Protein–RNA interactions for Protein: A2A432

Cul4b, Cullin-4B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 970 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cul4bA2A432 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Cul4bA2A432 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Cul4bA2A432 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cul4bA2A432 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cul4bA2A432 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cul4bA2A432 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cul4bA2A432 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cul4bA2A432 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cul4bA2A432 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cul4bA2A432 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cul4bA2A432 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Cul4bA2A432 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cul4bA2A432 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cul4bA2A432 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cul4bA2A432 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cul4bA2A432 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cul4bA2A432 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cul4bA2A432 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cul4bA2A432 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cul4bA2A432 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cul4bA2A432 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cul4bA2A432 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cul4bA2A432 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cul4bA2A432 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cul4bA2A432 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cul4bA2A432 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cul4bA2A432 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cul4bA2A432 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cul4bA2A432 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cul4bA2A432 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cul4bA2A432 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cul4bA2A432 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cul4bA2A432 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cul4bA2A432 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cul4bA2A432 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Cul4bA2A432 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cul4bA2A432 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cul4bA2A432 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cul4bA2A432 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cul4bA2A432 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cul4bA2A432 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cul4bA2A432 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cul4bA2A432 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cul4bA2A432 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Cul4bA2A432 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Cul4bA2A432 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Cul4bA2A432 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Cul4bA2A432 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Cul4bA2A432 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Cul4bA2A432 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cul4bA2A432 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cul4bA2A432 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cul4bA2A432 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cul4bA2A432 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cul4bA2A432 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cul4bA2A432 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cul4bA2A432 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Cul4bA2A432 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cul4bA2A432 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cul4bA2A432 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cul4bA2A432 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cul4bA2A432 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cul4bA2A432 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cul4bA2A432 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cul4bA2A432 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cul4bA2A432 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cul4bA2A432 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cul4bA2A432 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cul4bA2A432 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cul4bA2A432 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cul4bA2A432 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cul4bA2A432 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cul4bA2A432 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cul4bA2A432 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cul4bA2A432 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cul4bA2A432 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cul4bA2A432 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cul4bA2A432 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cul4bA2A432 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cul4bA2A432 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cul4bA2A432 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Cul4bA2A432 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Cul4bA2A432 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Cul4bA2A432 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cul4bA2A432 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cul4bA2A432 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cul4bA2A432 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cul4bA2A432 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cul4bA2A432 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cul4bA2A432 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cul4bA2A432 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cul4bA2A432 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cul4bA2A432 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Cul4bA2A432 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cul4bA2A432 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Cul4bA2A432 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cul4bA2A432 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cul4bA2A432 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cul4bA2A432 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cul4bA2A432 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms