Protein–RNA interactions for Protein: A2A9K7

Cnksr1, Connector enhancer of kinase suppressor of Ras 1, mousemouse

Predictions only

Length 700 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnksr1A2A9K7 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cnksr1A2A9K7 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cnksr1A2A9K7 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cnksr1A2A9K7 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cnksr1A2A9K7 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Cnksr1A2A9K7 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Cnksr1A2A9K7 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cnksr1A2A9K7 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cnksr1A2A9K7 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cnksr1A2A9K7 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Cnksr1A2A9K7 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cnksr1A2A9K7 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Cnksr1A2A9K7 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Cnksr1A2A9K7 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Cnksr1A2A9K7 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Cnksr1A2A9K7 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cnksr1A2A9K7 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cnksr1A2A9K7 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cnksr1A2A9K7 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cnksr1A2A9K7 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cnksr1A2A9K7 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cnksr1A2A9K7 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cnksr1A2A9K7 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Cnksr1A2A9K7 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cnksr1A2A9K7 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cnksr1A2A9K7 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cnksr1A2A9K7 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cnksr1A2A9K7 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Cnksr1A2A9K7 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Cnksr1A2A9K7 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cnksr1A2A9K7 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cnksr1A2A9K7 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Cnksr1A2A9K7 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cnksr1A2A9K7 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cnksr1A2A9K7 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Cnksr1A2A9K7 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cnksr1A2A9K7 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cnksr1A2A9K7 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cnksr1A2A9K7 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Cnksr1A2A9K7 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cnksr1A2A9K7 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cnksr1A2A9K7 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Cnksr1A2A9K7 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cnksr1A2A9K7 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cnksr1A2A9K7 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Cnksr1A2A9K7 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cnksr1A2A9K7 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cnksr1A2A9K7 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cnksr1A2A9K7 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cnksr1A2A9K7 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Cnksr1A2A9K7 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cnksr1A2A9K7 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cnksr1A2A9K7 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cnksr1A2A9K7 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cnksr1A2A9K7 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cnksr1A2A9K7 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cnksr1A2A9K7 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cnksr1A2A9K7 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cnksr1A2A9K7 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cnksr1A2A9K7 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cnksr1A2A9K7 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Cnksr1A2A9K7 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Cnksr1A2A9K7 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Cnksr1A2A9K7 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Cnksr1A2A9K7 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Cnksr1A2A9K7 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cnksr1A2A9K7 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cnksr1A2A9K7 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cnksr1A2A9K7 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Cnksr1A2A9K7 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Cnksr1A2A9K7 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Cnksr1A2A9K7 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cnksr1A2A9K7 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cnksr1A2A9K7 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cnksr1A2A9K7 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cnksr1A2A9K7 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cnksr1A2A9K7 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cnksr1A2A9K7 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Cnksr1A2A9K7 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cnksr1A2A9K7 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cnksr1A2A9K7 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cnksr1A2A9K7 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Cnksr1A2A9K7 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cnksr1A2A9K7 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Cnksr1A2A9K7 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Cnksr1A2A9K7 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cnksr1A2A9K7 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Cnksr1A2A9K7 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cnksr1A2A9K7 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cnksr1A2A9K7 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Cnksr1A2A9K7 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Cnksr1A2A9K7 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Cnksr1A2A9K7 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cnksr1A2A9K7 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Cnksr1A2A9K7 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cnksr1A2A9K7 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cnksr1A2A9K7 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Cnksr1A2A9K7 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cnksr1A2A9K7 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Cnksr1A2A9K7 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms