Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHX8

Nkx6-3, Homeobox protein Nkx-6.3, mousemouse

Predictions only

Length 262 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx6-3Q3UHX8 Gm45130-201ENSMUST00000207574 3388 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Nkx6-3Q3UHX8 Olfr1325-202ENSMUST00000216007 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
Nkx6-3Q3UHX8 Olfr652-204ENSMUST00000219111 5329 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
Nkx6-3Q3UHX8 Gm42606-201ENSMUST00000114209 239 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Nkx6-3Q3UHX8 Gm14670-201ENSMUST00000117327 337 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Nkx6-3Q3UHX8 Tpt1-ps1-201ENSMUST00000120257 436 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Nkx6-3Q3UHX8 Gm15733-201ENSMUST00000132957 242 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Nkx6-3Q3UHX8 Gm25490-201ENSMUST00000158734 130 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Nkx6-3Q3UHX8 Gm16289-201ENSMUST00000162079 183 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Nkx6-3Q3UHX8 Gm20484-201ENSMUST00000173738 231 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
Nkx6-3Q3UHX8 Gm28358-202ENSMUST00000189292 223 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Nkx6-3Q3UHX8 Gm18551-201ENSMUST00000195594 642 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Nkx6-3Q3UHX8 Gm6059-201ENSMUST00000196903 340 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Nkx6-3Q3UHX8 Gm35931-201ENSMUST00000203931 448 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Nkx6-3Q3UHX8 Olfr1035-ps1-202ENSMUST00000213364 288 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
Nkx6-3Q3UHX8 AC101984.1-201ENSMUST00000219639 402 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Nkx6-3Q3UHX8 Defb19-201ENSMUST00000053180 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
Nkx6-3Q3UHX8 Gm25856-201ENSMUST00000082786 75 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Nkx6-3Q3UHX8 Gm43663-201ENSMUST00000198643 1505 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Nkx6-3Q3UHX8 Gpr22-201ENSMUST00000057783 4587 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
Nkx6-3Q3UHX8 Zfp991-201ENSMUST00000084149 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
Nkx6-3Q3UHX8 Samd9l-201ENSMUST00000120087 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
Nkx6-3Q3UHX8 Olfr1162-202ENSMUST00000183862 4800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Nkx6-3Q3UHX8 Ighv3-6-201ENSMUST00000103481 342 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Nkx6-3Q3UHX8 Gm23175-201ENSMUST00000104371 132 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Nkx6-3Q3UHX8 Gm12782-201ENSMUST00000117519 727 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Nkx6-3Q3UHX8 Gm9119-201ENSMUST00000118866 495 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Nkx6-3Q3UHX8 Gm14013-201ENSMUST00000119006 270 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Nkx6-3Q3UHX8 Gm13717-201ENSMUST00000119868 365 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Nkx6-3Q3UHX8 Gm14852-201ENSMUST00000120065 647 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Nkx6-3Q3UHX8 Gm14841-201ENSMUST00000121067 758 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Nkx6-3Q3UHX8 Sult2a-ps4-201ENSMUST00000121421 386 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Nkx6-3Q3UHX8 Gm13424-201ENSMUST00000122301 354 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Nkx6-3Q3UHX8 Gm16155-201ENSMUST00000155180 338 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Nkx6-3Q3UHX8 Gm22257-201ENSMUST00000158687 301 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Nkx6-3Q3UHX8 Gm21776-201ENSMUST00000177676 1083 ntAPPRIS P1 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Nkx6-3Q3UHX8 Gm23191-201ENSMUST00000179147 107 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Nkx6-3Q3UHX8 Gm21913-201ENSMUST00000179880 1083 ntAPPRIS P1 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Nkx6-3Q3UHX8 Gm18971-201ENSMUST00000197240 374 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Nkx6-3Q3UHX8 Gm43624-201ENSMUST00000197368 180 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Nkx6-3Q3UHX8 Olfr428-ps1-201ENSMUST00000201135 466 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Nkx6-3Q3UHX8 Olfr1481-ps1-201ENSMUST00000207312 134 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Nkx6-3Q3UHX8 Olfr953-ps1-201ENSMUST00000214463 892 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Nkx6-3Q3UHX8 AC154296.2-201ENSMUST00000214696 545 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Nkx6-3Q3UHX8 CT009713.6-201ENSMUST00000223615 294 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Nkx6-3Q3UHX8 Gm22247-201ENSMUST00000082476 131 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Nkx6-3Q3UHX8 Gm23615-201ENSMUST00000082602 65 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Nkx6-3Q3UHX8 Gm22507-201ENSMUST00000082773 160 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Nkx6-3Q3UHX8 Olfr1289-201ENSMUST00000120021 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Nkx6-3Q3UHX8 Zfp711-201ENSMUST00000071814 3817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Nkx6-3Q3UHX8 Olfr1168-202ENSMUST00000215996 2322 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Nkx6-3Q3UHX8 Gm32693-201ENSMUST00000196538 2402 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
Nkx6-3Q3UHX8 Zfp442-202ENSMUST00000185796 1833 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
Nkx6-3Q3UHX8 Pak3-205ENSMUST00000112868 8163 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
Nkx6-3Q3UHX8 Fbxw21-201ENSMUST00000054925 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
Nkx6-3Q3UHX8 Ccdc178-202ENSMUST00000115837 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
Nkx6-3Q3UHX8 Vmn1r46-203ENSMUST00000226715 10861 ntAPPRIS P1 BASIC2.84□□□□□ -1.95
Nkx6-3Q3UHX8 Vmn1r46-205ENSMUST00000228349 10861 ntAPPRIS P1 BASIC2.84□□□□□ -1.95
Nkx6-3Q3UHX8 Gm2026-201ENSMUST00000109007 1621 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
Nkx6-3Q3UHX8 Dppa1-202ENSMUST00000109227 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
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Nkx6-3Q3UHX8 4930511O05Rik-201ENSMUST00000155912 391 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
Nkx6-3Q3UHX8 Gm23956-201ENSMUST00000157211 119 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Nkx6-3Q3UHX8 Gm24192-201ENSMUST00000157978 145 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Nkx6-3Q3UHX8 Gm7097-201ENSMUST00000161841 491 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
Nkx6-3Q3UHX8 Gm20513-201ENSMUST00000174074 537 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
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Nkx6-3Q3UHX8 Gm26844-201ENSMUST00000181690 673 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
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Nkx6-3Q3UHX8 Spag11b-201ENSMUST00000039075 342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
Nkx6-3Q3UHX8 Gm22365-201ENSMUST00000093750 117 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Nkx6-3Q3UHX8 Olfr1325-203ENSMUST00000216108 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
Nkx6-3Q3UHX8 Vmn1r79-203ENSMUST00000227530 5581 ntAPPRIS P1 BASIC2.84□□□□□ -1.96
Nkx6-3Q3UHX8 Fnd3c2-201ENSMUST00000091282 3662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.96
Nkx6-3Q3UHX8 Gm43268-201ENSMUST00000201536 4055 ntBASIC2.84□□□□□ -1.96
Nkx6-3Q3UHX8 Olfr862-202ENSMUST00000079660 2604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.96
Nkx6-3Q3UHX8 A930027P06Rik-201ENSMUST00000221298 2975 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Nkx6-3Q3UHX8 Dst-211ENSMUST00000183034 23201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
Nkx6-3Q3UHX8 Olfr792-202ENSMUST00000215436 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
Nkx6-3Q3UHX8 Gm12819-201ENSMUST00000122223 629 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Nkx6-3Q3UHX8 Gm22766-201ENSMUST00000158372 99 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Nkx6-3Q3UHX8 Gm24577-201ENSMUST00000158580 63 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Nkx6-3Q3UHX8 Gm22891-201ENSMUST00000158641 164 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Nkx6-3Q3UHX8 Gm23704-201ENSMUST00000158844 340 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Nkx6-3Q3UHX8 Gm43976-201ENSMUST00000203637 235 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Nkx6-3Q3UHX8 Gm44687-201ENSMUST00000204975 235 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Nkx6-3Q3UHX8 Gm44870-201ENSMUST00000207291 357 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Nkx6-3Q3UHX8 AC166358.7-201ENSMUST00000221132 108 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Nkx6-3Q3UHX8 Gm35190-201ENSMUST00000222335 526 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
Nkx6-3Q3UHX8 AC125543.5-201ENSMUST00000222799 108 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Nkx6-3Q3UHX8 AC130477.2-201ENSMUST00000228158 274 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Nkx6-3Q3UHX8 Sval1-201ENSMUST00000031898 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
Nkx6-3Q3UHX8 Gm25475-201ENSMUST00000082825 180 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Nkx6-3Q3UHX8 Mir10a-201ENSMUST00000083585 110 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
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