Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUK3

Cln8, Protein CLN8, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cln8Q9QUK3 Gm3852-201ENSMUST00000182781 264 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
Cln8Q9QUK3 Gm10193-201ENSMUST00000188288 231 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
Cln8Q9QUK3 Gm28437-201ENSMUST00000190277 783 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
Cln8Q9QUK3 Gm18296-201ENSMUST00000192475 783 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
Cln8Q9QUK3 Gm29950-201ENSMUST00000195273 237 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
Cln8Q9QUK3 B230207O21Rik-201ENSMUST00000198634 321 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
Cln8Q9QUK3 Gm43600-201ENSMUST00000202134 223 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
Cln8Q9QUK3 Gm44472-201ENSMUST00000204922 943 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
Cln8Q9QUK3 Olfr505-ps1-201ENSMUST00000207626 976 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
Cln8Q9QUK3 Gm45445-201ENSMUST00000209586 232 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
Cln8Q9QUK3 Gm45366-201ENSMUST00000209828 384 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
Cln8Q9QUK3 Gm45772-201ENSMUST00000212961 240 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
Cln8Q9QUK3 Rpl26-ps1-201ENSMUST00000213139 426 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
Cln8Q9QUK3 Olfr941-ps1-201ENSMUST00000215258 935 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
Cln8Q9QUK3 AC120394.1-201ENSMUST00000217153 351 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
Cln8Q9QUK3 AC167192.1-201ENSMUST00000225908 139 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
Cln8Q9QUK3 AC154262.1-201ENSMUST00000225976 286 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
Cln8Q9QUK3 Gm24268-201ENSMUST00000082990 110 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
Cln8Q9QUK3 Gm26494-201ENSMUST00000083154 143 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
Cln8Q9QUK3 Gm25411-201ENSMUST00000083760 151 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
Cln8Q9QUK3 Gm24493-201ENSMUST00000083805 143 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
Cln8Q9QUK3 Csn1s2b-202ENSMUST00000101057 1668 ntTSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
Cln8Q9QUK3 Vmn1r69-201ENSMUST00000163658 2558 ntAPPRIS P2 BASIC2.2□□□□□ -2.06
Cln8Q9QUK3 Ogn-201ENSMUST00000021822 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
Cln8Q9QUK3 1700006A11Rik-201ENSMUST00000029598 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
Cln8Q9QUK3 Gm7145-201ENSMUST00000185381 1794 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.19□□□□□ -2.06
Cln8Q9QUK3 Gm42659-201ENSMUST00000196955 1754 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
Cln8Q9QUK3 Gm24122-201ENSMUST00000104107 132 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
Cln8Q9QUK3 Gm25507-201ENSMUST00000116981 144 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
Cln8Q9QUK3 Gm14579-201ENSMUST00000117068 283 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
Cln8Q9QUK3 Gm14918-201ENSMUST00000118153 268 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
Cln8Q9QUK3 Gm14020-201ENSMUST00000118165 662 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
Cln8Q9QUK3 Gm15936-201ENSMUST00000118706 460 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
Cln8Q9QUK3 Gm13804-201ENSMUST00000119552 172 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
Cln8Q9QUK3 Gm14049-201ENSMUST00000121009 636 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
Cln8Q9QUK3 Gm12368-201ENSMUST00000122251 434 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
Cln8Q9QUK3 Gm22560-201ENSMUST00000157332 120 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
Cln8Q9QUK3 Gm8207-201ENSMUST00000171204 502 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
Cln8Q9QUK3 Mir3076-201ENSMUST00000175415 60 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
Cln8Q9QUK3 1700010I02Rik-202ENSMUST00000188525 430 ntTSL 3 BASIC2.19□□□□□ -2.06
Cln8Q9QUK3 Smr3a-202ENSMUST00000189633 467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
Cln8Q9QUK3 Gm37869-201ENSMUST00000193385 595 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
Cln8Q9QUK3 Gm8041-201ENSMUST00000199755 616 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
Cln8Q9QUK3 Gm44410-201ENSMUST00000203151 341 ntTSL 3 BASIC2.19□□□□□ -2.06
Cln8Q9QUK3 Gm44041-201ENSMUST00000203678 396 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
Cln8Q9QUK3 Gm44923-201ENSMUST00000206673 85 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
Cln8Q9QUK3 Gm32531-201ENSMUST00000209324 373 ntTSL 3 BASIC2.19□□□□□ -2.06
Cln8Q9QUK3 AL772265.1-201ENSMUST00000214379 305 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
Cln8Q9QUK3 CT009713.6-201ENSMUST00000223615 294 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
Cln8Q9QUK3 Gm24948-201ENSMUST00000082866 207 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
