Protein–RNA interactions for Protein: A0JLY1

Ccdc173, Coiled-coil domain-containing protein 173, mousemouse

Predictions only

Length 547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc173A0JLY1 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ccdc173A0JLY1 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ccdc173A0JLY1 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ccdc173A0JLY1 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ccdc173A0JLY1 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ccdc173A0JLY1 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ccdc173A0JLY1 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ccdc173A0JLY1 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ccdc173A0JLY1 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ccdc173A0JLY1 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ccdc173A0JLY1 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ccdc173A0JLY1 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ccdc173A0JLY1 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ccdc173A0JLY1 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ccdc173A0JLY1 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Ccdc173A0JLY1 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Ccdc173A0JLY1 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Ccdc173A0JLY1 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Ccdc173A0JLY1 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Ccdc173A0JLY1 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Ccdc173A0JLY1 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccdc173A0JLY1 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccdc173A0JLY1 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccdc173A0JLY1 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccdc173A0JLY1 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccdc173A0JLY1 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccdc173A0JLY1 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccdc173A0JLY1 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccdc173A0JLY1 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccdc173A0JLY1 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccdc173A0JLY1 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccdc173A0JLY1 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccdc173A0JLY1 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccdc173A0JLY1 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccdc173A0JLY1 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccdc173A0JLY1 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccdc173A0JLY1 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccdc173A0JLY1 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccdc173A0JLY1 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccdc173A0JLY1 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccdc173A0JLY1 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccdc173A0JLY1 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccdc173A0JLY1 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccdc173A0JLY1 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccdc173A0JLY1 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccdc173A0JLY1 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccdc173A0JLY1 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccdc173A0JLY1 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccdc173A0JLY1 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccdc173A0JLY1 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccdc173A0JLY1 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccdc173A0JLY1 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccdc173A0JLY1 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccdc173A0JLY1 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccdc173A0JLY1 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccdc173A0JLY1 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccdc173A0JLY1 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccdc173A0JLY1 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccdc173A0JLY1 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccdc173A0JLY1 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccdc173A0JLY1 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccdc173A0JLY1 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccdc173A0JLY1 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccdc173A0JLY1 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccdc173A0JLY1 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccdc173A0JLY1 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ccdc173A0JLY1 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ccdc173A0JLY1 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ccdc173A0JLY1 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ccdc173A0JLY1 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ccdc173A0JLY1 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ccdc173A0JLY1 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ccdc173A0JLY1 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ccdc173A0JLY1 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ccdc173A0JLY1 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ccdc173A0JLY1 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ccdc173A0JLY1 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ccdc173A0JLY1 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ccdc173A0JLY1 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ccdc173A0JLY1 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ccdc173A0JLY1 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ccdc173A0JLY1 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ccdc173A0JLY1 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccdc173A0JLY1 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccdc173A0JLY1 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccdc173A0JLY1 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccdc173A0JLY1 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccdc173A0JLY1 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccdc173A0JLY1 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccdc173A0JLY1 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccdc173A0JLY1 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccdc173A0JLY1 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccdc173A0JLY1 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccdc173A0JLY1 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccdc173A0JLY1 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccdc173A0JLY1 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccdc173A0JLY1 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccdc173A0JLY1 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccdc173A0JLY1 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccdc173A0JLY1 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms