Protein–RNA interactions for Protein: A2CFD5

Btbd35f28, BTB domain-containing 35, family member 28, mousemouse

Predictions only

Length 498 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Btbd35f28A2CFD5 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Btbd35f28A2CFD5 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Btbd35f28A2CFD5 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Btbd35f28A2CFD5 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Btbd35f28A2CFD5 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Btbd35f28A2CFD5 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Btbd35f28A2CFD5 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Btbd35f28A2CFD5 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Btbd35f28A2CFD5 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Btbd35f28A2CFD5 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Btbd35f28A2CFD5 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Btbd35f28A2CFD5 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Btbd35f28A2CFD5 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Btbd35f28A2CFD5 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Btbd35f28A2CFD5 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Btbd35f28A2CFD5 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Btbd35f28A2CFD5 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Btbd35f28A2CFD5 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Btbd35f28A2CFD5 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Btbd35f28A2CFD5 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Btbd35f28A2CFD5 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Btbd35f28A2CFD5 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Btbd35f28A2CFD5 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Btbd35f28A2CFD5 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Btbd35f28A2CFD5 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Btbd35f28A2CFD5 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Btbd35f28A2CFD5 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Btbd35f28A2CFD5 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Btbd35f28A2CFD5 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Btbd35f28A2CFD5 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Btbd35f28A2CFD5 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Btbd35f28A2CFD5 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Btbd35f28A2CFD5 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Btbd35f28A2CFD5 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Btbd35f28A2CFD5 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Btbd35f28A2CFD5 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Btbd35f28A2CFD5 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Btbd35f28A2CFD5 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Btbd35f28A2CFD5 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Btbd35f28A2CFD5 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Btbd35f28A2CFD5 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Btbd35f28A2CFD5 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Btbd35f28A2CFD5 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Btbd35f28A2CFD5 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Btbd35f28A2CFD5 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Btbd35f28A2CFD5 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Btbd35f28A2CFD5 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Btbd35f28A2CFD5 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Btbd35f28A2CFD5 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Btbd35f28A2CFD5 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Btbd35f28A2CFD5 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Btbd35f28A2CFD5 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Btbd35f28A2CFD5 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Btbd35f28A2CFD5 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Btbd35f28A2CFD5 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Btbd35f28A2CFD5 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Btbd35f28A2CFD5 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Btbd35f28A2CFD5 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Btbd35f28A2CFD5 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Btbd35f28A2CFD5 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Btbd35f28A2CFD5 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Btbd35f28A2CFD5 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Btbd35f28A2CFD5 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Btbd35f28A2CFD5 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Btbd35f28A2CFD5 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Btbd35f28A2CFD5 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Btbd35f28A2CFD5 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Btbd35f28A2CFD5 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Btbd35f28A2CFD5 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Btbd35f28A2CFD5 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Btbd35f28A2CFD5 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Btbd35f28A2CFD5 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Btbd35f28A2CFD5 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Btbd35f28A2CFD5 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Btbd35f28A2CFD5 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Btbd35f28A2CFD5 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Btbd35f28A2CFD5 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Btbd35f28A2CFD5 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Btbd35f28A2CFD5 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Btbd35f28A2CFD5 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Btbd35f28A2CFD5 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Btbd35f28A2CFD5 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Btbd35f28A2CFD5 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Btbd35f28A2CFD5 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Btbd35f28A2CFD5 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Btbd35f28A2CFD5 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Btbd35f28A2CFD5 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Btbd35f28A2CFD5 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Btbd35f28A2CFD5 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Btbd35f28A2CFD5 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Btbd35f28A2CFD5 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Btbd35f28A2CFD5 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Btbd35f28A2CFD5 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Btbd35f28A2CFD5 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Btbd35f28A2CFD5 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Btbd35f28A2CFD5 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Btbd35f28A2CFD5 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Btbd35f28A2CFD5 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Btbd35f28A2CFD5 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Btbd35f28A2CFD5 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.7 ms