Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z260

Cldn8, Claudin-8, mousemouse

Predictions only

Length 225 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn8Q9Z260 Gm1980-201ENSMUST00000123131 2306 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
Cldn8Q9Z260 Olfr629-202ENSMUST00000213906 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
Cldn8Q9Z260 Olfr934-202ENSMUST00000214324 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
Cldn8Q9Z260 AC123052.1-201ENSMUST00000220604 4616 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
Cldn8Q9Z260 Gm26384-201ENSMUST00000102183 110 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
Cldn8Q9Z260 Gm15485-201ENSMUST00000149095 258 ntTSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
Cldn8Q9Z260 Gm25153-201ENSMUST00000157118 156 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
Cldn8Q9Z260 Gm23981-201ENSMUST00000157136 106 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
Cldn8Q9Z260 Gm23642-201ENSMUST00000157858 258 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
Cldn8Q9Z260 Gm24958-201ENSMUST00000158009 97 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
Cldn8Q9Z260 Gm24771-201ENSMUST00000158508 137 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
Cldn8Q9Z260 Gm8114-201ENSMUST00000172225 484 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
Cldn8Q9Z260 Gm6660-201ENSMUST00000179149 468 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
Cldn8Q9Z260 Gm27220-201ENSMUST00000183453 262 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
Cldn8Q9Z260 Sly-201ENSMUST00000189109 797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
Cldn8Q9Z260 Trbv6-201ENSMUST00000193743 276 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
Cldn8Q9Z260 Gm29848-201ENSMUST00000203107 295 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
Cldn8Q9Z260 Gm32222-201ENSMUST00000203296 298 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
Cldn8Q9Z260 Gm44459-201ENSMUST00000203926 160 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
Cldn8Q9Z260 Gm44135-201ENSMUST00000205221 368 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
Cldn8Q9Z260 Gm8940-201ENSMUST00000212585 219 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
Cldn8Q9Z260 AC111044.1-201ENSMUST00000220206 555 ntTSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
Cldn8Q9Z260 CT010506.2-201ENSMUST00000225618 183 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
Cldn8Q9Z260 AC131029.2-202ENSMUST00000228430 496 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
Cldn8Q9Z260 Tslp-201ENSMUST00000025237 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
Cldn8Q9Z260 Olfr197-201ENSMUST00000080031 926 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
Cldn8Q9Z260 Gm22229-201ENSMUST00000082987 108 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
Cldn8Q9Z260 Smr2-201ENSMUST00000087043 676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
Cldn8Q9Z260 Gm32014-202ENSMUST00000215328 4168 ntTSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
Cldn8Q9Z260 Olfr974-202ENSMUST00000213246 3561 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.25□□□□□ -2.05
Cldn8Q9Z260 Gm22091-201ENSMUST00000116908 127 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
Cldn8Q9Z260 Gm13756-201ENSMUST00000117618 222 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
Cldn8Q9Z260 Gm12370-201ENSMUST00000117809 604 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
Cldn8Q9Z260 Gm16021-201ENSMUST00000121176 219 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
Cldn8Q9Z260 Gm12443-201ENSMUST00000122308 323 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
Cldn8Q9Z260 Gm14978-201ENSMUST00000129000 304 ntTSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
Cldn8Q9Z260 Gm22597-201ENSMUST00000157602 80 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
Cldn8Q9Z260 Gm22733-201ENSMUST00000158094 91 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
Cldn8Q9Z260 4930473D10Rik-201ENSMUST00000161975 487 ntTSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
Cldn8Q9Z260 Vmn1r-ps149-201ENSMUST00000176997 183 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
Cldn8Q9Z260 Gm24019-201ENSMUST00000178620 107 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
Cldn8Q9Z260 Gm26243-201ENSMUST00000179260 107 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
Cldn8Q9Z260 Gtpbp4-ps2-201ENSMUST00000184058 256 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
Cldn8Q9Z260 Obox4-ps2-201ENSMUST00000185088 442 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
Cldn8Q9Z260 Gm29550-201ENSMUST00000185543 285 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
Cldn8Q9Z260 Gm5329-201ENSMUST00000186898 463 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
Cldn8Q9Z260 Gm29335-201ENSMUST00000188361 459 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
Cldn8Q9Z260 4930459L07Rik-201ENSMUST00000199751 420 ntTSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
Cldn8Q9Z260 Gm44133-201ENSMUST00000203823 701 ntTSL 2 BASIC2.25□□□□□ -2.05
Cldn8Q9Z260 Gm39231-201ENSMUST00000209813 501 ntTSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
Cldn8Q9Z260 Gm45522-201ENSMUST00000210784 166 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
Cldn8Q9Z260 Olfr1086-202ENSMUST00000213198 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
Cldn8Q9Z260 AC132384.11-201ENSMUST00000219676 178 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
Cldn8Q9Z260 Defb19-201ENSMUST00000053180 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
Cldn8Q9Z260 Gm10298-201ENSMUST00000074801 265 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
Cldn8Q9Z260 Gm23296-201ENSMUST00000082555 107 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
Cldn8Q9Z260 Gm24859-201ENSMUST00000082729 107 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
Cldn8Q9Z260 Gm22622-201ENSMUST00000082870 129 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
Cldn8Q9Z260 Gm22443-201ENSMUST00000082890 107 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
Cldn8Q9Z260 Gm26494-201ENSMUST00000083154 143 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
Cldn8Q9Z260 Gm26166-201ENSMUST00000083788 107 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
Cldn8Q9Z260 Gm24493-201ENSMUST00000083805 143 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
Cldn8Q9Z260 Gm15292-201ENSMUST00000098895 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
Cldn8Q9Z260 Olfr1086-201ENSMUST00000099878 933 ntAPPRIS P1 BASIC2.25□□□□□ -2.05
Cldn8Q9Z260 Olfr1102-202ENSMUST00000214002 1806 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
Cldn8Q9Z260 Gm37761-201ENSMUST00000194989 2098 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
Cldn8Q9Z260 Gm43032-201ENSMUST00000197967 3123 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
Cldn8Q9Z260 Gm19428-201ENSMUST00000220512 1995 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
Cldn8Q9Z260 Gm8300-201ENSMUST00000110152 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
Cldn8Q9Z260 Olfr394-202ENSMUST00000214284 5562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
Cldn8Q9Z260 Zfp280c-202ENSMUST00000076635 4355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
Cldn8Q9Z260 AC153967.1-201ENSMUST00000219333 3190 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
Cldn8Q9Z260 Gm12765-201ENSMUST00000117273 615 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
Cldn8Q9Z260 Olfr379-ps1-201ENSMUST00000117349 934 ntAPPRIS P1 BASIC2.24□□□□□ -2.05
Cldn8Q9Z260 Gm14852-201ENSMUST00000120065 647 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
Cldn8Q9Z260 Gm12071-201ENSMUST00000121968 469 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
Cldn8Q9Z260 Gm23956-201ENSMUST00000157211 119 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
Cldn8Q9Z260 Gm24962-201ENSMUST00000157917 109 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
Cldn8Q9Z260 Gm22538-201ENSMUST00000158169 299 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
Cldn8Q9Z260 Gm22382-201ENSMUST00000158185 130 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
Cldn8Q9Z260 Gm22947-201ENSMUST00000158559 91 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
Cldn8Q9Z260 Gm20538-201ENSMUST00000166808 225 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
Cldn8Q9Z260 Gm18416-201ENSMUST00000175635 1003 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
Cldn8Q9Z260 Gm24304-201ENSMUST00000177635 107 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
Cldn8Q9Z260 Gm28838-201ENSMUST00000186338 315 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
Cldn8Q9Z260 Gm29635-201ENSMUST00000187221 315 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
Cldn8Q9Z260 Gm29026-201ENSMUST00000187787 315 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
Cldn8Q9Z260 Gm28474-201ENSMUST00000188501 315 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
Cldn8Q9Z260 Gm28797-201ENSMUST00000188543 315 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
Cldn8Q9Z260 Gm28855-201ENSMUST00000188680 315 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
Cldn8Q9Z260 Gm28705-201ENSMUST00000189548 315 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
Cldn8Q9Z260 Gm28939-201ENSMUST00000190351 315 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
Cldn8Q9Z260 Gm28223-201ENSMUST00000190469 315 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
Cldn8Q9Z260 Gm29092-201ENSMUST00000190768 315 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
Cldn8Q9Z260 Gm38238-201ENSMUST00000194334 346 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
Cldn8Q9Z260 Igkv2-93-1-201ENSMUST00000196774 272 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
Cldn8Q9Z260 Gm42716-203ENSMUST00000197140 259 ntTSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
Cldn8Q9Z260 Gm45452-201ENSMUST00000210905 177 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
Cldn8Q9Z260 AC069561.2-201ENSMUST00000217596 420 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
Cldn8Q9Z260 4930520P13Rik-201ENSMUST00000222622 505 ntTSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.9 ms