Protein–RNA interactions for Protein: A2AUC9

Klhl41, Kelch-like protein 41, mousemouse

Predictions only

Length 606 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl41A2AUC9 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Klhl41A2AUC9 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Klhl41A2AUC9 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Klhl41A2AUC9 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Klhl41A2AUC9 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Klhl41A2AUC9 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Klhl41A2AUC9 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Klhl41A2AUC9 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Klhl41A2AUC9 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Klhl41A2AUC9 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Klhl41A2AUC9 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Klhl41A2AUC9 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Klhl41A2AUC9 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Klhl41A2AUC9 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Klhl41A2AUC9 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Klhl41A2AUC9 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Klhl41A2AUC9 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Klhl41A2AUC9 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Klhl41A2AUC9 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Klhl41A2AUC9 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Klhl41A2AUC9 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Klhl41A2AUC9 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Klhl41A2AUC9 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Klhl41A2AUC9 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Klhl41A2AUC9 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Klhl41A2AUC9 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Klhl41A2AUC9 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Klhl41A2AUC9 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Klhl41A2AUC9 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Klhl41A2AUC9 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Klhl41A2AUC9 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Klhl41A2AUC9 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Klhl41A2AUC9 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Klhl41A2AUC9 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Klhl41A2AUC9 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Klhl41A2AUC9 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Klhl41A2AUC9 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Klhl41A2AUC9 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Klhl41A2AUC9 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Klhl41A2AUC9 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Klhl41A2AUC9 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Klhl41A2AUC9 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Klhl41A2AUC9 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Klhl41A2AUC9 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Klhl41A2AUC9 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Klhl41A2AUC9 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Klhl41A2AUC9 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Klhl41A2AUC9 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Klhl41A2AUC9 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Klhl41A2AUC9 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Klhl41A2AUC9 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Klhl41A2AUC9 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Klhl41A2AUC9 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Klhl41A2AUC9 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Klhl41A2AUC9 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Klhl41A2AUC9 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Klhl41A2AUC9 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Klhl41A2AUC9 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Klhl41A2AUC9 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Klhl41A2AUC9 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Klhl41A2AUC9 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Klhl41A2AUC9 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Klhl41A2AUC9 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Klhl41A2AUC9 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Klhl41A2AUC9 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Klhl41A2AUC9 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Klhl41A2AUC9 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Klhl41A2AUC9 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Klhl41A2AUC9 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Klhl41A2AUC9 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Klhl41A2AUC9 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Klhl41A2AUC9 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Klhl41A2AUC9 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Klhl41A2AUC9 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Klhl41A2AUC9 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Klhl41A2AUC9 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Klhl41A2AUC9 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Klhl41A2AUC9 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Klhl41A2AUC9 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Klhl41A2AUC9 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Klhl41A2AUC9 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Klhl41A2AUC9 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Klhl41A2AUC9 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Klhl41A2AUC9 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Klhl41A2AUC9 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Klhl41A2AUC9 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Klhl41A2AUC9 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Klhl41A2AUC9 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Klhl41A2AUC9 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Klhl41A2AUC9 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Klhl41A2AUC9 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Klhl41A2AUC9 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Klhl41A2AUC9 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Klhl41A2AUC9 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Klhl41A2AUC9 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Klhl41A2AUC9 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Klhl41A2AUC9 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Klhl41A2AUC9 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Klhl41A2AUC9 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Klhl41A2AUC9 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14 ms