Cln8Q9QUK3 Olfr814-202ENSMUST00000213742 3798 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
Cln8Q9QUK3 Acer3-202ENSMUST00000120520 3964 ntTSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
Cln8Q9QUK3 Gm38071-201ENSMUST00000195792 3378 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
Cln8Q9QUK3 Olfr110-201ENSMUST00000168318 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.18□□□□□ -2.06
Cln8Q9QUK3 Gm45257-201ENSMUST00000210301 3998 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
Cln8Q9QUK3 AC123052.1-201ENSMUST00000220604 4616 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
Cln8Q9QUK3 Gm26154-201ENSMUST00000102339 96 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
Cln8Q9QUK3 Mir450-2-201ENSMUST00000102444 69 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
Cln8Q9QUK3 Gm26147-201ENSMUST00000104479 114 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
Cln8Q9QUK3 Gm13756-201ENSMUST00000117618 222 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
Cln8Q9QUK3 AA413626-201ENSMUST00000121125 494 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
Cln8Q9QUK3 Gm9225-201ENSMUST00000121921 836 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
Cln8Q9QUK3 Gm13368-201ENSMUST00000122443 430 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
Cln8Q9QUK3 Gm23981-201ENSMUST00000157136 106 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
Cln8Q9QUK3 Gm25220-201ENSMUST00000157546 95 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
Cln8Q9QUK3 Gm22534-201ENSMUST00000158173 104 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
Cln8Q9QUK3 Gm22611-201ENSMUST00000158288 150 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
Cln8Q9QUK3 Gm27869-201ENSMUST00000184327 122 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
Cln8Q9QUK3 Gm27919-201ENSMUST00000185163 107 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
Cln8Q9QUK3 Gm21673-201ENSMUST00000186640 436 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
Cln8Q9QUK3 Rpl23a-ps9-201ENSMUST00000188369 463 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
Cln8Q9QUK3 Gm21135-201ENSMUST00000189023 436 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
Cln8Q9QUK3 Rpl23a-ps11-201ENSMUST00000191583 463 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
Cln8Q9QUK3 Gm37228-201ENSMUST00000193574 331 ntTSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
Cln8Q9QUK3 Gm37029-201ENSMUST00000195773 239 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
Cln8Q9QUK3 Gm42578-201ENSMUST00000199960 194 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
Cln8Q9QUK3 Olfr278-ps1-201ENSMUST00000205676 238 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
Cln8Q9QUK3 Gm44754-201ENSMUST00000208155 400 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
Cln8Q9QUK3 Gm8031-201ENSMUST00000213430 626 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
Cln8Q9QUK3 Gm7692-201ENSMUST00000213534 409 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
Cln8Q9QUK3 Prl2c5-201ENSMUST00000021778 844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
Cln8Q9QUK3 AC117202.3-201ENSMUST00000228532 310 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
Cln8Q9QUK3 Sult2a6-201ENSMUST00000076576 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
Cln8Q9QUK3 Gm22229-201ENSMUST00000082987 108 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
Cln8Q9QUK3 AW554918-203ENSMUST00000100131 1684 ntTSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
Cln8Q9QUK3 Gm32014-202ENSMUST00000215328 4168 ntTSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
Cln8Q9QUK3 Ccdc7b-201ENSMUST00000026912 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
Cln8Q9QUK3 Olfr902-202ENSMUST00000213105 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
Cln8Q9QUK3 Olfr218-202ENSMUST00000215844 3410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
Cln8Q9QUK3 Mir1195-201ENSMUST00000116818 98 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
Cln8Q9QUK3 Olfr1144-ps1-201ENSMUST00000118227 328 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
Cln8Q9QUK3 Gm12006-201ENSMUST00000120786 403 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
Cln8Q9QUK3 Gm14766-201ENSMUST00000121689 367 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
Cln8Q9QUK3 Serf1-202ENSMUST00000129014 543 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.17□□□□□ -2.06
Cln8Q9QUK3 Gm26275-201ENSMUST00000157101 268 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
Cln8Q9QUK3 Gm25624-201ENSMUST00000157222 275 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
Cln8Q9QUK3 Gm24438-201ENSMUST00000157893 115 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
Cln8Q9QUK3 Gm25866-201ENSMUST00000158245 112 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
Cln8Q9QUK3 Gm16311-201ENSMUST00000161939 702 ntTSL 3 BASIC2.17□□□□□ -2.06
Cln8Q9QUK3 Gm8292-201ENSMUST00000162574 396 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
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