Protein–RNA interactions for Protein: Q6KCD5

Nipbl, Nipped-B-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NipblQ6KCD5 AC147560.1-201ENSMUST00000197528 107 ntBASIC0.65□□□□□ -2.3
NipblQ6KCD5 AC155927.1-201ENSMUST00000220114 1200 ntTSL 5 BASIC0.65□□□□□ -2.3
NipblQ6KCD5 Mir151-201ENSMUST00000083678 68 ntBASIC0.65□□□□□ -2.3
NipblQ6KCD5 Gm3867-202ENSMUST00000181639 2007 ntTSL 2 BASIC0.65□□□□□ -2.31
NipblQ6KCD5 Zfp37-202ENSMUST00000129511 1691 ntTSL 5 BASIC0.65□□□□□ -2.31
NipblQ6KCD5 Gm34240-201ENSMUST00000192500 1936 ntTSL 1 (best) BASIC0.65□□□□□ -2.31
NipblQ6KCD5 Btf3l4-202ENSMUST00000102740 624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.65□□□□□ -2.31
NipblQ6KCD5 n-R5s202-201ENSMUST00000104517 114 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
NipblQ6KCD5 Mup-ps1-201ENSMUST00000120720 544 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
NipblQ6KCD5 Vmn2r-ps70-201ENSMUST00000174636 302 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
NipblQ6KCD5 Mir5099-201ENSMUST00000175257 74 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
NipblQ6KCD5 Mup-ps8-201ENSMUST00000178663 545 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
NipblQ6KCD5 Mup-ps6-201ENSMUST00000179564 545 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
NipblQ6KCD5 AC121844.2-201ENSMUST00000219067 2066 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
NipblQ6KCD5 Olfr1140-203ENSMUST00000217572 1327 ntAPPRIS P1 BASIC0.65□□□□□ -2.31
NipblQ6KCD5 Cyp2j7-ps3-201ENSMUST00000121405 206 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
NipblQ6KCD5 Gm18416-201ENSMUST00000175635 1003 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
NipblQ6KCD5 Igkv20-101-2-201ENSMUST00000200406 339 ntAPPRIS P1 BASIC0.64□□□□□ -2.31
NipblQ6KCD5 AC147101.2-201ENSMUST00000219756 184 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
NipblQ6KCD5 Gm23735-201ENSMUST00000082551 134 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
NipblQ6KCD5 Olfr937-202ENSMUST00000215049 2259 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC0.64□□□□□ -2.31
NipblQ6KCD5 Gm11786-201ENSMUST00000120799 155 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
NipblQ6KCD5 Gm22026-201ENSMUST00000122735 281 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
NipblQ6KCD5 Gm27192-201ENSMUST00000136428 581 ntTSL 3 BASIC0.64□□□□□ -2.31
NipblQ6KCD5 Gm44845-201ENSMUST00000208773 335 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
NipblQ6KCD5 Gm45754-201ENSMUST00000212380 279 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
NipblQ6KCD5 AU041133-201ENSMUST00000105314 1494 ntTSL 5 BASIC0.64□□□□□ -2.31
NipblQ6KCD5 Gm13903-201ENSMUST00000120945 193 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
NipblQ6KCD5 Gm13483-201ENSMUST00000123699 664 ntTSL 1 (best) BASIC0.63□□□□□ -2.31
NipblQ6KCD5 Cdrt4os2-201ENSMUST00000128675 494 ntTSL 2 BASIC0.63□□□□□ -2.31
NipblQ6KCD5 Gm22036-201ENSMUST00000157279 215 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
NipblQ6KCD5 Mirlet7d-201ENSMUST00000083519 103 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
NipblQ6KCD5 Cylc1-201ENSMUST00000101282 1923 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC0.63□□□□□ -2.31
NipblQ6KCD5 Traj35-201ENSMUST00000103706 65 ntAPPRIS P1 BASIC0.63□□□□□ -2.31
NipblQ6KCD5 Gm6954-201ENSMUST00000117416 225 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
NipblQ6KCD5 Gm11891-201ENSMUST00000121241 619 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
NipblQ6KCD5 Gm12238-201ENSMUST00000127764 124 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
NipblQ6KCD5 Gm27511-201ENSMUST00000183502 127 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
NipblQ6KCD5 Igkv13-57-2-201ENSMUST00000196590 336 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
NipblQ6KCD5 Olfr428-ps1-201ENSMUST00000201135 466 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
NipblQ6KCD5 Gm43578-201ENSMUST00000201250 459 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
NipblQ6KCD5 Gm44909-201ENSMUST00000208756 165 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
NipblQ6KCD5 AC132954.1-201ENSMUST00000221017 342 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
NipblQ6KCD5 Olfr731-201ENSMUST00000059565 981 ntAPPRIS P1 BASIC0.63□□□□□ -2.31
NipblQ6KCD5 Olfr1048-201ENSMUST00000099900 963 ntAPPRIS P2 BASIC0.63□□□□□ -2.31
NipblQ6KCD5 Gm24865-201ENSMUST00000103246 96 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
NipblQ6KCD5 1700010K23Rik-201ENSMUST00000174502 376 ntTSL 1 (best) BASIC0.62□□□□□ -2.31
NipblQ6KCD5 Gm23190-201ENSMUST00000180307 64 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
NipblQ6KCD5 AC069074.1-201ENSMUST00000220048 381 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
NipblQ6KCD5 AC163357.1-201ENSMUST00000220847 233 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
NipblQ6KCD5 Trav5d-3-201ENSMUST00000170041 270 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
NipblQ6KCD5 Vmn2r-ps55-201ENSMUST00000173834 240 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
NipblQ6KCD5 Gm24258-201ENSMUST00000083739 133 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
NipblQ6KCD5 Gm14914-201ENSMUST00000117576 2031 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
NipblQ6KCD5 Gm28408-201ENSMUST00000191557 463 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
NipblQ6KCD5 Mir6915-201ENSMUST00000198839 69 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
NipblQ6KCD5 Gm43371-201ENSMUST00000202838 1031 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
NipblQ6KCD5 Tas2r139-201ENSMUST00000057686 960 ntAPPRIS P1 BASIC0.62□□□□□ -2.31
NipblQ6KCD5 Olfr1109-203ENSMUST00000217066 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.61□□□□□ -2.31
NipblQ6KCD5 Gm17976-201ENSMUST00000184037 1909 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
NipblQ6KCD5 Gm29322-201ENSMUST00000185378 582 ntTSL 5 BASIC0.61□□□□□ -2.31
NipblQ6KCD5 Gm37219-201ENSMUST00000192036 926 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
NipblQ6KCD5 Gm6135-201ENSMUST00000198726 372 ntTSL 2 BASIC0.61□□□□□ -2.31
NipblQ6KCD5 Mir224-201ENSMUST00000083608 82 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
NipblQ6KCD5 Gm38104-201ENSMUST00000195121 1895 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
NipblQ6KCD5 Olfr835-202ENSMUST00000213018 2690 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.61□□□□□ -2.31
NipblQ6KCD5 Gm14632-201ENSMUST00000101654 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.61□□□□□ -2.31
NipblQ6KCD5 Gm14786-201ENSMUST00000117127 944 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
NipblQ6KCD5 Gm22839-201ENSMUST00000158436 304 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
NipblQ6KCD5 Mir1966-201ENSMUST00000158807 108 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
NipblQ6KCD5 Gm24813-201ENSMUST00000175310 84 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
NipblQ6KCD5 Gm44059-201ENSMUST00000204048 351 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
NipblQ6KCD5 Gm45116-201ENSMUST00000207392 275 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
NipblQ6KCD5 AC079644.1-201ENSMUST00000220586 405 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
NipblQ6KCD5 Gm10147-201ENSMUST00000075388 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.61□□□□□ -2.31
NipblQ6KCD5 Olfr1459-201ENSMUST00000078299 1102 ntAPPRIS P1 BASIC0.61□□□□□ -2.31
NipblQ6KCD5 Gm15095-201ENSMUST00000118996 1430 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
NipblQ6KCD5 AC158598.2-201ENSMUST00000213397 3832 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
NipblQ6KCD5 Olfr820-202ENSMUST00000214917 4701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.6□□□□□ -2.31
NipblQ6KCD5 Gm24468-201ENSMUST00000104489 104 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
NipblQ6KCD5 Gm25625-201ENSMUST00000157221 96 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
NipblQ6KCD5 Gm28647-201ENSMUST00000188416 197 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
NipblQ6KCD5 Trbv6-201ENSMUST00000193743 276 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
NipblQ6KCD5 Gm9373-201ENSMUST00000208724 599 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
NipblQ6KCD5 Gm19563-201ENSMUST00000222031 270 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
NipblQ6KCD5 AC163664.1-201ENSMUST00000226251 1248 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
NipblQ6KCD5 n-R5s197-201ENSMUST00000083302 119 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
NipblQ6KCD5 Olfr1052-202ENSMUST00000215090 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.6□□□□□ -2.31
NipblQ6KCD5 Gm23469-201ENSMUST00000157131 104 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
NipblQ6KCD5 Gm28169-201ENSMUST00000190342 345 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
NipblQ6KCD5 Olfr190-201ENSMUST00000071243 924 ntAPPRIS P1 BASIC0.6□□□□□ -2.31
NipblQ6KCD5 Olfr1105-202ENSMUST00000215978 3012 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC0.6□□□□□ -2.31
NipblQ6KCD5 Olfr902-202ENSMUST00000213105 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.6□□□□□ -2.31
NipblQ6KCD5 Gm7739-201ENSMUST00000221131 1560 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
NipblQ6KCD5 Gm15692-201ENSMUST00000152173 352 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
NipblQ6KCD5 Gm25772-201ENSMUST00000158574 56 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
NipblQ6KCD5 Olfr183-201ENSMUST00000073320 2040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.59□□□□□ -2.31
NipblQ6KCD5 Gm12006-201ENSMUST00000120786 403 ntBASIC0.59□□□□□ -2.32
NipblQ6KCD5 Gm17528-201ENSMUST00000171026 239 ntBASIC0.59□□□□□ -2.32
NipblQ6KCD5 Gm28932-201ENSMUST00000186300 357 ntTSL 5 BASIC0.59□□□□□ -2.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.6 ms