Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS0

Col4a3, Collagen alpha-3(IV) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,669 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a3Q9QZS0 Gm23517-201ENSMUST00000082830 192 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
Col4a3Q9QZS0 Gm22293-201ENSMUST00000083314 109 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
Col4a3Q9QZS0 Olfr1141-201ENSMUST00000099846 936 ntAPPRIS P1 BASIC1.35□□□□□ -2.19
Col4a3Q9QZS0 Olfr1467-202ENSMUST00000215096 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.34□□□□□ -2.19
Col4a3Q9QZS0 Olfr1253-203ENSMUST00000215185 4984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.34□□□□□ -2.19
Col4a3Q9QZS0 Gm42524-201ENSMUST00000202881 2214 ntTSL 1 (best) BASIC1.34□□□□□ -2.19
Col4a3Q9QZS0 Gm4224-201ENSMUST00000211557 1594 ntTSL 1 (best) BASIC1.34□□□□□ -2.19
Col4a3Q9QZS0 Gm45263-201ENSMUST00000210377 1375 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
Col4a3Q9QZS0 Gm15443-201ENSMUST00000118947 820 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
Col4a3Q9QZS0 Gm14069-201ENSMUST00000120815 229 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
Col4a3Q9QZS0 Vmn1r-ps27-201ENSMUST00000174619 985 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
Col4a3Q9QZS0 Mir5099-201ENSMUST00000175257 74 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
Col4a3Q9QZS0 Mir5124a-201ENSMUST00000175528 72 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
Col4a3Q9QZS0 Gm22111-201ENSMUST00000178010 79 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
Col4a3Q9QZS0 Gm23687-201ENSMUST00000178664 79 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
Col4a3Q9QZS0 Gm24566-201ENSMUST00000179286 79 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
Col4a3Q9QZS0 Gm22252-201ENSMUST00000179316 79 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
Col4a3Q9QZS0 Gm23305-201ENSMUST00000179342 79 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
Col4a3Q9QZS0 Gm26389-201ENSMUST00000179819 79 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
Col4a3Q9QZS0 Gm22130-201ENSMUST00000179979 79 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
Col4a3Q9QZS0 Gm22393-201ENSMUST00000180153 79 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
Col4a3Q9QZS0 Gm25085-201ENSMUST00000180298 79 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
Col4a3Q9QZS0 Mir6381-201ENSMUST00000183426 87 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
Col4a3Q9QZS0 Mir6371-201ENSMUST00000184470 111 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
Col4a3Q9QZS0 Gm28169-201ENSMUST00000190342 345 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
Col4a3Q9QZS0 Olfr837-201ENSMUST00000212482 1040 ntAPPRIS P1 BASIC1.34□□□□□ -2.19
Col4a3Q9QZS0 Gm19540-201ENSMUST00000221843 810 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
Col4a3Q9QZS0 2010005H15Rik-201ENSMUST00000063539 294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.34□□□□□ -2.19
Col4a3Q9QZS0 Gm25199-201ENSMUST00000083095 104 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
Col4a3Q9QZS0 AC124456.1-201ENSMUST00000217391 2597 ntBASIC1.34□□□□□ -2.2
Col4a3Q9QZS0 AC115047.2-201ENSMUST00000214421 1848 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
Col4a3Q9QZS0 Gm14442-201ENSMUST00000119690 1736 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
Col4a3Q9QZS0 Gm22658-201ENSMUST00000104196 155 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
Col4a3Q9QZS0 Gm14238-201ENSMUST00000120227 323 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
Col4a3Q9QZS0 Gm6938-201ENSMUST00000123014 771 ntTSL 3 BASIC1.33□□□□□ -2.2
Col4a3Q9QZS0 Gm20883-201ENSMUST00000185245 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.33□□□□□ -2.2
Col4a3Q9QZS0 Gm21117-202ENSMUST00000185327 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.33□□□□□ -2.2
Col4a3Q9QZS0 Gm20916-202ENSMUST00000185338 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.33□□□□□ -2.2
Col4a3Q9QZS0 Gm28897-201ENSMUST00000185340 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.33□□□□□ -2.2
Col4a3Q9QZS0 Gm20736-202ENSMUST00000185550 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.33□□□□□ -2.2
Col4a3Q9QZS0 Gm20835-201ENSMUST00000185565 923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.33□□□□□ -2.2
Col4a3Q9QZS0 Gm29564-201ENSMUST00000185575 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.33□□□□□ -2.2
Col4a3Q9QZS0 Gm29299-201ENSMUST00000185609 923 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
Col4a3Q9QZS0 Gm21317-201ENSMUST00000185636 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.33□□□□□ -2.2
Col4a3Q9QZS0 Gm21095-202ENSMUST00000185776 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.33□□□□□ -2.2
Col4a3Q9QZS0 Gm28553-201ENSMUST00000185924 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.33□□□□□ -2.2
Col4a3Q9QZS0 Gm20908-201ENSMUST00000186004 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.33□□□□□ -2.2
Col4a3Q9QZS0 Gm20929-201ENSMUST00000186578 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.33□□□□□ -2.2
Col4a3Q9QZS0 Gm21518-202ENSMUST00000186938 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.33□□□□□ -2.2
Col4a3Q9QZS0 Gm20855-202ENSMUST00000186996 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.33□□□□□ -2.2
Col4a3Q9QZS0 Gm20911-201ENSMUST00000187135 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.33□□□□□ -2.2
Col4a3Q9QZS0 Gm28102-201ENSMUST00000187146 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.33□□□□□ -2.2
Col4a3Q9QZS0 Gm28827-201ENSMUST00000187165 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.33□□□□□ -2.2
Col4a3Q9QZS0 Gm20931-202ENSMUST00000187293 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.33□□□□□ -2.2
Col4a3Q9QZS0 Gm21760-202ENSMUST00000187433 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.33□□□□□ -2.2
Col4a3Q9QZS0 Gm20920-201ENSMUST00000187477 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.33□□□□□ -2.2
Col4a3Q9QZS0 Gm21627-201ENSMUST00000187768 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.33□□□□□ -2.2
Col4a3Q9QZS0 Gm20850-201ENSMUST00000188672 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.33□□□□□ -2.2
Col4a3Q9QZS0 Gm21488-201ENSMUST00000188744 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.33□□□□□ -2.2
Col4a3Q9QZS0 Gm20820-201ENSMUST00000188754 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.33□□□□□ -2.2
Col4a3Q9QZS0 Gm20894-201ENSMUST00000188864 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.33□□□□□ -2.2
Col4a3Q9QZS0 Gm20869-201ENSMUST00000188958 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.33□□□□□ -2.2
Col4a3Q9QZS0 Gm21173-201ENSMUST00000189238 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.33□□□□□ -2.2
Col4a3Q9QZS0 Gm20870-201ENSMUST00000189315 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.33□□□□□ -2.2
Col4a3Q9QZS0 Gm20903-201ENSMUST00000189346 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.33□□□□□ -2.2
Col4a3Q9QZS0 Gm21209-202ENSMUST00000189354 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.33□□□□□ -2.2
Col4a3Q9QZS0 Gm20937-203ENSMUST00000189422 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.33□□□□□ -2.2
Col4a3Q9QZS0 Gm20890-201ENSMUST00000189518 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.33□□□□□ -2.2
Col4a3Q9QZS0 Gm21477-202ENSMUST00000189543 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.33□□□□□ -2.2
Col4a3Q9QZS0 Gm29110-201ENSMUST00000189924 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.33□□□□□ -2.2
Col4a3Q9QZS0 Gm20814-201ENSMUST00000190173 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.33□□□□□ -2.2
Col4a3Q9QZS0 Gm29573-201ENSMUST00000190291 919 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
Col4a3Q9QZS0 Sly-202ENSMUST00000190292 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.33□□□□□ -2.2
Col4a3Q9QZS0 Gm21650-202ENSMUST00000190551 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.33□□□□□ -2.2
Col4a3Q9QZS0 Gm20905-201ENSMUST00000190782 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.33□□□□□ -2.2
Col4a3Q9QZS0 Gm20817-201ENSMUST00000191123 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.33□□□□□ -2.2
Col4a3Q9QZS0 Gm20843-202ENSMUST00000191305 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.33□□□□□ -2.2
Col4a3Q9QZS0 Gm21258-202ENSMUST00000191553 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.33□□□□□ -2.2
Col4a3Q9QZS0 Gm29866-201ENSMUST00000191675 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.33□□□□□ -2.2
Col4a3Q9QZS0 Gm31571-201ENSMUST00000192521 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.33□□□□□ -2.2
Col4a3Q9QZS0 Gm21366-201ENSMUST00000192892 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.33□□□□□ -2.2
Col4a3Q9QZS0 Gm37979-201ENSMUST00000193065 712 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
Col4a3Q9QZS0 Gm29740-201ENSMUST00000193182 655 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
Col4a3Q9QZS0 Gm9632-201ENSMUST00000195934 643 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
Col4a3Q9QZS0 Igkv1-108-201ENSMUST00000198926 298 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
Col4a3Q9QZS0 Gm43865-201ENSMUST00000204721 127 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
Col4a3Q9QZS0 Sult3a1-202ENSMUST00000218204 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.33□□□□□ -2.2
Col4a3Q9QZS0 Sult3a1-201ENSMUST00000092597 1047 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.33□□□□□ -2.2
Col4a3Q9QZS0 Olfr790-202ENSMUST00000203966 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.33□□□□□ -2.2
Col4a3Q9QZS0 Mir599-201ENSMUST00000102378 88 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
Col4a3Q9QZS0 Gm25495-201ENSMUST00000104431 131 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
Col4a3Q9QZS0 Gm14409-201ENSMUST00000108963 1050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.32□□□□□ -2.2
Col4a3Q9QZS0 Gm11252-201ENSMUST00000120572 939 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
Col4a3Q9QZS0 Gm12155-201ENSMUST00000121267 160 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
Col4a3Q9QZS0 Gm14840-201ENSMUST00000122135 594 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
Col4a3Q9QZS0 Gm22957-201ENSMUST00000122511 123 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
Col4a3Q9QZS0 Gm24632-201ENSMUST00000122770 323 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
Col4a3Q9QZS0 Gm22603-201ENSMUST00000157603 96 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
Col4a3Q9QZS0 Gm24348-201ENSMUST00000158710 130 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
Col4a3Q9QZS0 Snora24-201ENSMUST00000174989 130 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 90.9 ms