Protein–RNA interactions for Protein: A2AQ19

Rtf1, RNA polymerase-associated protein RTF1 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 715 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtf1A2AQ19 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Rtf1A2AQ19 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rtf1A2AQ19 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rtf1A2AQ19 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rtf1A2AQ19 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Rtf1A2AQ19 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rtf1A2AQ19 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rtf1A2AQ19 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rtf1A2AQ19 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rtf1A2AQ19 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rtf1A2AQ19 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rtf1A2AQ19 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rtf1A2AQ19 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rtf1A2AQ19 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rtf1A2AQ19 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rtf1A2AQ19 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Rtf1A2AQ19 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rtf1A2AQ19 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rtf1A2AQ19 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rtf1A2AQ19 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rtf1A2AQ19 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rtf1A2AQ19 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Rtf1A2AQ19 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rtf1A2AQ19 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rtf1A2AQ19 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rtf1A2AQ19 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rtf1A2AQ19 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rtf1A2AQ19 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rtf1A2AQ19 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rtf1A2AQ19 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Rtf1A2AQ19 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rtf1A2AQ19 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rtf1A2AQ19 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rtf1A2AQ19 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rtf1A2AQ19 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rtf1A2AQ19 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rtf1A2AQ19 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rtf1A2AQ19 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rtf1A2AQ19 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rtf1A2AQ19 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rtf1A2AQ19 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rtf1A2AQ19 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rtf1A2AQ19 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Rtf1A2AQ19 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rtf1A2AQ19 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rtf1A2AQ19 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rtf1A2AQ19 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rtf1A2AQ19 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rtf1A2AQ19 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rtf1A2AQ19 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rtf1A2AQ19 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rtf1A2AQ19 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rtf1A2AQ19 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Rtf1A2AQ19 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Rtf1A2AQ19 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rtf1A2AQ19 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Rtf1A2AQ19 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rtf1A2AQ19 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rtf1A2AQ19 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rtf1A2AQ19 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rtf1A2AQ19 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rtf1A2AQ19 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rtf1A2AQ19 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rtf1A2AQ19 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rtf1A2AQ19 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rtf1A2AQ19 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rtf1A2AQ19 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rtf1A2AQ19 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rtf1A2AQ19 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rtf1A2AQ19 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rtf1A2AQ19 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rtf1A2AQ19 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rtf1A2AQ19 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rtf1A2AQ19 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rtf1A2AQ19 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rtf1A2AQ19 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rtf1A2AQ19 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rtf1A2AQ19 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rtf1A2AQ19 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Rtf1A2AQ19 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Rtf1A2AQ19 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Rtf1A2AQ19 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rtf1A2AQ19 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rtf1A2AQ19 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rtf1A2AQ19 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rtf1A2AQ19 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rtf1A2AQ19 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rtf1A2AQ19 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rtf1A2AQ19 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rtf1A2AQ19 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rtf1A2AQ19 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Rtf1A2AQ19 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rtf1A2AQ19 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rtf1A2AQ19 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rtf1A2AQ19 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rtf1A2AQ19 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rtf1A2AQ19 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rtf1A2AQ19 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rtf1A2AQ19 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rtf1A2AQ19 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms