Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

Predictions only

Length 491 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 Gm23510-201ENSMUST00000083083 163 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
Rabgef1Q9JM13 2410024N13Rik-201ENSMUST00000090704 669 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
Rabgef1Q9JM13 Fam135a-206ENSMUST00000187369 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
Rabgef1Q9JM13 Olfr1289-201ENSMUST00000120021 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
Rabgef1Q9JM13 Olfr38-202ENSMUST00000215796 2782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
Rabgef1Q9JM13 Gm7145-201ENSMUST00000185381 1794 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.35□□□□□ -1.71
Rabgef1Q9JM13 B230334C09Rik-201ENSMUST00000200255 8927 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
Rabgef1Q9JM13 Olfr986-204ENSMUST00000218134 3487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.34□□□□□ -1.71
Rabgef1Q9JM13 Zfp458-201ENSMUST00000045969 3488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
Rabgef1Q9JM13 Vmn1r22-202ENSMUST00000227650 3674 ntAPPRIS P1 BASIC4.34□□□□□ -1.71
Rabgef1Q9JM13 Gm42547-201ENSMUST00000201159 3798 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
Rabgef1Q9JM13 Mir541-201ENSMUST00000102097 90 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
Rabgef1Q9JM13 Gm13541-201ENSMUST00000119519 283 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
Rabgef1Q9JM13 Olfr1234-203ENSMUST00000137692 3827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.34□□□□□ -1.71
Rabgef1Q9JM13 Gm23713-201ENSMUST00000157353 70 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
Rabgef1Q9JM13 Gm25425-201ENSMUST00000157611 96 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
Rabgef1Q9JM13 Gm22615-201ENSMUST00000158102 70 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
Rabgef1Q9JM13 Gm24001-201ENSMUST00000158463 85 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
Rabgef1Q9JM13 Gm25654-201ENSMUST00000158467 88 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
Rabgef1Q9JM13 Gm23053-201ENSMUST00000175136 96 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
Rabgef1Q9JM13 Rpl31-ps18-201ENSMUST00000180885 377 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
Rabgef1Q9JM13 Cox6b2-206ENSMUST00000182738 423 ntTSL 2 BASIC4.34□□□□□ -1.71
Rabgef1Q9JM13 Gm27421-201ENSMUST00000184729 167 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
Rabgef1Q9JM13 Gm28702-201ENSMUST00000188276 253 ntTSL 5 BASIC4.34□□□□□ -1.71
Rabgef1Q9JM13 Igkv13-71-1-201ENSMUST00000199934 264 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
Rabgef1Q9JM13 Mgst1-208ENSMUST00000204628 471 ntTSL 3 BASIC4.34□□□□□ -1.71
Rabgef1Q9JM13 Snord14d-201ENSMUST00000083424 86 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
Rabgef1Q9JM13 Mir133a-1-201ENSMUST00000083465 68 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
Rabgef1Q9JM13 Gm25651-201ENSMUST00000083782 119 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
Rabgef1Q9JM13 4931408C20Rik-201ENSMUST00000097801 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
Rabgef1Q9JM13 Olfr1205-202ENSMUST00000215929 6149 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.34□□□□□ -1.72
Rabgef1Q9JM13 Ecm2-201ENSMUST00000051504 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
Rabgef1Q9JM13 Vmn2r71-201ENSMUST00000172338 2568 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.33□□□□□ -1.72
Rabgef1Q9JM13 4930524B17Rik-201ENSMUST00000200755 1870 ntTSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
Rabgef1Q9JM13 Vmn1r77-203ENSMUST00000227320 8308 ntAPPRIS P2 BASIC4.33□□□□□ -1.72
Rabgef1Q9JM13 Gm13504-201ENSMUST00000117490 316 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
Rabgef1Q9JM13 Gm15926-201ENSMUST00000120492 550 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
Rabgef1Q9JM13 Gm23960-201ENSMUST00000157206 131 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
Rabgef1Q9JM13 Gm25392-201ENSMUST00000157335 297 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
Rabgef1Q9JM13 Gm25390-201ENSMUST00000157341 103 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
Rabgef1Q9JM13 Gm24745-201ENSMUST00000157840 85 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
Rabgef1Q9JM13 Gm28543-201ENSMUST00000188986 509 ntTSL 5 BASIC4.33□□□□□ -1.72
Rabgef1Q9JM13 Gm19123-201ENSMUST00000190716 651 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
Rabgef1Q9JM13 Gm19244-201ENSMUST00000204340 253 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
Rabgef1Q9JM13 Gm45392-201ENSMUST00000210441 214 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
Rabgef1Q9JM13 Rps24-205ENSMUST00000223999 525 ntAPPRIS ALT1 BASIC4.33□□□□□ -1.72
Rabgef1Q9JM13 AC155167.3-201ENSMUST00000226349 217 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
Rabgef1Q9JM13 AC165106.2-201ENSMUST00000226749 97 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
Rabgef1Q9JM13 Gm22744-201ENSMUST00000083444 65 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
Rabgef1Q9JM13 Olfr1150-ps1-201ENSMUST00000121186 3311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.33□□□□□ -1.72
Rabgef1Q9JM13 Gm27162-201ENSMUST00000185169 2478 ntTSL 2 BASIC4.33□□□□□ -1.72
Rabgef1Q9JM13 AC140397.1-201ENSMUST00000225563 4562 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
Rabgef1Q9JM13 Ccr1-201ENSMUST00000026911 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
Rabgef1Q9JM13 Gm43404-201ENSMUST00000200424 2534 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
Rabgef1Q9JM13 Ntrk3-201ENSMUST00000039431 19703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
Rabgef1Q9JM13 Gm26387-201ENSMUST00000104238 132 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
Rabgef1Q9JM13 Gm22145-201ENSMUST00000157396 148 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
Rabgef1Q9JM13 Gm24961-201ENSMUST00000157918 184 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
Rabgef1Q9JM13 Gm24799-201ENSMUST00000178431 79 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
Rabgef1Q9JM13 Gm27585-201ENSMUST00000183717 199 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
Rabgef1Q9JM13 Mir6938-201ENSMUST00000184173 63 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
Rabgef1Q9JM13 Gm6802-202ENSMUST00000186566 126 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
Rabgef1Q9JM13 Gm8013-201ENSMUST00000200139 462 ntTSL 2 BASIC4.32□□□□□ -1.72
Rabgef1Q9JM13 Calml4-203ENSMUST00000213643 710 ntTSL 2 BASIC4.32□□□□□ -1.72
Rabgef1Q9JM13 AC155712.1-201ENSMUST00000219704 160 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
Rabgef1Q9JM13 Olfr128-202ENSMUST00000216440 3644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.32□□□□□ -1.72
Rabgef1Q9JM13 Gm37742-201ENSMUST00000193263 3979 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
Rabgef1Q9JM13 Olfr110-201ENSMUST00000168318 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.32□□□□□ -1.72
Rabgef1Q9JM13 Gm37645-201ENSMUST00000194285 3556 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
Rabgef1Q9JM13 Mga-204ENSMUST00000110774 13931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.31□□□□□ -1.72
Rabgef1Q9JM13 Cd86-201ENSMUST00000089620 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
Rabgef1Q9JM13 Olfr826-203ENSMUST00000216661 2858 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.31□□□□□ -1.72
Rabgef1Q9JM13 Igkv17-121-201ENSMUST00000103315 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.31□□□□□ -1.72
Rabgef1Q9JM13 Gm22784-201ENSMUST00000104088 132 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
Rabgef1Q9JM13 Rps27-ps1-201ENSMUST00000118179 246 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
Rabgef1Q9JM13 Gm12417-201ENSMUST00000119153 403 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
Rabgef1Q9JM13 Gm12071-201ENSMUST00000121968 469 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
Rabgef1Q9JM13 Gm14629-201ENSMUST00000122428 144 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
Rabgef1Q9JM13 Gm22204-201ENSMUST00000122654 327 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
Rabgef1Q9JM13 Chrna1os-201ENSMUST00000125413 680 ntTSL 3 BASIC4.31□□□□□ -1.72
Rabgef1Q9JM13 Gm12708-201ENSMUST00000126143 349 ntTSL 5 BASIC4.31□□□□□ -1.72
Rabgef1Q9JM13 Gm13853-201ENSMUST00000155496 557 ntTSL 3 BASIC4.31□□□□□ -1.72
Rabgef1Q9JM13 Gm22036-201ENSMUST00000157279 215 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
Rabgef1Q9JM13 Gm25720-201ENSMUST00000157503 105 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
Rabgef1Q9JM13 Gm26171-201ENSMUST00000158422 131 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
Rabgef1Q9JM13 Gm17133-201ENSMUST00000170636 289 ntTSL 3 BASIC4.31□□□□□ -1.72
Rabgef1Q9JM13 Rpl31-ps24-201ENSMUST00000181350 379 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
Rabgef1Q9JM13 Gm28453-203ENSMUST00000187041 189 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
Rabgef1Q9JM13 1700010N08Rik-201ENSMUST00000187456 189 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
Rabgef1Q9JM13 Gm37923-201ENSMUST00000191624 161 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
Rabgef1Q9JM13 Mir376a-201ENSMUST00000197584 68 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
Rabgef1Q9JM13 Gm44520-201ENSMUST00000205447 802 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
Rabgef1Q9JM13 Gm44533-201ENSMUST00000207782 268 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
Rabgef1Q9JM13 AC159709.1-201ENSMUST00000220445 349 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
Rabgef1Q9JM13 AC174459.2-201ENSMUST00000226036 160 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
Rabgef1Q9JM13 AL731706.1-202ENSMUST00000226652 180 ntAPPRIS P5 BASIC4.31□□□□□ -1.72
Rabgef1Q9JM13 AC164100.1-201ENSMUST00000227214 508 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
Rabgef1Q9JM13 Gm25930-201ENSMUST00000082785 107 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
Rabgef1Q9JM13 Nbeal1-203ENSMUST00000160834 15731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.31□□□□□ -1.72
Rabgef1Q9JM13 Ogn-201ENSMUST00000021822 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
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