp8b5A3FIN4 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Atp8b5A3FIN4 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Atp8b5A3FIN4 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Atp8b5A3FIN4 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Atp8b5A3FIN4 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Atp8b5A3FIN4 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Atp8b5A3FIN4 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
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Atp8b5A3FIN4 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Atp8b5A3FIN4 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
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Atp8b5A3FIN4 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
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Atp8b5A3FIN4 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
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Atp8b5A3FIN4 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Atp8b5A3FIN4 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Atp8b5A3FIN4 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Atp8b5A3FIN4 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Atp8b5A3FIN4 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Atp8b5A3FIN4 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Atp8b5A3FIN4 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.62
Atp8b5A3FIN4 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Atp8b5A3FIN4 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Atp8b5A3FIN4 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
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Atp8b5A3FIN4 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Atp8b5A3FIN4 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Atp8b5A3FIN4 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Atp8b5A3FIN4 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Atp8b5A3FIN4 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
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Atp8b5A3FIN4 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Atp8b5A3FIN4 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Atp8b5A3FIN4 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Atp8b5A3FIN4 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Atp8b5A3FIN4 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Atp8b5A3FIN4 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Atp8b5A3FIN4 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Atp8b5A3FIN4 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Atp8b5A3FIN4 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Atp8b5A3FIN4 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Atp8b5A3FIN4 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Atp8b5A3FIN4 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Atp8b5A3FIN4 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Atp8b5A3FIN4 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Atp8b5A3FIN4 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Atp8b5A3FIN4 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Atp8b5A3FIN4 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Atp8b5A3FIN4 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Atp8b5A3FIN4 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Atp8b5A3FIN4 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Atp8b5A3FIN4 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Atp8b5A3FIN4 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Atp8b5A3FIN4 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Atp8b5A3FIN4 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Atp8b5A3FIN4 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Atp8b5A3FIN4 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Atp8b5A3FIN4 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Atp8b5A3FIN4 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Atp8b5A3FIN4 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Atp8b5A3FIN4 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Atp8b5A3FIN4 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Atp8b5A3FIN4 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
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