Protein–RNA interactions for Protein: A2AKB4

Frmpd1, FERM and PDZ domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frmpd1A2AKB4 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Frmpd1A2AKB4 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Frmpd1A2AKB4 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Frmpd1A2AKB4 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Frmpd1A2AKB4 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Frmpd1A2AKB4 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Frmpd1A2AKB4 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Frmpd1A2AKB4 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Frmpd1A2AKB4 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
Frmpd1A2AKB4 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Frmpd1A2AKB4 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Frmpd1A2AKB4 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Frmpd1A2AKB4 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Frmpd1A2AKB4 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Frmpd1A2AKB4 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Frmpd1A2AKB4 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Frmpd1A2AKB4 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Frmpd1A2AKB4 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Frmpd1A2AKB4 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
Frmpd1A2AKB4 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Frmpd1A2AKB4 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
Frmpd1A2AKB4 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Frmpd1A2AKB4 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Frmpd1A2AKB4 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Frmpd1A2AKB4 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Frmpd1A2AKB4 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Frmpd1A2AKB4 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Frmpd1A2AKB4 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Frmpd1A2AKB4 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
Frmpd1A2AKB4 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Frmpd1A2AKB4 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Frmpd1A2AKB4 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
Frmpd1A2AKB4 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Frmpd1A2AKB4 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Frmpd1A2AKB4 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Frmpd1A2AKB4 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
Frmpd1A2AKB4 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Frmpd1A2AKB4 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
Frmpd1A2AKB4 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Frmpd1A2AKB4 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
Frmpd1A2AKB4 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
Frmpd1A2AKB4 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Frmpd1A2AKB4 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Frmpd1A2AKB4 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
Frmpd1A2AKB4 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Frmpd1A2AKB4 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Frmpd1A2AKB4 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Frmpd1A2AKB4 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Frmpd1A2AKB4 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Frmpd1A2AKB4 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Frmpd1A2AKB4 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Frmpd1A2AKB4 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Frmpd1A2AKB4 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Frmpd1A2AKB4 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Frmpd1A2AKB4 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
Frmpd1A2AKB4 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Frmpd1A2AKB4 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Frmpd1A2AKB4 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
Frmpd1A2AKB4 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
Frmpd1A2AKB4 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Frmpd1A2AKB4 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Frmpd1A2AKB4 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Frmpd1A2AKB4 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Frmpd1A2AKB4 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Frmpd1A2AKB4 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Frmpd1A2AKB4 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
Frmpd1A2AKB4 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Frmpd1A2AKB4 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Frmpd1A2AKB4 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Frmpd1A2AKB4 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Frmpd1A2AKB4 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Frmpd1A2AKB4 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Frmpd1A2AKB4 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Frmpd1A2AKB4 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Frmpd1A2AKB4 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Frmpd1A2AKB4 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Frmpd1A2AKB4 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Frmpd1A2AKB4 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Frmpd1A2AKB4 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Frmpd1A2AKB4 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Frmpd1A2AKB4 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Frmpd1A2AKB4 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
Frmpd1A2AKB4 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Frmpd1A2AKB4 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC28.95■■■□□ 2.22
Frmpd1A2AKB4 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Frmpd1A2AKB4 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
Frmpd1A2AKB4 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Frmpd1A2AKB4 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Frmpd1A2AKB4 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Frmpd1A2AKB4 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
Frmpd1A2AKB4 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Frmpd1A2AKB4 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Frmpd1A2AKB4 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Frmpd1A2AKB4 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Frmpd1A2AKB4 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Frmpd1A2AKB4 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Frmpd1A2AKB4 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Frmpd1A2AKB4 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
Frmpd1A2AKB4 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Frmpd1A2AKB4 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms