Protein–RNA interactions for Protein: A2A935

Prdm16, PR domain zinc finger protein 16, mousemouse

Predictions only

Length 1,275 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm16A2A935 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Prdm16A2A935 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Prdm16A2A935 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Prdm16A2A935 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Prdm16A2A935 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Prdm16A2A935 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Prdm16A2A935 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Prdm16A2A935 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Prdm16A2A935 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Prdm16A2A935 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Prdm16A2A935 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Prdm16A2A935 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Prdm16A2A935 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Prdm16A2A935 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Prdm16A2A935 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Prdm16A2A935 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Prdm16A2A935 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Prdm16A2A935 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Prdm16A2A935 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Prdm16A2A935 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Prdm16A2A935 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Prdm16A2A935 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Prdm16A2A935 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Prdm16A2A935 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Prdm16A2A935 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Prdm16A2A935 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Prdm16A2A935 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Prdm16A2A935 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Prdm16A2A935 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Prdm16A2A935 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Prdm16A2A935 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Prdm16A2A935 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Prdm16A2A935 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Prdm16A2A935 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Prdm16A2A935 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Prdm16A2A935 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Prdm16A2A935 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Prdm16A2A935 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Prdm16A2A935 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Prdm16A2A935 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Prdm16A2A935 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Prdm16A2A935 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Prdm16A2A935 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Prdm16A2A935 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Prdm16A2A935 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Prdm16A2A935 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Prdm16A2A935 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Prdm16A2A935 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Prdm16A2A935 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Prdm16A2A935 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Prdm16A2A935 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Prdm16A2A935 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Prdm16A2A935 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Prdm16A2A935 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Prdm16A2A935 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Prdm16A2A935 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Prdm16A2A935 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Prdm16A2A935 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Prdm16A2A935 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Prdm16A2A935 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Prdm16A2A935 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Prdm16A2A935 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Prdm16A2A935 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Prdm16A2A935 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Prdm16A2A935 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Prdm16A2A935 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Prdm16A2A935 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Prdm16A2A935 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Prdm16A2A935 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Prdm16A2A935 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Prdm16A2A935 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Prdm16A2A935 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Prdm16A2A935 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Prdm16A2A935 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Prdm16A2A935 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Prdm16A2A935 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Prdm16A2A935 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Prdm16A2A935 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Prdm16A2A935 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Prdm16A2A935 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Prdm16A2A935 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Prdm16A2A935 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Prdm16A2A935 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Prdm16A2A935 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Prdm16A2A935 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Prdm16A2A935 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Prdm16A2A935 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Prdm16A2A935 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Prdm16A2A935 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Prdm16A2A935 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Prdm16A2A935 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Prdm16A2A935 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Prdm16A2A935 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Prdm16A2A935 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Prdm16A2A935 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Prdm16A2A935 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Prdm16A2A935 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Prdm16A2A935 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Prdm16A2A935 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Prdm16A2A935 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
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