Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 Gm2003-201ENSMUST00000118537 636 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
Sft2d1Q5SSN7 Gm16225-201ENSMUST00000146152 276 ntTSL 5 BASIC0.92□□□□□ -2.26
Sft2d1Q5SSN7 Gm12694-201ENSMUST00000149367 748 ntTSL 3 BASIC0.92□□□□□ -2.26
Sft2d1Q5SSN7 Gm23670-201ENSMUST00000157469 119 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
Sft2d1Q5SSN7 Gm22537-201ENSMUST00000158172 199 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
Sft2d1Q5SSN7 Gm25748-201ENSMUST00000175487 70 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
Sft2d1Q5SSN7 Vmn1r-ps15-201ENSMUST00000177365 910 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
Sft2d1Q5SSN7 Prl8a6-201ENSMUST00000018392 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC0.92□□□□□ -2.26
Sft2d1Q5SSN7 Mir6997-201ENSMUST00000184313 71 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
Sft2d1Q5SSN7 Gm43007-201ENSMUST00000197618 291 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
Sft2d1Q5SSN7 Igkv1-136-201ENSMUST00000200635 297 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
Sft2d1Q5SSN7 Gm20559-201ENSMUST00000201032 433 ntTSL 3 BASIC0.92□□□□□ -2.26
Sft2d1Q5SSN7 Prl-203ENSMUST00000224228 888 ntAPPRIS ALT2 BASIC0.92□□□□□ -2.26
Sft2d1Q5SSN7 mt-Rnr1-201ENSMUST00000082388 955 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
Sft2d1Q5SSN7 mt-Nd1-201ENSMUST00000082392 957 ntAPPRIS P1 BASIC0.92□□□□□ -2.26
Sft2d1Q5SSN7 C030005K15Rik-201ENSMUST00000166373 1882 ntAPPRIS P1 BASIC0.92□□□□□ -2.26
Sft2d1Q5SSN7 Olfr820-203ENSMUST00000215791 3956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.92□□□□□ -2.26
Sft2d1Q5SSN7 Gm42635-201ENSMUST00000200266 2571 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1109-202ENSMUST00000214636 2483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.91□□□□□ -2.26
Sft2d1Q5SSN7 Gm15088-201ENSMUST00000117973 1508 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
Sft2d1Q5SSN7 Gm15098-201ENSMUST00000119036 1508 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
Sft2d1Q5SSN7 Gm7489-201ENSMUST00000100666 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.91□□□□□ -2.26
Sft2d1Q5SSN7 Trbv5-201ENSMUST00000103266 368 ntAPPRIS P1 BASIC0.91□□□□□ -2.26
Sft2d1Q5SSN7 Gm14360-201ENSMUST00000120670 393 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
Sft2d1Q5SSN7 Gm12001-201ENSMUST00000121727 913 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
Sft2d1Q5SSN7 Gm13406-201ENSMUST00000121991 256 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
Sft2d1Q5SSN7 Gm15656-201ENSMUST00000132076 615 ntTSL 3 BASIC0.91□□□□□ -2.26
Sft2d1Q5SSN7 Gm11583-201ENSMUST00000132296 466 ntTSL 5 BASIC0.91□□□□□ -2.26
Sft2d1Q5SSN7 Gm8121-201ENSMUST00000153583 499 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
Sft2d1Q5SSN7 Gm22425-201ENSMUST00000158532 138 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
Sft2d1Q5SSN7 Gm23339-201ENSMUST00000158962 139 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
Sft2d1Q5SSN7 Gm26157-201ENSMUST00000158974 126 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
Sft2d1Q5SSN7 Mir6338-201ENSMUST00000183389 109 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
Sft2d1Q5SSN7 Gm9541-201ENSMUST00000188409 502 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
Sft2d1Q5SSN7 4930440C22Rik-202ENSMUST00000190754 512 ntTSL 3 BASIC0.91□□□□□ -2.26
Sft2d1Q5SSN7 Gm37684-201ENSMUST00000192779 355 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
Sft2d1Q5SSN7 Gm33354-201ENSMUST00000195448 906 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
Sft2d1Q5SSN7 1700016B01Rik-201ENSMUST00000197688 270 ntTSL 1 (best) BASIC0.91□□□□□ -2.26
Sft2d1Q5SSN7 1700015C15Rik-201ENSMUST00000221465 374 ntTSL 1 (best) BASIC0.91□□□□□ -2.26
Sft2d1Q5SSN7 AC134601.3-201ENSMUST00000221682 154 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
Sft2d1Q5SSN7 Olfr952-201ENSMUST00000073895 1056 ntAPPRIS P1 BASIC0.91□□□□□ -2.26
Sft2d1Q5SSN7 Snord14a-201ENSMUST00000082807 87 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
Sft2d1Q5SSN7 Gm23100-201ENSMUST00000083455 141 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
Sft2d1Q5SSN7 Mup1-201ENSMUST00000084548 776 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC0.91□□□□□ -2.26
Sft2d1Q5SSN7 Gm21814-203ENSMUST00000203729 1352 ntTSL 1 (best) BASIC0.91□□□□□ -2.26
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1105-202ENSMUST00000215978 3012 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC0.91□□□□□ -2.26
Sft2d1Q5SSN7 Olfr611-202ENSMUST00000216074 2301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.9□□□□□ -2.26
Sft2d1Q5SSN7 Gm24142-201ENSMUST00000101960 107 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
Sft2d1Q5SSN7 Gm22674-201ENSMUST00000104413 131 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
Sft2d1Q5SSN7 Mir1195-201ENSMUST00000116818 98 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
Sft2d1Q5SSN7 Gm11268-201ENSMUST00000118347 267 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
Sft2d1Q5SSN7 Gm26049-201ENSMUST00000157313 108 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
Sft2d1Q5SSN7 Gm24716-201ENSMUST00000157524 104 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
Sft2d1Q5SSN7 Gm25642-201ENSMUST00000175137 66 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
Sft2d1Q5SSN7 Gm22776-201ENSMUST00000178634 94 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
Sft2d1Q5SSN7 Gm23767-201ENSMUST00000179278 94 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
Sft2d1Q5SSN7 Mir6926-201ENSMUST00000184562 68 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
Sft2d1Q5SSN7 Gm28347-201ENSMUST00000185380 382 ntTSL 2 BASIC0.9□□□□□ -2.27
Sft2d1Q5SSN7 Gm20118-201ENSMUST00000187207 162 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
Sft2d1Q5SSN7 Sly-201ENSMUST00000189109 797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC0.9□□□□□ -2.27
Sft2d1Q5SSN7 Gm44404-201ENSMUST00000203979 636 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
Sft2d1Q5SSN7 AC154828.2-201ENSMUST00000220908 1070 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
Sft2d1Q5SSN7 AC133076.1-201ENSMUST00000228074 484 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
Sft2d1Q5SSN7 Skint11-201ENSMUST00000079915 820 ntTSL 1 (best) BASIC0.9□□□□□ -2.27
Sft2d1Q5SSN7 Gm26922-201ENSMUST00000082687 72 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
Sft2d1Q5SSN7 Vmn2r70-201ENSMUST00000168230 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.9□□□□□ -2.27
Sft2d1Q5SSN7 Gm12393-201ENSMUST00000117084 848 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
Sft2d1Q5SSN7 Gm12636-201ENSMUST00000117395 624 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
Sft2d1Q5SSN7 Vmn1r-ps97-201ENSMUST00000118338 603 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
Sft2d1Q5SSN7 Gm14566-201ENSMUST00000118915 321 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
Sft2d1Q5SSN7 Gm13359-201ENSMUST00000119000 695 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
Sft2d1Q5SSN7 Gm15223-201ENSMUST00000120989 826 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
Sft2d1Q5SSN7 Gm22217-201ENSMUST00000157556 313 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
Sft2d1Q5SSN7 Gm22382-201ENSMUST00000158185 130 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
Sft2d1Q5SSN7 Gm24177-201ENSMUST00000158927 131 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
Sft2d1Q5SSN7 Gm22264-201ENSMUST00000178200 107 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
Sft2d1Q5SSN7 Gm21732-201ENSMUST00000179309 1083 ntAPPRIS P1 BASIC0.89□□□□□ -2.27
Sft2d1Q5SSN7 Mir8119-201ENSMUST00000183371 129 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
Sft2d1Q5SSN7 Mir7667-201ENSMUST00000183866 63 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
Sft2d1Q5SSN7 Gm27522-201ENSMUST00000183949 230 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
Sft2d1Q5SSN7 Gm28755-201ENSMUST00000185773 199 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
Sft2d1Q5SSN7 Gm38238-201ENSMUST00000194334 346 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
Sft2d1Q5SSN7 Gm8747-201ENSMUST00000195392 751 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
Sft2d1Q5SSN7 Gm42454-201ENSMUST00000196805 1181 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1142-ps1-201ENSMUST00000213624 805 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
Sft2d1Q5SSN7 AC163357.1-201ENSMUST00000220847 233 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
Sft2d1Q5SSN7 Gm24948-201ENSMUST00000082866 207 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
Sft2d1Q5SSN7 Gm16261-201ENSMUST00000096813 205 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
Sft2d1Q5SSN7 Gm8935-202ENSMUST00000105727 1959 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1442-204ENSMUST00000208657 3148 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC0.88□□□□□ -2.27
Sft2d1Q5SSN7 Mir758-201ENSMUST00000103260 81 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
Sft2d1Q5SSN7 Gm26342-201ENSMUST00000104557 129 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
Sft2d1Q5SSN7 Gm11352-201ENSMUST00000119264 517 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
Sft2d1Q5SSN7 Atp5k-ps2-201ENSMUST00000120437 210 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
Sft2d1Q5SSN7 Gm14800-201ENSMUST00000122084 1272 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
Sft2d1Q5SSN7 Defa-ps6-201ENSMUST00000122172 282 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
Sft2d1Q5SSN7 Gm15530-201ENSMUST00000122206 555 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
Sft2d1Q5SSN7 Ssxb6-201ENSMUST00000138642 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.88□□□□□ -2.27
Sft2d1Q5SSN7 Spink10-206ENSMUST00000162511 684 ntTSL 1 (best) BASIC0.88□□□□□ -2.27
Sft2d1Q5SSN7 Vmn1r-ps69-201ENSMUST00000172759 201 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
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