Protein–RNA interactions for Protein: Q68FH0

Pkp4, Plakophilin-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,190 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp4Q68FH0 CT025689.4-201ENSMUST00000225926 601 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
Pkp4Q68FH0 AC112935.1-201ENSMUST00000227603 250 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
Pkp4Q68FH0 AC144628.1-201ENSMUST00000227943 466 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
Pkp4Q68FH0 Olfr849-201ENSMUST00000063923 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.61□□□□□ -1.99
Pkp4Q68FH0 Defb37-201ENSMUST00000066282 352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
Pkp4Q68FH0 Gm25859-201ENSMUST00000083710 91 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
Pkp4Q68FH0 Gm37941-201ENSMUST00000192170 2309 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
Pkp4Q68FH0 Olfr65-203ENSMUST00000214300 2855 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
Pkp4Q68FH0 Gpr82-201ENSMUST00000053659 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
Pkp4Q68FH0 Vmn1r76-202ENSMUST00000226300 8189 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.6□□□□□ -1.99
Pkp4Q68FH0 Olfr629-202ENSMUST00000213906 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
Pkp4Q68FH0 Gm25500-201ENSMUST00000104426 123 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
Pkp4Q68FH0 Gm11042-201ENSMUST00000110441 120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
Pkp4Q68FH0 Gm9732-201ENSMUST00000111874 492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
Pkp4Q68FH0 Gm25539-201ENSMUST00000116886 122 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
Pkp4Q68FH0 Gm15029-201ENSMUST00000119742 199 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
Pkp4Q68FH0 Gm13443-201ENSMUST00000120770 555 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
Pkp4Q68FH0 Gm12006-201ENSMUST00000120786 403 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
Pkp4Q68FH0 Rhox11-ps1-201ENSMUST00000121945 387 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
Pkp4Q68FH0 Gm22038-201ENSMUST00000157277 242 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
Pkp4Q68FH0 Gm22651-201ENSMUST00000157872 94 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
Pkp4Q68FH0 Gm26088-201ENSMUST00000157896 131 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
Pkp4Q68FH0 Gm25066-201ENSMUST00000158145 123 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
Pkp4Q68FH0 Gm24879-201ENSMUST00000158386 143 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
Pkp4Q68FH0 Gm24681-201ENSMUST00000158760 107 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
Pkp4Q68FH0 Mir5099-201ENSMUST00000175257 74 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
Pkp4Q68FH0 Vmn2r-ps33-201ENSMUST00000175691 904 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
Pkp4Q68FH0 Gm26870-201ENSMUST00000181242 1170 ntTSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
Pkp4Q68FH0 Mir7242-201ENSMUST00000183710 79 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
Pkp4Q68FH0 Gm28343-201ENSMUST00000185386 112 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
Pkp4Q68FH0 Gm28151-201ENSMUST00000189404 951 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
Pkp4Q68FH0 Gm20885-201ENSMUST00000190192 654 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
Pkp4Q68FH0 Gm36866-201ENSMUST00000193343 657 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
Pkp4Q68FH0 Gm37869-201ENSMUST00000193385 595 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
Pkp4Q68FH0 Gm36047-201ENSMUST00000193659 657 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
Pkp4Q68FH0 Gm20857-201ENSMUST00000194766 657 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
Pkp4Q68FH0 Gm20858-201ENSMUST00000195459 657 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
Pkp4Q68FH0 Gm42604-201ENSMUST00000200077 801 ntTSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
Pkp4Q68FH0 Gm42785-201ENSMUST00000202316 3835 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
Pkp4Q68FH0 Gm44128-201ENSMUST00000204909 219 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
Pkp4Q68FH0 Olfr1430-ps1-201ENSMUST00000207422 917 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
Pkp4Q68FH0 Gm38405-203ENSMUST00000208548 400 ntTSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
Pkp4Q68FH0 Gm45459-201ENSMUST00000209882 442 ntTSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
Pkp4Q68FH0 Olfr490-201ENSMUST00000210114 945 ntAPPRIS P1 BASIC2.6□□□□□ -1.99
Pkp4Q68FH0 AC155927.1-201ENSMUST00000220114 1200 ntTSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
Pkp4Q68FH0 AC116589.1-201ENSMUST00000220634 327 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
Pkp4Q68FH0 AC123062.1-201ENSMUST00000221287 481 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
Pkp4Q68FH0 Gm23264-201ENSMUST00000083372 107 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
Pkp4Q68FH0 Olfr1454-202ENSMUST00000213806 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
Pkp4Q68FH0 Olfr1193-202ENSMUST00000213893 3519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
Pkp4Q68FH0 Gm19428-201ENSMUST00000220512 1995 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
Pkp4Q68FH0 Olfr1177-ps-202ENSMUST00000216713 2821 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
Pkp4Q68FH0 Vmn2r50-201ENSMUST00000074943 2586 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
Pkp4Q68FH0 Gm45844-205ENSMUST00000210333 3861 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
Pkp4Q68FH0 Gm36989-201ENSMUST00000193225 2160 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Pkp4Q68FH0 Mir450-2-201ENSMUST00000102444 69 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Pkp4Q68FH0 Gm24280-201ENSMUST00000104237 134 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Pkp4Q68FH0 Gm6096-201ENSMUST00000105172 456 ntAPPRIS P1 BASIC2.59□□□□□ -1.99
Pkp4Q68FH0 Klra10-201ENSMUST00000112020 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
Pkp4Q68FH0 Gm15846-201ENSMUST00000116022 320 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Pkp4Q68FH0 Gm11556-201ENSMUST00000120751 288 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Pkp4Q68FH0 Gm25270-201ENSMUST00000122606 138 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Pkp4Q68FH0 Gm24627-201ENSMUST00000122764 138 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Pkp4Q68FH0 Clec5a-203ENSMUST00000129948 858 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
Pkp4Q68FH0 Gm25163-201ENSMUST00000158905 104 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Pkp4Q68FH0 Gm8580-201ENSMUST00000160295 464 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Pkp4Q68FH0 Vmn2r-ps58-201ENSMUST00000173044 242 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Pkp4Q68FH0 Gm8151-201ENSMUST00000184817 871 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Pkp4Q68FH0 Obox4-ps2-201ENSMUST00000185088 442 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Pkp4Q68FH0 Sumo1-203ENSMUST00000185265 532 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
Pkp4Q68FH0 4930553J12Rik-202ENSMUST00000187823 851 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Pkp4Q68FH0 4930596I21Rik-201ENSMUST00000200494 461 ntTSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
Pkp4Q68FH0 Gm29848-201ENSMUST00000203107 295 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Pkp4Q68FH0 Gm44011-201ENSMUST00000203336 394 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Pkp4Q68FH0 Olfr1556-ps1-201ENSMUST00000204688 466 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Pkp4Q68FH0 Gm44818-201ENSMUST00000206608 358 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Pkp4Q68FH0 Olfr662-ps1-201ENSMUST00000210704 396 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Pkp4Q68FH0 Olfr175-ps1-202ENSMUST00000215069 1201 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
Pkp4Q68FH0 AC171206.2-201ENSMUST00000215252 389 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Pkp4Q68FH0 AC069074.2-201ENSMUST00000217819 428 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Pkp4Q68FH0 AC115735.3-201ENSMUST00000227757 513 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Pkp4Q68FH0 AC129208.2-201ENSMUST00000228506 320 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Pkp4Q68FH0 Vmn1r69-201ENSMUST00000163658 2558 ntAPPRIS P2 BASIC2.59□□□□□ -1.99
Pkp4Q68FH0 Zfp280c-202ENSMUST00000076635 4355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -2
Pkp4Q68FH0 Olfr251-202ENSMUST00000214865 4930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.59□□□□□ -2
Pkp4Q68FH0 Olfr479-202ENSMUST00000209805 2902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
Pkp4Q68FH0 Olfr611-202ENSMUST00000216074 2301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
Pkp4Q68FH0 Gm14401-203ENSMUST00000108970 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
Pkp4Q68FH0 Gm14197-201ENSMUST00000117480 1049 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Pkp4Q68FH0 Gm13355-201ENSMUST00000117996 317 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Pkp4Q68FH0 Gm14417-201ENSMUST00000120036 1074 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Pkp4Q68FH0 Klra5-204ENSMUST00000169901 792 ntTSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
Pkp4Q68FH0 Vmn1r-ps68-201ENSMUST00000174638 399 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Pkp4Q68FH0 Gm22631-201ENSMUST00000179656 94 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Pkp4Q68FH0 Mir7k-201ENSMUST00000184115 110 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Pkp4Q68FH0 Gm38395-201ENSMUST00000199904 830 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Pkp4Q68FH0 Gm44524-201ENSMUST00000203899 271 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Pkp4Q68FH0 Gm45430-201ENSMUST00000211276 260 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
Pkp4Q68FH0 Olfr848-ps1-201ENSMUST00000212241 930 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Pkp4Q68FH0 AC155923.1-201ENSMUST00000215676 356 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 102.9 ms