Protein–RNA interactions for Protein: A2A9H6

Gm884, Predicted gene 884, mousemouse

Predictions only

Length 3,643 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm884A2A9H6 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm884A2A9H6 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm884A2A9H6 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm884A2A9H6 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm884A2A9H6 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm884A2A9H6 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm884A2A9H6 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm884A2A9H6 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm884A2A9H6 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm884A2A9H6 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm884A2A9H6 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm884A2A9H6 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm884A2A9H6 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm884A2A9H6 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm884A2A9H6 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm884A2A9H6 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm884A2A9H6 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm884A2A9H6 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm884A2A9H6 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm884A2A9H6 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm884A2A9H6 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm884A2A9H6 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm884A2A9H6 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm884A2A9H6 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm884A2A9H6 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm884A2A9H6 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm884A2A9H6 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm884A2A9H6 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm884A2A9H6 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm884A2A9H6 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm884A2A9H6 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm884A2A9H6 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm884A2A9H6 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm884A2A9H6 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm884A2A9H6 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm884A2A9H6 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm884A2A9H6 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm884A2A9H6 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm884A2A9H6 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm884A2A9H6 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm884A2A9H6 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm884A2A9H6 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm884A2A9H6 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm884A2A9H6 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm884A2A9H6 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm884A2A9H6 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm884A2A9H6 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm884A2A9H6 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm884A2A9H6 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm884A2A9H6 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm884A2A9H6 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm884A2A9H6 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm884A2A9H6 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm884A2A9H6 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm884A2A9H6 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm884A2A9H6 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm884A2A9H6 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm884A2A9H6 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm884A2A9H6 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm884A2A9H6 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm884A2A9H6 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm884A2A9H6 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm884A2A9H6 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm884A2A9H6 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm884A2A9H6 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm884A2A9H6 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm884A2A9H6 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm884A2A9H6 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm884A2A9H6 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm884A2A9H6 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm884A2A9H6 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm884A2A9H6 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm884A2A9H6 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm884A2A9H6 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm884A2A9H6 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm884A2A9H6 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm884A2A9H6 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm884A2A9H6 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm884A2A9H6 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm884A2A9H6 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm884A2A9H6 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm884A2A9H6 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm884A2A9H6 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm884A2A9H6 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm884A2A9H6 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm884A2A9H6 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm884A2A9H6 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm884A2A9H6 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm884A2A9H6 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm884A2A9H6 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm884A2A9H6 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm884A2A9H6 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm884A2A9H6 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm884A2A9H6 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm884A2A9H6 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm884A2A9H6 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm884A2A9H6 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm884A2A9H6 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm884A2A9H6 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm884A2A9H6 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms