Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 Snord116l10-201ENSMUST00000179053 94 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
Trim71Q1PSW8 Gm24153-201ENSMUST00000179280 94 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
Trim71Q1PSW8 Gm25597-201ENSMUST00000179388 94 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
Trim71Q1PSW8 Snord116l1-201ENSMUST00000179518 94 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
Trim71Q1PSW8 Gm25816-201ENSMUST00000179764 94 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
Trim71Q1PSW8 Snord116l8-201ENSMUST00000179889 94 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
Trim71Q1PSW8 Snord116l7-201ENSMUST00000179895 94 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
Trim71Q1PSW8 Snord116l5-201ENSMUST00000179927 94 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
Trim71Q1PSW8 Snord116l6-201ENSMUST00000179955 94 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
Trim71Q1PSW8 Gm26188-201ENSMUST00000179963 94 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
Trim71Q1PSW8 Gm26433-201ENSMUST00000180227 94 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
Trim71Q1PSW8 Snord116l11-201ENSMUST00000180312 94 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
Trim71Q1PSW8 Gm22128-201ENSMUST00000180346 94 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
Trim71Q1PSW8 Gm26844-201ENSMUST00000181690 673 ntTSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
Trim71Q1PSW8 Gm9022-202ENSMUST00000183285 483 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
Trim71Q1PSW8 Mir6335-201ENSMUST00000184081 98 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
Trim71Q1PSW8 Gm7329-201ENSMUST00000185915 210 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
Trim71Q1PSW8 Gm33354-201ENSMUST00000195448 906 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
Trim71Q1PSW8 Gm38167-201ENSMUST00000195704 1178 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
Trim71Q1PSW8 Gm42647-201ENSMUST00000195939 459 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
Trim71Q1PSW8 Mirlet7f-1-201ENSMUST00000198652 89 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
Trim71Q1PSW8 Igkv1-115-201ENSMUST00000198714 302 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
Trim71Q1PSW8 Gm43500-201ENSMUST00000201067 312 ntTSL 5 BASIC3.08□□□□□ -1.92
Trim71Q1PSW8 Gm44520-201ENSMUST00000205447 802 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
Trim71Q1PSW8 Gm19572-201ENSMUST00000214326 338 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
Trim71Q1PSW8 Gm46233-201ENSMUST00000217831 449 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
Trim71Q1PSW8 AC100590.3-201ENSMUST00000219355 332 ntTSL 5 BASIC3.08□□□□□ -1.92
Trim71Q1PSW8 AC138401.1-201ENSMUST00000221533 116 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
Trim71Q1PSW8 AC144628.2-201ENSMUST00000227374 352 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
Trim71Q1PSW8 Spag11b-201ENSMUST00000039075 342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
Trim71Q1PSW8 Olfr786-201ENSMUST00000076508 939 ntAPPRIS P1 BASIC3.08□□□□□ -1.92
Trim71Q1PSW8 Gm25856-201ENSMUST00000082786 75 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
Trim71Q1PSW8 Olfr1156-201ENSMUST00000099842 1076 ntAPPRIS P1 BASIC3.08□□□□□ -1.92
Trim71Q1PSW8 Olfr1002-201ENSMUST00000099920 957 ntAPPRIS P1 BASIC3.08□□□□□ -1.92
Trim71Q1PSW8 Vmn1r172-202ENSMUST00000173101 9109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
Trim71Q1PSW8 Ctdspl2-202ENSMUST00000110572 4160 ntTSL 5 BASIC3.07□□□□□ -1.92
Trim71Q1PSW8 Btla-202ENSMUST00000102802 3251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
Trim71Q1PSW8 Gm25728-201ENSMUST00000104525 159 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
Trim71Q1PSW8 Gm23911-201ENSMUST00000104596 134 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
Trim71Q1PSW8 Gm11009-201ENSMUST00000108961 417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.07□□□□□ -1.92
Trim71Q1PSW8 Gm13331-201ENSMUST00000117500 448 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
Trim71Q1PSW8 Gm12782-201ENSMUST00000117519 727 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
Trim71Q1PSW8 Gm12779-201ENSMUST00000121496 143 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
Trim71Q1PSW8 Gm22141-201ENSMUST00000157403 277 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
Trim71Q1PSW8 Gm22668-201ENSMUST00000158716 260 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
Trim71Q1PSW8 B230216N24Rik-202ENSMUST00000159353 345 ntTSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
Trim71Q1PSW8 Gm25360-201ENSMUST00000178786 191 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
Trim71Q1PSW8 Mir6371-201ENSMUST00000184470 111 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
Trim71Q1PSW8 Gm6059-201ENSMUST00000196903 340 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
Trim71Q1PSW8 AL603834.1-201ENSMUST00000198372 121 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
Trim71Q1PSW8 Gm43578-201ENSMUST00000201250 459 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
Trim71Q1PSW8 AC159475.1-201ENSMUST00000216752 411 ntTSL 5 BASIC3.07□□□□□ -1.92
Trim71Q1PSW8 Gm19326-201ENSMUST00000219818 326 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
Trim71Q1PSW8 AC122393.3-201ENSMUST00000226343 1059 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
Trim71Q1PSW8 Rpl31-ps1-201ENSMUST00000085128 378 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
Trim71Q1PSW8 Olfr1256-203ENSMUST00000213833 6081 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.07□□□□□ -1.92
Trim71Q1PSW8 Olfr1129-202ENSMUST00000213315 2255 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.07□□□□□ -1.92
Trim71Q1PSW8 Vmn1r29-203ENSMUST00000227761 4671 ntAPPRIS P1 BASIC3.07□□□□□ -1.92
Trim71Q1PSW8 Vmn1r29-205ENSMUST00000228909 4658 ntAPPRIS P1 BASIC3.07□□□□□ -1.92
Trim71Q1PSW8 Adgrg4-204ENSMUST00000153784 9329 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
Trim71Q1PSW8 Gm43379-201ENSMUST00000196253 7726 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
Trim71Q1PSW8 Gm7853-201ENSMUST00000100708 478 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
Trim71Q1PSW8 Gm12386-201ENSMUST00000117380 688 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
Trim71Q1PSW8 Rps27-ps1-201ENSMUST00000118179 246 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
Trim71Q1PSW8 Gm12723-201ENSMUST00000120700 451 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
Trim71Q1PSW8 Gm14841-201ENSMUST00000121067 758 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
Trim71Q1PSW8 Gm24691-201ENSMUST00000157762 140 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
Trim71Q1PSW8 Gm25335-201ENSMUST00000158043 103 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
Trim71Q1PSW8 Vmn2r-ps69-201ENSMUST00000173382 2565 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
Trim71Q1PSW8 Gm26430-201ENSMUST00000178054 107 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
Trim71Q1PSW8 Gm27505-201ENSMUST00000185071 110 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
Trim71Q1PSW8 Gm29350-201ENSMUST00000189141 541 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
Trim71Q1PSW8 Gm28271-201ENSMUST00000191369 351 ntTSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
Trim71Q1PSW8 Gm8242-202ENSMUST00000193056 475 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
Trim71Q1PSW8 Rpl18a-ps3-201ENSMUST00000198938 171 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
Trim71Q1PSW8 Olfr1401-ps1-201ENSMUST00000202296 211 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
Trim71Q1PSW8 Olfr662-ps1-201ENSMUST00000210704 396 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
Trim71Q1PSW8 AC116465.1-201ENSMUST00000220324 235 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
Trim71Q1PSW8 AC125223.1-203ENSMUST00000225304 498 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
Trim71Q1PSW8 Efcab9-201ENSMUST00000054327 754 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
Trim71Q1PSW8 Gm25202-201ENSMUST00000082838 191 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
Trim71Q1PSW8 Mir184-201ENSMUST00000083662 69 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
Trim71Q1PSW8 Gm22577-201ENSMUST00000083731 109 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
Trim71Q1PSW8 Olfr218-202ENSMUST00000215844 3410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
Trim71Q1PSW8 Olfr748-202ENSMUST00000213101 3632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
Trim71Q1PSW8 Olfr1226-202ENSMUST00000214709 5270 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
Trim71Q1PSW8 Gm36944-201ENSMUST00000192257 2759 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
Trim71Q1PSW8 Vmn1r178-203ENSMUST00000226489 2644 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
Trim71Q1PSW8 Gm23716-201ENSMUST00000157348 144 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
Trim71Q1PSW8 H3f3aos-202ENSMUST00000159740 229 ntTSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
Trim71Q1PSW8 Gm15914-201ENSMUST00000161922 309 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
Trim71Q1PSW8 Gm17166-201ENSMUST00000172006 431 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
Trim71Q1PSW8 Gm20484-201ENSMUST00000173738 231 ntTSL 2 BASIC3.05□□□□□ -1.92
Trim71Q1PSW8 Gm20513-201ENSMUST00000174074 537 ntTSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
Trim71Q1PSW8 Gm28628-201ENSMUST00000187006 264 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
Trim71Q1PSW8 Gm36992-201ENSMUST00000195463 428 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
Trim71Q1PSW8 Igkv12-49-201ENSMUST00000197714 278 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
Trim71Q1PSW8 Gm43239-201ENSMUST00000200131 201 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
Trim71Q1PSW8 Gm44526-201ENSMUST00000204664 121 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
Trim71Q1PSW8 Olfr1285-201ENSMUST00000208523 903 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
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