Protein–RNA interactions for Protein: A2BI40

Xlr4a, X-linked lymphocyte-regulated 4A, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xlr4aA2BI40 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Xlr4aA2BI40 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Xlr4aA2BI40 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Xlr4aA2BI40 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Xlr4aA2BI40 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Xlr4aA2BI40 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Xlr4aA2BI40 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Xlr4aA2BI40 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Xlr4aA2BI40 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Xlr4aA2BI40 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Xlr4aA2BI40 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Xlr4aA2BI40 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Xlr4aA2BI40 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Xlr4aA2BI40 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Xlr4aA2BI40 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Xlr4aA2BI40 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Xlr4aA2BI40 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Xlr4aA2BI40 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Xlr4aA2BI40 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Xlr4aA2BI40 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Xlr4aA2BI40 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Xlr4aA2BI40 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Xlr4aA2BI40 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Xlr4aA2BI40 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Xlr4aA2BI40 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Xlr4aA2BI40 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Xlr4aA2BI40 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Xlr4aA2BI40 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Xlr4aA2BI40 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Xlr4aA2BI40 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Xlr4aA2BI40 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Xlr4aA2BI40 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Xlr4aA2BI40 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Xlr4aA2BI40 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Xlr4aA2BI40 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Xlr4aA2BI40 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Xlr4aA2BI40 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Xlr4aA2BI40 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Xlr4aA2BI40 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Xlr4aA2BI40 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Xlr4aA2BI40 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Xlr4aA2BI40 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Xlr4aA2BI40 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Xlr4aA2BI40 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Xlr4aA2BI40 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Xlr4aA2BI40 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Xlr4aA2BI40 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Xlr4aA2BI40 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Xlr4aA2BI40 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Xlr4aA2BI40 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Xlr4aA2BI40 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Xlr4aA2BI40 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Xlr4aA2BI40 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Xlr4aA2BI40 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Xlr4aA2BI40 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Xlr4aA2BI40 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Xlr4aA2BI40 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Xlr4aA2BI40 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Xlr4aA2BI40 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Xlr4aA2BI40 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Xlr4aA2BI40 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Xlr4aA2BI40 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Xlr4aA2BI40 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Xlr4aA2BI40 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Xlr4aA2BI40 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Xlr4aA2BI40 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Xlr4aA2BI40 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Xlr4aA2BI40 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Xlr4aA2BI40 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Xlr4aA2BI40 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Xlr4aA2BI40 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Xlr4aA2BI40 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Xlr4aA2BI40 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Xlr4aA2BI40 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Xlr4aA2BI40 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Xlr4aA2BI40 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Xlr4aA2BI40 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Xlr4aA2BI40 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Xlr4aA2BI40 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Xlr4aA2BI40 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Xlr4aA2BI40 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Xlr4aA2BI40 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Xlr4aA2BI40 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Xlr4aA2BI40 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Xlr4aA2BI40 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Xlr4aA2BI40 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Xlr4aA2BI40 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Xlr4aA2BI40 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Xlr4aA2BI40 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Xlr4aA2BI40 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Xlr4aA2BI40 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Xlr4aA2BI40 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Xlr4aA2BI40 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Xlr4aA2BI40 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Xlr4aA2BI40 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Xlr4aA2BI40 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Xlr4aA2BI40 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Xlr4aA2BI40 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Xlr4aA2BI40 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Xlr4aA2BI40 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms