Protein–RNA interactions for Protein: Q60636

Prdm1, PR domain zinc finger protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 856 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm1Q60636 Mir6715-201ENSMUST00000184990 57 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
Prdm1Q60636 Gm28995-201ENSMUST00000186625 261 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
Prdm1Q60636 Gm28500-201ENSMUST00000190286 151 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
Prdm1Q60636 Gm28951-201ENSMUST00000190742 313 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
Prdm1Q60636 Gm8197-201ENSMUST00000192906 363 ntTSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
Prdm1Q60636 Mir6375-201ENSMUST00000197176 95 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
Prdm1Q60636 Gm44419-201ENSMUST00000203338 229 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
Prdm1Q60636 Gm44266-201ENSMUST00000205235 500 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
Prdm1Q60636 Olfr1304-ps1-201ENSMUST00000208032 189 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
Prdm1Q60636 Gm45245-201ENSMUST00000210082 376 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
Prdm1Q60636 AC107864.1-201ENSMUST00000217937 496 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
Prdm1Q60636 AL590503.1-201ENSMUST00000222053 321 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
Prdm1Q60636 Gm26107-201ENSMUST00000083972 107 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
Prdm1Q60636 Cp-201ENSMUST00000003714 4092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
Prdm1Q60636 Vmn1r62-201ENSMUST00000173956 1757 ntAPPRIS P1 BASIC4.09□□□□□ -1.75
Prdm1Q60636 Cd46-203ENSMUST00000162650 6288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
Prdm1Q60636 Olfr299-202ENSMUST00000217253 4479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
Prdm1Q60636 Cp-205ENSMUST00000108329 4564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
Prdm1Q60636 Vmn1r14-202ENSMUST00000227209 6857 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.09□□□□□ -1.75
Prdm1Q60636 Olfr1109-202ENSMUST00000214636 2483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
Prdm1Q60636 Catsper4-202ENSMUST00000105878 632 ntTSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
Prdm1Q60636 Gm24061-201ENSMUST00000157489 120 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
Prdm1Q60636 Gm27592-201ENSMUST00000157729 126 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
Prdm1Q60636 Gm23196-201ENSMUST00000158806 107 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
Prdm1Q60636 Gm22174-201ENSMUST00000175050 125 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
Prdm1Q60636 Gm22692-201ENSMUST00000175055 125 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
Prdm1Q60636 Gm27634-201ENSMUST00000175060 126 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
Prdm1Q60636 Gm26460-201ENSMUST00000175061 126 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
Prdm1Q60636 Gm22460-201ENSMUST00000175269 124 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
Prdm1Q60636 Gm25535-201ENSMUST00000175364 125 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
Prdm1Q60636 Gm24365-201ENSMUST00000175384 125 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
Prdm1Q60636 Gm44310-201ENSMUST00000175424 126 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
Prdm1Q60636 Gm22639-201ENSMUST00000175591 125 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
Prdm1Q60636 Gm24979-201ENSMUST00000178626 126 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
Prdm1Q60636 Gm26585-201ENSMUST00000180890 630 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
Prdm1Q60636 Gm28000-201ENSMUST00000184380 85 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
Prdm1Q60636 Gm27743-201ENSMUST00000185136 126 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
Prdm1Q60636 Rpl23a-ps7-201ENSMUST00000185437 460 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
Prdm1Q60636 Gm20923-201ENSMUST00000190009 319 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
Prdm1Q60636 Gm28288-201ENSMUST00000191019 214 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
Prdm1Q60636 Gm45395-201ENSMUST00000209891 559 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
Prdm1Q60636 AC129202.3-201ENSMUST00000224413 733 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
Prdm1Q60636 AC154390.1-201ENSMUST00000225629 277 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
Prdm1Q60636 Gm22806-201ENSMUST00000082738 136 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
Prdm1Q60636 Gm23517-201ENSMUST00000082830 192 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
Prdm1Q60636 Gm25698-201ENSMUST00000082897 107 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
Prdm1Q60636 Mir101b-201ENSMUST00000083622 97 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
Prdm1Q60636 Gm26166-201ENSMUST00000083788 107 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
Prdm1Q60636 Gm22353-201ENSMUST00000083918 136 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
Prdm1Q60636 Gm22868-201ENSMUST00000083955 164 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
Prdm1Q60636 mt-Nd4-201ENSMUST00000082414 1378 ntAPPRIS P1 BASIC4.09□□□□□ -1.75
Prdm1Q60636 Gm14443-201ENSMUST00000109054 4516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
Prdm1Q60636 Vmn1r185-213ENSMUST00000228676 5199 ntAPPRIS P1 BASIC4.09□□□□□ -1.76
Prdm1Q60636 AC153563.1-202ENSMUST00000217695 1838 ntTSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.76
Prdm1Q60636 Gm9747-201ENSMUST00000023262 2822 ntAPPRIS P1 BASIC4.08□□□□□ -1.76
Prdm1Q60636 Olfr352-202ENSMUST00000217325 3337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
Prdm1Q60636 Gm31592-201ENSMUST00000217529 3471 ntTSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
Prdm1Q60636 AC161254.1-201ENSMUST00000220310 3842 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
Prdm1Q60636 Rbbp8-202ENSMUST00000115861 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
Prdm1Q60636 Gemin6-ps-201ENSMUST00000120444 501 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
Prdm1Q60636 Gm14810-201ENSMUST00000121628 486 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
Prdm1Q60636 Gm16218-201ENSMUST00000155424 388 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
Prdm1Q60636 Gm23540-201ENSMUST00000157543 164 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
Prdm1Q60636 Gm22598-201ENSMUST00000157600 127 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
Prdm1Q60636 Gm27921-201ENSMUST00000183968 108 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
Prdm1Q60636 Gm29512-201ENSMUST00000185544 315 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
Prdm1Q60636 Gm28110-201ENSMUST00000185782 315 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
Prdm1Q60636 Gm28838-201ENSMUST00000186338 315 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
Prdm1Q60636 Gm29057-201ENSMUST00000186468 315 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
Prdm1Q60636 Gm29661-201ENSMUST00000186781 315 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
Prdm1Q60636 Gm28737-201ENSMUST00000186808 315 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
Prdm1Q60636 Gm29118-201ENSMUST00000186908 315 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
Prdm1Q60636 Gm28433-201ENSMUST00000187085 315 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
Prdm1Q60636 Gm29635-201ENSMUST00000187221 315 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
Prdm1Q60636 Gm28759-201ENSMUST00000187621 315 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
Prdm1Q60636 Gm28831-201ENSMUST00000187739 315 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
Prdm1Q60636 Gm28200-201ENSMUST00000187778 315 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
Prdm1Q60636 Gm29026-201ENSMUST00000187787 315 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
Prdm1Q60636 Gm28752-201ENSMUST00000188340 315 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
Prdm1Q60636 Gm28797-201ENSMUST00000188543 315 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
Prdm1Q60636 Gm28855-201ENSMUST00000188680 315 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
Prdm1Q60636 Gm29378-201ENSMUST00000188723 315 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
Prdm1Q60636 Gm28569-201ENSMUST00000188748 315 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
Prdm1Q60636 Gm28120-201ENSMUST00000188812 315 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
Prdm1Q60636 Gm28369-201ENSMUST00000188993 315 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
Prdm1Q60636 Gm29037-201ENSMUST00000189092 313 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
Prdm1Q60636 Gm28909-201ENSMUST00000189406 315 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
Prdm1Q60636 Gm28705-201ENSMUST00000189548 315 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
Prdm1Q60636 Gm28861-201ENSMUST00000189681 315 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
Prdm1Q60636 Gm29180-201ENSMUST00000190003 315 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
Prdm1Q60636 Gm28939-201ENSMUST00000190351 315 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
Prdm1Q60636 Gm28223-201ENSMUST00000190469 315 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
Prdm1Q60636 Gm29575-201ENSMUST00000190597 315 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
Prdm1Q60636 Gm29092-201ENSMUST00000190768 315 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
Prdm1Q60636 Gm29469-201ENSMUST00000191448 315 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
Prdm1Q60636 Gtpbp4-ps6-201ENSMUST00000198160 292 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
Prdm1Q60636 Mir7227-201ENSMUST00000200408 59 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
Prdm1Q60636 Gm44072-201ENSMUST00000203666 383 ntTSL 3 BASIC4.08□□□□□ -1.76
Prdm1Q60636 Gm44959-201ENSMUST00000209127 231 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
Prdm1Q60636 AC160865.1-201ENSMUST00000219873 151 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84 ms