Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1H0

Trbv12-1, T cell receptor beta, variable 12-1 (Fragment), mousemouse

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Length 124 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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Trbv12-1A0A0B4J1H0 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trbv12-1A0A0B4J1H0 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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Trbv12-1A0A0B4J1H0 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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Trbv12-1A0A0B4J1H0 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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Trbv12-1A0A0B4J1H0 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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Trbv12-1A0A0B4J1H0 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
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Trbv12-1A0A0B4J1H0 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
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