Protein–RNA interactions for Protein: A2A6M5

Calcoco2, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calcoco2A2A6M5 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Calcoco2A2A6M5 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Calcoco2A2A6M5 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Calcoco2A2A6M5 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Calcoco2A2A6M5 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Calcoco2A2A6M5 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Calcoco2A2A6M5 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Calcoco2A2A6M5 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Calcoco2A2A6M5 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Calcoco2A2A6M5 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Calcoco2A2A6M5 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Calcoco2A2A6M5 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Calcoco2A2A6M5 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Calcoco2A2A6M5 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Calcoco2A2A6M5 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Calcoco2A2A6M5 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Calcoco2A2A6M5 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Calcoco2A2A6M5 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Calcoco2A2A6M5 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Calcoco2A2A6M5 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Calcoco2A2A6M5 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Calcoco2A2A6M5 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Calcoco2A2A6M5 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Calcoco2A2A6M5 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Calcoco2A2A6M5 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Calcoco2A2A6M5 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Calcoco2A2A6M5 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Calcoco2A2A6M5 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Calcoco2A2A6M5 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Calcoco2A2A6M5 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Calcoco2A2A6M5 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Calcoco2A2A6M5 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Calcoco2A2A6M5 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Calcoco2A2A6M5 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Calcoco2A2A6M5 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Calcoco2A2A6M5 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Calcoco2A2A6M5 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Calcoco2A2A6M5 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Calcoco2A2A6M5 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Calcoco2A2A6M5 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Calcoco2A2A6M5 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Calcoco2A2A6M5 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Calcoco2A2A6M5 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Calcoco2A2A6M5 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Calcoco2A2A6M5 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Calcoco2A2A6M5 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Calcoco2A2A6M5 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Calcoco2A2A6M5 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Calcoco2A2A6M5 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Calcoco2A2A6M5 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Calcoco2A2A6M5 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Calcoco2A2A6M5 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Calcoco2A2A6M5 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Calcoco2A2A6M5 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Calcoco2A2A6M5 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Calcoco2A2A6M5 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Calcoco2A2A6M5 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Calcoco2A2A6M5 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Calcoco2A2A6M5 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Calcoco2A2A6M5 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Calcoco2A2A6M5 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Calcoco2A2A6M5 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Calcoco2A2A6M5 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Calcoco2A2A6M5 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Calcoco2A2A6M5 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Calcoco2A2A6M5 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Calcoco2A2A6M5 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Calcoco2A2A6M5 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Calcoco2A2A6M5 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Calcoco2A2A6M5 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Calcoco2A2A6M5 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Calcoco2A2A6M5 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Calcoco2A2A6M5 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Calcoco2A2A6M5 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Calcoco2A2A6M5 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Calcoco2A2A6M5 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Calcoco2A2A6M5 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Calcoco2A2A6M5 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Calcoco2A2A6M5 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Calcoco2A2A6M5 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Calcoco2A2A6M5 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Calcoco2A2A6M5 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Calcoco2A2A6M5 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Calcoco2A2A6M5 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Calcoco2A2A6M5 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Calcoco2A2A6M5 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Calcoco2A2A6M5 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Calcoco2A2A6M5 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Calcoco2A2A6M5 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Calcoco2A2A6M5 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Calcoco2A2A6M5 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Calcoco2A2A6M5 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Calcoco2A2A6M5 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Calcoco2A2A6M5 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Calcoco2A2A6M5 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Calcoco2A2A6M5 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Calcoco2A2A6M5 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Calcoco2A2A6M5 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Calcoco2A2A6M5 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Calcoco2A2A6M5 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms