Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0L1

Zbed3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed3Q9D0L1 Rpl30-ps11-201ENSMUST00000119630 345 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Zbed3Q9D0L1 Gm14629-201ENSMUST00000122428 144 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Zbed3Q9D0L1 Gm25910-201ENSMUST00000157620 140 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Zbed3Q9D0L1 Gm17377-201ENSMUST00000165184 207 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Zbed3Q9D0L1 Gm17521-201ENSMUST00000165345 468 ntAPPRIS P1 BASIC2.58□□□□□ -2
Zbed3Q9D0L1 Vmn1r-ps24-201ENSMUST00000175772 900 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Zbed3Q9D0L1 Gm25175-201ENSMUST00000178712 79 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Zbed3Q9D0L1 Mir7667-201ENSMUST00000183866 63 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Zbed3Q9D0L1 Mir6997-201ENSMUST00000184313 71 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Zbed3Q9D0L1 Gm28825-201ENSMUST00000186233 238 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Zbed3Q9D0L1 Gm28956-201ENSMUST00000189047 427 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Zbed3Q9D0L1 Gm32250-201ENSMUST00000191885 322 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
Zbed3Q9D0L1 Igkv11-114-201ENSMUST00000200013 346 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Zbed3Q9D0L1 Gm44083-201ENSMUST00000203114 337 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Zbed3Q9D0L1 CT025606.1-201ENSMUST00000218273 324 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Zbed3Q9D0L1 Gm35732-201ENSMUST00000221737 356 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
Zbed3Q9D0L1 AC124104.1-201ENSMUST00000226279 417 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Zbed3Q9D0L1 AC134335.1-201ENSMUST00000227626 329 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Zbed3Q9D0L1 Gm22247-201ENSMUST00000082476 131 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Zbed3Q9D0L1 Gm23950-201ENSMUST00000104026 129 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Zbed3Q9D0L1 Gm11065-201ENSMUST00000111462 228 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Zbed3Q9D0L1 Gm14579-201ENSMUST00000117068 283 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Zbed3Q9D0L1 Gm23980-201ENSMUST00000157135 158 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Zbed3Q9D0L1 Gm22098-201ENSMUST00000157930 85 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Zbed3Q9D0L1 Gm21746-201ENSMUST00000177612 543 ntAPPRIS P1 BASIC2.57□□□□□ -2
Zbed3Q9D0L1 Gm24897-201ENSMUST00000179033 107 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Zbed3Q9D0L1 Gm28000-201ENSMUST00000184380 85 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Zbed3Q9D0L1 Mir8090-201ENSMUST00000185078 136 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Zbed3Q9D0L1 Gm5329-201ENSMUST00000186898 463 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Zbed3Q9D0L1 Gm43669-201ENSMUST00000198229 436 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Zbed3Q9D0L1 Gm43804-201ENSMUST00000198280 456 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Zbed3Q9D0L1 Gm18691-201ENSMUST00000203593 872 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Zbed3Q9D0L1 AC159475.1-201ENSMUST00000216752 411 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
Zbed3Q9D0L1 CT025619.4-201ENSMUST00000217362 350 ntTSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
Zbed3Q9D0L1 Gm7065-201ENSMUST00000222150 474 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Zbed3Q9D0L1 Gm10298-201ENSMUST00000074801 265 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Zbed3Q9D0L1 Mir19a-201ENSMUST00000083482 82 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Zbed3Q9D0L1 Mir125b-2-201ENSMUST00000083538 71 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Zbed3Q9D0L1 9230113P08Rik-201ENSMUST00000176049 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
Zbed3Q9D0L1 Zfp936-201ENSMUST00000072829 1368 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
Zbed3Q9D0L1 Olfr801-203ENSMUST00000213294 4045 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
Zbed3Q9D0L1 Tlr8-202ENSMUST00000112170 3431 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
Zbed3Q9D0L1 Olfr1442-202ENSMUST00000207341 3126 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
Zbed3Q9D0L1 Gm8978-201ENSMUST00000124230 2224 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
Zbed3Q9D0L1 Gm23118-201ENSMUST00000122657 187 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Zbed3Q9D0L1 n-R5s159-201ENSMUST00000122681 120 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Zbed3Q9D0L1 n-R5s191-201ENSMUST00000122724 116 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Zbed3Q9D0L1 Gm16355-201ENSMUST00000128606 231 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Zbed3Q9D0L1 Gm15718-201ENSMUST00000131085 311 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
Zbed3Q9D0L1 Gm13976-201ENSMUST00000154367 479 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
Zbed3Q9D0L1 Gm22554-201ENSMUST00000157798 147 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Zbed3Q9D0L1 Obox4-ps39-201ENSMUST00000184306 628 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Zbed3Q9D0L1 Mir7026-201ENSMUST00000184384 67 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Zbed3Q9D0L1 Ttn-225ENSMUST00000190813 300 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
Zbed3Q9D0L1 Gm20915-201ENSMUST00000191575 663 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Zbed3Q9D0L1 Gm38154-201ENSMUST00000195444 340 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Zbed3Q9D0L1 Gm37029-201ENSMUST00000195773 239 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Zbed3Q9D0L1 Gm43007-201ENSMUST00000197618 291 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Zbed3Q9D0L1 Gm37797-201ENSMUST00000212114 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
Zbed3Q9D0L1 Olfr1059-ps1-201ENSMUST00000215214 586 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Zbed3Q9D0L1 Gm35190-201ENSMUST00000222335 526 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
Zbed3Q9D0L1 AC123656.2-201ENSMUST00000226726 227 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Zbed3Q9D0L1 AC122341.1-201ENSMUST00000227291 560 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Zbed3Q9D0L1 Olfr1461-201ENSMUST00000053772 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.56□□□□□ -2
Zbed3Q9D0L1 Gm22866-201ENSMUST00000083947 177 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Zbed3Q9D0L1 Gm23951-201ENSMUST00000104029 132 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Zbed3Q9D0L1 Gm25317-201ENSMUST00000116824 129 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Zbed3Q9D0L1 Gm13602-201ENSMUST00000122405 493 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Zbed3Q9D0L1 Gm13661-201ENSMUST00000154297 318 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
Zbed3Q9D0L1 Gm24784-201ENSMUST00000157640 62 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Zbed3Q9D0L1 Gm17062-201ENSMUST00000166987 461 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Zbed3Q9D0L1 Mir6406-201ENSMUST00000183592 120 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Zbed3Q9D0L1 Gm43753-201ENSMUST00000196539 3309 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Zbed3Q9D0L1 Gm19089-201ENSMUST00000197207 613 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Zbed3Q9D0L1 Gm43373-201ENSMUST00000202552 2870 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Zbed3Q9D0L1 Olfr1102-202ENSMUST00000214002 1806 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
Zbed3Q9D0L1 Olfr937-202ENSMUST00000215049 2259 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
Zbed3Q9D0L1 C030006N10Rik-201ENSMUST00000219077 517 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Zbed3Q9D0L1 AC159632.1-201ENSMUST00000221808 317 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
Zbed3Q9D0L1 Gm18795-201ENSMUST00000222371 3266 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
Zbed3Q9D0L1 AC183092.2-201ENSMUST00000225542 1153 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Zbed3Q9D0L1 CT025525.2-201ENSMUST00000227743 423 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Zbed3Q9D0L1 AC115735.3-201ENSMUST00000227757 513 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Zbed3Q9D0L1 Vmn2r72-201ENSMUST00000063425 2571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
Zbed3Q9D0L1 Mir222-201ENSMUST00000083537 79 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Zbed3Q9D0L1 Gm23516-201ENSMUST00000093728 107 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Zbed3Q9D0L1 AL645643.1-201ENSMUST00000222438 3897 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Zbed3Q9D0L1 Zfy2-201ENSMUST00000115891 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
Zbed3Q9D0L1 Vmn1r29-204ENSMUST00000228038 4520 ntAPPRIS P1 BASIC2.54□□□□□ -2
Zbed3Q9D0L1 Olfr1309-205ENSMUST00000216948 5168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
Zbed3Q9D0L1 Gm13876-201ENSMUST00000118451 261 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Zbed3Q9D0L1 Gm23885-201ENSMUST00000122682 294 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Zbed3Q9D0L1 Gm14211-201ENSMUST00000152250 408 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
Zbed3Q9D0L1 Gm25961-201ENSMUST00000157174 135 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Zbed3Q9D0L1 Gm26414-201ENSMUST00000157674 269 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Zbed3Q9D0L1 Vmn1r77-201ENSMUST00000164446 921 ntAPPRIS P2 BASIC2.54□□□□□ -2
Zbed3Q9D0L1 Gm25156-201ENSMUST00000179809 79 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Zbed3Q9D0L1 Gm43512-201ENSMUST00000198495 176 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Zbed3Q9D0L1 AC091260.1-201ENSMUST00000216112 229 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Zbed3Q9D0L1 4930567K20Rik-203ENSMUST00000220108 646 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
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