Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WR25

Gm28360, Predicted gene 28360, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28360A0A087WR25 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
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Gm28360A0A087WR25 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
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Gm28360A0A087WR25 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
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Gm28360A0A087WR25 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
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Gm28360A0A087WR25 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
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Gm28360A0A087WR25 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm28360A0A087WR25 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm28360A0A087WR25 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm28360A0A087WR25 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm28360A0A087WR25 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm28360A0A087WR25 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm28360A0A087WR25 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm28360A0A087WR25 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm28360A0A087WR25 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm28360A0A087WR25 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm28360A0A087WR25 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Gm28360A0A087WR25 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Gm28360A0A087WR25 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm28360A0A087WR25 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm28360A0A087WR25 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm28360A0A087WR25 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm28360A0A087WR25 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm28360A0A087WR25 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm28360A0A087WR25 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
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Gm28360A0A087WR25 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm28360A0A087WR25 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
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