Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YVH6

1520401A03Rik, RIKEN cDNA 1520401A03 gene, mousemouse

Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
1520401A03RikA0A0J9YVH6 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
1520401A03RikA0A0J9YVH6 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
1520401A03RikA0A0J9YVH6 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
1520401A03RikA0A0J9YVH6 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
1520401A03RikA0A0J9YVH6 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
1520401A03RikA0A0J9YVH6 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
1520401A03RikA0A0J9YVH6 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
1520401A03RikA0A0J9YVH6 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
1520401A03RikA0A0J9YVH6 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
1520401A03RikA0A0J9YVH6 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
1520401A03RikA0A0J9YVH6 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
1520401A03RikA0A0J9YVH6 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
1520401A03RikA0A0J9YVH6 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
1520401A03RikA0A0J9YVH6 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms