Protein–RNA interactions for Protein: Q0HA38

Ttc21b, Tetratricopeptide repeat protein 21B, mousemouse

Predictions only

Length 1,315 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc21bQ0HA38 Gm45455-202ENSMUST00000211156 630 ntTSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
Ttc21bQ0HA38 AC073947.3-201ENSMUST00000215576 766 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
Ttc21bQ0HA38 Gm24921-201ENSMUST00000083024 107 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
Ttc21bQ0HA38 Gm22740-201ENSMUST00000083439 109 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
Ttc21bQ0HA38 4930524B17Rik-201ENSMUST00000200755 1870 ntTSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
Ttc21bQ0HA38 Igkv17-121-201ENSMUST00000103315 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.59□□□□□ -2
Ttc21bQ0HA38 Cypt15-201ENSMUST00000115114 519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -2
Ttc21bQ0HA38 Gm15312-201ENSMUST00000118827 271 ntBASIC2.59□□□□□ -2
Ttc21bQ0HA38 Gm15309-201ENSMUST00000121644 240 ntBASIC2.59□□□□□ -2
Ttc21bQ0HA38 4933406D12Rik-201ENSMUST00000147212 737 ntTSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -2
Ttc21bQ0HA38 Gm23588-201ENSMUST00000157659 99 ntBASIC2.59□□□□□ -2
Ttc21bQ0HA38 Gm26271-201ENSMUST00000158349 104 ntBASIC2.59□□□□□ -2
Ttc21bQ0HA38 Gm26004-201ENSMUST00000158804 116 ntBASIC2.59□□□□□ -2
Ttc21bQ0HA38 Gm17119-201ENSMUST00000163943 280 ntBASIC2.59□□□□□ -2
Ttc21bQ0HA38 Gm18358-201ENSMUST00000173179 1277 ntBASIC2.59□□□□□ -2
Ttc21bQ0HA38 Mir5099-201ENSMUST00000175257 74 ntBASIC2.59□□□□□ -2
Ttc21bQ0HA38 Gm11168-201ENSMUST00000177722 684 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC2.59□□□□□ -2
Ttc21bQ0HA38 Gm11168-202ENSMUST00000178077 684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.59□□□□□ -2
Ttc21bQ0HA38 Gm23714-201ENSMUST00000179259 105 ntBASIC2.59□□□□□ -2
Ttc21bQ0HA38 Gm29516-201ENSMUST00000190402 468 ntBASIC2.59□□□□□ -2
Ttc21bQ0HA38 Gm37987-201ENSMUST00000194999 825 ntBASIC2.59□□□□□ -2
Ttc21bQ0HA38 AC117232.1-201ENSMUST00000197964 119 ntBASIC2.59□□□□□ -2
Ttc21bQ0HA38 Gm43171-201ENSMUST00000199882 291 ntBASIC2.59□□□□□ -2
Ttc21bQ0HA38 Gm19457-201ENSMUST00000200995 448 ntBASIC2.59□□□□□ -2
Ttc21bQ0HA38 Gm45445-201ENSMUST00000209586 232 ntBASIC2.59□□□□□ -2
Ttc21bQ0HA38 Gm45438-201ENSMUST00000210242 564 ntBASIC2.59□□□□□ -2
Ttc21bQ0HA38 Cwc15-202ENSMUST00000213913 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.59□□□□□ -2
Ttc21bQ0HA38 D730003K21Rik-201ENSMUST00000215052 589 ntTSL 2 BASIC2.59□□□□□ -2
Ttc21bQ0HA38 Gm16261-201ENSMUST00000096813 205 ntBASIC2.59□□□□□ -2
Ttc21bQ0HA38 Gm33962-201ENSMUST00000182643 2592 ntBASIC2.59□□□□□ -2
Ttc21bQ0HA38 C030005K15Rik-201ENSMUST00000166373 1882 ntAPPRIS P1 BASIC2.58□□□□□ -2
Ttc21bQ0HA38 AC133934.2-201ENSMUST00000221729 4129 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Ttc21bQ0HA38 Zfp981-203ENSMUST00000179175 2953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
Ttc21bQ0HA38 Gm26080-201ENSMUST00000104069 131 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Ttc21bQ0HA38 Gm25563-201ENSMUST00000104603 74 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Ttc21bQ0HA38 Gm15112-201ENSMUST00000120152 860 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Ttc21bQ0HA38 Klra17-201ENSMUST00000014687 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
Ttc21bQ0HA38 Gm23538-201ENSMUST00000157535 101 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Ttc21bQ0HA38 Gm5277-201ENSMUST00000164923 556 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Ttc21bQ0HA38 Gm28560-201ENSMUST00000186091 315 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Ttc21bQ0HA38 Gm28334-201ENSMUST00000186653 315 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Ttc21bQ0HA38 Gm28495-201ENSMUST00000188452 315 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Ttc21bQ0HA38 Gm28232-201ENSMUST00000188683 315 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Ttc21bQ0HA38 Gm28481-201ENSMUST00000189231 315 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Ttc21bQ0HA38 Gm29059-201ENSMUST00000191534 315 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Ttc21bQ0HA38 Gm37765-201ENSMUST00000192395 315 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Ttc21bQ0HA38 Gm37237-201ENSMUST00000192893 315 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Ttc21bQ0HA38 Gm36968-201ENSMUST00000193737 315 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Ttc21bQ0HA38 Gm37037-201ENSMUST00000194475 424 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Ttc21bQ0HA38 Gm38290-201ENSMUST00000195238 315 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Ttc21bQ0HA38 Ranbp2-ps12-201ENSMUST00000197110 386 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Ttc21bQ0HA38 Gm19147-201ENSMUST00000199622 652 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Ttc21bQ0HA38 Gm44041-201ENSMUST00000203678 396 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Ttc21bQ0HA38 AC192616.3-201ENSMUST00000220797 1124 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Ttc21bQ0HA38 Gm46367-202ENSMUST00000222771 501 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
Ttc21bQ0HA38 AC192334.2-201ENSMUST00000223087 1091 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Ttc21bQ0HA38 Snord104-201ENSMUST00000083192 70 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Ttc21bQ0HA38 Gm37630-201ENSMUST00000194210 1456 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Ttc21bQ0HA38 Igkv13-87-201ENSMUST00000114214 286 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Ttc21bQ0HA38 Gm14867-201ENSMUST00000120156 866 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Ttc21bQ0HA38 Gm23317-201ENSMUST00000157999 129 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Ttc21bQ0HA38 Gm22765-201ENSMUST00000158371 128 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Ttc21bQ0HA38 Vmn1r-ps10-201ENSMUST00000176165 889 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Ttc21bQ0HA38 1700010I02Rik-202ENSMUST00000188525 430 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
Ttc21bQ0HA38 Gm37892-201ENSMUST00000192018 437 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
Ttc21bQ0HA38 Gm43729-201ENSMUST00000196949 499 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
Ttc21bQ0HA38 Gm46193-201ENSMUST00000219399 364 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Ttc21bQ0HA38 Selenok-ps5-201ENSMUST00000221048 278 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Ttc21bQ0HA38 AC160930.1-201ENSMUST00000227194 337 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Ttc21bQ0HA38 AC154276.2-201ENSMUST00000227707 309 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Ttc21bQ0HA38 Olfr1461-201ENSMUST00000053772 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.57□□□□□ -2
Ttc21bQ0HA38 Mir148b-201ENSMUST00000083626 97 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Ttc21bQ0HA38 1700017N19Rik-207ENSMUST00000190708 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
Ttc21bQ0HA38 Vmn1r69-201ENSMUST00000163658 2558 ntAPPRIS P2 BASIC2.57□□□□□ -2
Ttc21bQ0HA38 Zfp273-201ENSMUST00000012725 2277 ntTSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
Ttc21bQ0HA38 Olfr937-202ENSMUST00000215049 2259 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
Ttc21bQ0HA38 Agmo-201ENSMUST00000049874 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
Ttc21bQ0HA38 Zfp640-202ENSMUST00000224116 1562 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Ttc21bQ0HA38 Gm45262-201ENSMUST00000209917 1463 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Ttc21bQ0HA38 Gm14073-201ENSMUST00000117344 381 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Ttc21bQ0HA38 Gm2830-201ENSMUST00000140330 385 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Ttc21bQ0HA38 Gm2020-201ENSMUST00000145242 579 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Ttc21bQ0HA38 Gm15008-201ENSMUST00000147429 460 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
Ttc21bQ0HA38 Gm24962-201ENSMUST00000157917 109 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Ttc21bQ0HA38 Gm24546-201ENSMUST00000158652 102 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Ttc21bQ0HA38 Gm16588-201ENSMUST00000162889 355 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Ttc21bQ0HA38 Gm17054-201ENSMUST00000169811 259 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Ttc21bQ0HA38 Olfr180-201ENSMUST00000171656 1154 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
Ttc21bQ0HA38 Mir3066-201ENSMUST00000175296 83 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Ttc21bQ0HA38 Gm1553-201ENSMUST00000177934 658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
Ttc21bQ0HA38 Gm18341-201ENSMUST00000197538 622 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Ttc21bQ0HA38 Gm43550-201ENSMUST00000200597 303 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Ttc21bQ0HA38 Gm44478-201ENSMUST00000204875 114 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Ttc21bQ0HA38 Gm44135-201ENSMUST00000205221 368 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Ttc21bQ0HA38 AC105958.2-201ENSMUST00000214167 191 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Ttc21bQ0HA38 CR974485.1-201ENSMUST00000222408 402 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Ttc21bQ0HA38 Tas2r107-201ENSMUST00000065781 1032 ntAPPRIS P1 BASIC2.56□□□□□ -2
Ttc21bQ0HA38 Gm24610-201ENSMUST00000083270 109 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Ttc21bQ0HA38 Gm15113-201ENSMUST00000119280 836 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Ttc21bQ0HA38 Gm12044-201ENSMUST00000120335 213 ntBASIC2.55□□□□□ -2
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