Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSU0

Rprd1b, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd1bQ9CSU0 Gm32175-201ENSMUST00000193641 346 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
Rprd1bQ9CSU0 Gm30275-202ENSMUST00000198124 416 ntTSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.11
Rprd1bQ9CSU0 D030025E07Rik-205ENSMUST00000198478 418 ntTSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.11
Rprd1bQ9CSU0 Snord43-201ENSMUST00000199549 108 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
Rprd1bQ9CSU0 AC155839.1-201ENSMUST00000200105 147 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
Rprd1bQ9CSU0 Gm42739-201ENSMUST00000200687 226 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
Rprd1bQ9CSU0 Gm43026-201ENSMUST00000202972 325 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
Rprd1bQ9CSU0 Gm45754-201ENSMUST00000212380 279 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
Rprd1bQ9CSU0 Olfr941-ps1-201ENSMUST00000215258 935 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
Rprd1bQ9CSU0 A430103D13Rik-201ENSMUST00000220077 857 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
Rprd1bQ9CSU0 AC123533.1-201ENSMUST00000227782 446 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
Rprd1bQ9CSU0 Gm23246-201ENSMUST00000083371 67 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
Rprd1bQ9CSU0 Mir222-201ENSMUST00000083537 79 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
Rprd1bQ9CSU0 Gm10192-201ENSMUST00000086672 327 ntAPPRIS P1 BASIC1.84□□□□□ -2.11
Rprd1bQ9CSU0 Olfr606-203ENSMUST00000217250 2313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.84□□□□□ -2.12
Rprd1bQ9CSU0 Olfr1013-202ENSMUST00000216397 4925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.84□□□□□ -2.12
Rprd1bQ9CSU0 AC122828.3-201ENSMUST00000223019 3915 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
Rprd1bQ9CSU0 Gm14879-201ENSMUST00000117308 507 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
Rprd1bQ9CSU0 Dnaic1-202ENSMUST00000119127 500 ntTSL 1 (best) BASIC1.83□□□□□ -2.12
Rprd1bQ9CSU0 Gm15718-201ENSMUST00000131085 311 ntTSL 3 BASIC1.83□□□□□ -2.12
Rprd1bQ9CSU0 Gm15656-201ENSMUST00000132076 615 ntTSL 3 BASIC1.83□□□□□ -2.12
Rprd1bQ9CSU0 Gm23332-201ENSMUST00000157424 275 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
Rprd1bQ9CSU0 Gm25863-201ENSMUST00000158249 329 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
Rprd1bQ9CSU0 Gm23342-201ENSMUST00000158958 115 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
Rprd1bQ9CSU0 Vmn2r-ps126-201ENSMUST00000176711 1149 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
Rprd1bQ9CSU0 Rpl23a-ps12-201ENSMUST00000179178 468 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
Rprd1bQ9CSU0 Mir7016-201ENSMUST00000184308 72 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
Rprd1bQ9CSU0 Gm23370-202ENSMUST00000197008 129 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
Rprd1bQ9CSU0 Gm44212-201ENSMUST00000205016 897 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
Rprd1bQ9CSU0 Gm19709-201ENSMUST00000215403 482 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
Rprd1bQ9CSU0 Tas2r114-201ENSMUST00000080619 930 ntAPPRIS P1 BASIC1.83□□□□□ -2.12
Rprd1bQ9CSU0 Gm24610-201ENSMUST00000083270 109 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
Rprd1bQ9CSU0 Gm10234-201ENSMUST00000089304 60 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.83□□□□□ -2.12
Rprd1bQ9CSU0 Vmn1r29-202ENSMUST00000226971 4714 ntAPPRIS P1 BASIC1.83□□□□□ -2.12
Rprd1bQ9CSU0 Vmn1r67-202ENSMUST00000226237 2352 ntAPPRIS ALT2 BASIC1.83□□□□□ -2.12
Rprd1bQ9CSU0 Olfr1029-202ENSMUST00000217244 3743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.82□□□□□ -2.12
Rprd1bQ9CSU0 Gm11065-201ENSMUST00000111462 228 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
Rprd1bQ9CSU0 Gm15110-201ENSMUST00000117545 881 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
Rprd1bQ9CSU0 Gm11219-201ENSMUST00000118565 358 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
Rprd1bQ9CSU0 Gm7592-201ENSMUST00000160674 627 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
Rprd1bQ9CSU0 Gm6660-201ENSMUST00000179149 468 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
Rprd1bQ9CSU0 Gm26864-201ENSMUST00000181346 156 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
Rprd1bQ9CSU0 Gm27399-201ENSMUST00000184250 78 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
Rprd1bQ9CSU0 Scgb3a2-203ENSMUST00000189750 578 ntTSL 1 (best) BASIC1.82□□□□□ -2.12
Rprd1bQ9CSU0 Gm38044-201ENSMUST00000192964 487 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
Rprd1bQ9CSU0 Gm42647-201ENSMUST00000195939 459 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
Rprd1bQ9CSU0 Gm43587-201ENSMUST00000199590 204 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
Rprd1bQ9CSU0 Gm45387-201ENSMUST00000209792 632 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
Rprd1bQ9CSU0 AC111044.1-201ENSMUST00000220206 555 ntTSL 5 BASIC1.82□□□□□ -2.12
Rprd1bQ9CSU0 AC120540.2-201ENSMUST00000221716 387 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
Rprd1bQ9CSU0 1700030L22Rik-202ENSMUST00000222223 704 ntTSL 1 (best) BASIC1.82□□□□□ -2.12
Rprd1bQ9CSU0 Klra7-201ENSMUST00000032286 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.82□□□□□ -2.12
Rprd1bQ9CSU0 Gm7984-201ENSMUST00000060640 538 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
Rprd1bQ9CSU0 Gm22061-201ENSMUST00000082557 107 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
Rprd1bQ9CSU0 Trdn-201ENSMUST00000095762 4514 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.81□□□□□ -2.12
Rprd1bQ9CSU0 Gm25168-201ENSMUST00000104189 132 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
Rprd1bQ9CSU0 Mir873a-201ENSMUST00000104863 77 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
Rprd1bQ9CSU0 Gm12935-201ENSMUST00000119352 246 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
Rprd1bQ9CSU0 Gm13502-201ENSMUST00000121574 684 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
Rprd1bQ9CSU0 Gm15986-201ENSMUST00000122153 400 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
Rprd1bQ9CSU0 Gm12956-201ENSMUST00000122184 414 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
Rprd1bQ9CSU0 Rpl30-206ENSMUST00000142643 505 ntTSL 2 BASIC1.81□□□□□ -2.12
Rprd1bQ9CSU0 Gm22764-201ENSMUST00000158370 92 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
Rprd1bQ9CSU0 Mir6379-201ENSMUST00000183392 115 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
Rprd1bQ9CSU0 Gm27235-201ENSMUST00000184431 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.81□□□□□ -2.12
Rprd1bQ9CSU0 Gm29600-201ENSMUST00000188687 377 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
Rprd1bQ9CSU0 B230110G15Rik-201ENSMUST00000190868 772 ntTSL 1 (best) BASIC1.81□□□□□ -2.12
Rprd1bQ9CSU0 Gm43582-201ENSMUST00000196149 343 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
Rprd1bQ9CSU0 AC120540.1-201ENSMUST00000221879 324 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
Rprd1bQ9CSU0 Tslp-201ENSMUST00000025237 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.81□□□□□ -2.12
Rprd1bQ9CSU0 Gm10298-201ENSMUST00000074801 265 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
Rprd1bQ9CSU0 Mir151-201ENSMUST00000083678 68 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
Rprd1bQ9CSU0 Gm34240-201ENSMUST00000192500 1936 ntTSL 1 (best) BASIC1.81□□□□□ -2.12
Rprd1bQ9CSU0 Cypt15-201ENSMUST00000115114 519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.8□□□□□ -2.12
Rprd1bQ9CSU0 Mir1195-201ENSMUST00000116818 98 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
Rprd1bQ9CSU0 Gm12878-201ENSMUST00000118744 332 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
Rprd1bQ9CSU0 Gm24837-201ENSMUST00000158683 81 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
Rprd1bQ9CSU0 Gm25488-201ENSMUST00000158728 118 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
Rprd1bQ9CSU0 Gm16162-201ENSMUST00000162296 297 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
Rprd1bQ9CSU0 Gm18416-201ENSMUST00000175635 1003 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
Rprd1bQ9CSU0 Gm21797-201ENSMUST00000177579 543 ntAPPRIS P1 BASIC1.8□□□□□ -2.12
Rprd1bQ9CSU0 Gm21767-201ENSMUST00000178689 543 ntAPPRIS P1 BASIC1.8□□□□□ -2.12
Rprd1bQ9CSU0 Gm21822-201ENSMUST00000179302 543 ntAPPRIS P1 BASIC1.8□□□□□ -2.12
Rprd1bQ9CSU0 Mir6370-201ENSMUST00000183510 120 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
Rprd1bQ9CSU0 Obox4-ps2-201ENSMUST00000185088 442 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
Rprd1bQ9CSU0 Igkv13-57-2-201ENSMUST00000196590 336 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
Rprd1bQ9CSU0 Gm44825-201ENSMUST00000207557 150 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
Rprd1bQ9CSU0 Gm44598-201ENSMUST00000207566 150 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
Rprd1bQ9CSU0 Olfr499-ps1-201ENSMUST00000208811 930 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
Rprd1bQ9CSU0 Gm45240-201ENSMUST00000211437 674 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
Rprd1bQ9CSU0 Gm35732-201ENSMUST00000221737 356 ntTSL 3 BASIC1.8□□□□□ -2.12
Rprd1bQ9CSU0 AC137902.2-201ENSMUST00000227989 576 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
Rprd1bQ9CSU0 AC183096.2-201ENSMUST00000228733 457 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
Rprd1bQ9CSU0 S100a11-201ENSMUST00000029515 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.8□□□□□ -2.12
Rprd1bQ9CSU0 Snord14d-201ENSMUST00000083424 86 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
Rprd1bQ9CSU0 Gm26327-201ENSMUST00000093724 111 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
Rprd1bQ9CSU0 Gm16261-201ENSMUST00000096813 205 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
Rprd1bQ9CSU0 Olfr1253-204ENSMUST00000215988 6332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.8□□□□□ -2.12
Rprd1bQ9CSU0 Olfr1105-202ENSMUST00000215978 3012 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.8□□□□□ -2.12
Rprd1bQ9CSU0 Skint5-203ENSMUST00000170105 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.8□□□□□ -2.12
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