Protein–RNA interactions for Protein: A2ASI5

Scn3a, Sodium channel protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,947 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn3aA2ASI5 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Scn3aA2ASI5 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Scn3aA2ASI5 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Scn3aA2ASI5 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Scn3aA2ASI5 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Scn3aA2ASI5 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Scn3aA2ASI5 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Scn3aA2ASI5 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Scn3aA2ASI5 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Scn3aA2ASI5 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Scn3aA2ASI5 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Scn3aA2ASI5 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Scn3aA2ASI5 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Scn3aA2ASI5 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Scn3aA2ASI5 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Scn3aA2ASI5 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Scn3aA2ASI5 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Scn3aA2ASI5 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Scn3aA2ASI5 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Scn3aA2ASI5 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Scn3aA2ASI5 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Scn3aA2ASI5 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Scn3aA2ASI5 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Scn3aA2ASI5 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Scn3aA2ASI5 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Scn3aA2ASI5 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Scn3aA2ASI5 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Scn3aA2ASI5 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Scn3aA2ASI5 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Scn3aA2ASI5 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Scn3aA2ASI5 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Scn3aA2ASI5 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Scn3aA2ASI5 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Scn3aA2ASI5 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Scn3aA2ASI5 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Scn3aA2ASI5 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Scn3aA2ASI5 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Scn3aA2ASI5 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Scn3aA2ASI5 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Scn3aA2ASI5 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Scn3aA2ASI5 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Scn3aA2ASI5 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Scn3aA2ASI5 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Scn3aA2ASI5 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Scn3aA2ASI5 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Scn3aA2ASI5 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Scn3aA2ASI5 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Scn3aA2ASI5 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Scn3aA2ASI5 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Scn3aA2ASI5 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Scn3aA2ASI5 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Scn3aA2ASI5 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Scn3aA2ASI5 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Scn3aA2ASI5 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Scn3aA2ASI5 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Scn3aA2ASI5 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Scn3aA2ASI5 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Scn3aA2ASI5 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Scn3aA2ASI5 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Scn3aA2ASI5 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Scn3aA2ASI5 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Scn3aA2ASI5 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Scn3aA2ASI5 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Scn3aA2ASI5 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Scn3aA2ASI5 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Scn3aA2ASI5 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Scn3aA2ASI5 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Scn3aA2ASI5 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Scn3aA2ASI5 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Scn3aA2ASI5 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Scn3aA2ASI5 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Scn3aA2ASI5 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Scn3aA2ASI5 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Scn3aA2ASI5 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Scn3aA2ASI5 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Scn3aA2ASI5 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Scn3aA2ASI5 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Scn3aA2ASI5 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Scn3aA2ASI5 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Scn3aA2ASI5 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Scn3aA2ASI5 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Scn3aA2ASI5 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Scn3aA2ASI5 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Scn3aA2ASI5 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Scn3aA2ASI5 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Scn3aA2ASI5 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Scn3aA2ASI5 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Scn3aA2ASI5 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Scn3aA2ASI5 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Scn3aA2ASI5 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Scn3aA2ASI5 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Scn3aA2ASI5 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Scn3aA2ASI5 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Scn3aA2ASI5 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Scn3aA2ASI5 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Scn3aA2ASI5 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Scn3aA2ASI5 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Scn3aA2ASI5 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Scn3aA2ASI5 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Scn3aA2ASI5 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms