Protein–RNA interactions for Protein: Q01822

Hoxd1, Homeobox protein Hox-D1, mousemouse

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Length 328 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd1Q01822 Gm13076-201ENSMUST00000118041 204 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
Hoxd1Q01822 Gm11693-201ENSMUST00000119625 565 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
Hoxd1Q01822 Gemin6-ps-201ENSMUST00000120444 501 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
Hoxd1Q01822 Gm26102-201ENSMUST00000157251 284 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
Hoxd1Q01822 Gm22038-201ENSMUST00000157277 242 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
Hoxd1Q01822 Gm25341-201ENSMUST00000157461 268 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
Hoxd1Q01822 Gm25184-201ENSMUST00000157753 163 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
Hoxd1Q01822 Gm22435-201ENSMUST00000158552 128 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
Hoxd1Q01822 2210418O10Rik-204ENSMUST00000166464 750 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
Hoxd1Q01822 Gm26195-201ENSMUST00000175035 101 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
Hoxd1Q01822 Gm26141-201ENSMUST00000175299 126 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
Hoxd1Q01822 Gm27245-201ENSMUST00000184385 376 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
Hoxd1Q01822 Gm27608-201ENSMUST00000184822 162 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
Hoxd1Q01822 Gm27624-201ENSMUST00000185047 177 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
Hoxd1Q01822 Gm37029-201ENSMUST00000195773 239 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
Hoxd1Q01822 Gm19202-201ENSMUST00000198096 808 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
Hoxd1Q01822 Gtpbp4-ps6-201ENSMUST00000198160 292 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
Hoxd1Q01822 Gm43739-201ENSMUST00000198294 307 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
Hoxd1Q01822 Obox4-ps25-201ENSMUST00000199090 210 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
Hoxd1Q01822 Vmn2r-ps50-201ENSMUST00000209317 120 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
Hoxd1Q01822 Gm18252-201ENSMUST00000214814 527 ntTSL 5 BASIC3.14□□□□□ -1.91
Hoxd1Q01822 Sprr2i-201ENSMUST00000047264 617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
Hoxd1Q01822 2610044O15Rik8-201ENSMUST00000079272 264 ntTSL 5 BASIC3.14□□□□□ -1.91
Hoxd1Q01822 Gm26447-201ENSMUST00000082448 129 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
Hoxd1Q01822 Gm23721-201ENSMUST00000083005 107 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
Hoxd1Q01822 Olfr681-205ENSMUST00000216247 4729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.14□□□□□ -1.91
Hoxd1Q01822 Gm26696-201ENSMUST00000181941 2848 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
Hoxd1Q01822 Gm44715-201ENSMUST00000209049 3839 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
Hoxd1Q01822 Olfr107-203ENSMUST00000215947 3954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.13□□□□□ -1.91
Hoxd1Q01822 Gm38286-201ENSMUST00000195128 3105 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
Hoxd1Q01822 AC161254.1-201ENSMUST00000220310 3842 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
Hoxd1Q01822 Gm15127-203ENSMUST00000112753 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.13□□□□□ -1.91
Hoxd1Q01822 Olfr609-203ENSMUST00000216360 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.13□□□□□ -1.91
Hoxd1Q01822 Igkv7-33-201ENSMUST00000103376 362 ntAPPRIS ALT2 BASIC3.13□□□□□ -1.91
Hoxd1Q01822 Gm25727-201ENSMUST00000104522 131 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
Hoxd1Q01822 Mir294-201ENSMUST00000104710 84 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
Hoxd1Q01822 Gm12125-201ENSMUST00000117261 736 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
Hoxd1Q01822 Gm13046-201ENSMUST00000117391 501 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
Hoxd1Q01822 Gm13873-201ENSMUST00000119208 427 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
Hoxd1Q01822 Gm15760-201ENSMUST00000119553 283 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
Hoxd1Q01822 Gm22320-201ENSMUST00000157149 312 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
Hoxd1Q01822 Pcgf1-204ENSMUST00000176089 492 ntTSL 5 BASIC3.13□□□□□ -1.91
Hoxd1Q01822 Snhg14-207ENSMUST00000188162 770 ntTSL 5 BASIC3.13□□□□□ -1.91
Hoxd1Q01822 4930452N14Rik-201ENSMUST00000189240 613 ntTSL 1 (best) BASIC3.13□□□□□ -1.91
Hoxd1Q01822 Gm36891-201ENSMUST00000191995 655 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
Hoxd1Q01822 Gm37587-202ENSMUST00000194935 475 ntTSL 3 BASIC3.13□□□□□ -1.91
Hoxd1Q01822 Gm43914-201ENSMUST00000203592 594 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
Hoxd1Q01822 Gm44266-201ENSMUST00000205235 500 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
Hoxd1Q01822 Gm7948-201ENSMUST00000212607 844 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
Hoxd1Q01822 CT009748.1-201ENSMUST00000216068 269 ntTSL 5 BASIC3.13□□□□□ -1.91
Hoxd1Q01822 Gm33654-201ENSMUST00000221704 215 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
Hoxd1Q01822 Gm21937-201ENSMUST00000222825 218 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
Hoxd1Q01822 AC154552.1-201ENSMUST00000222969 202 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
Hoxd1Q01822 AC154276.2-201ENSMUST00000227707 309 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
Hoxd1Q01822 Sprr4-201ENSMUST00000062129 231 ntAPPRIS P1 BASIC3.13□□□□□ -1.91
Hoxd1Q01822 Rps15a-ps1-201ENSMUST00000071120 393 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
Hoxd1Q01822 Snord35b-201ENSMUST00000082833 87 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
Hoxd1Q01822 Gm25410-201ENSMUST00000083758 137 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
Hoxd1Q01822 AC167250.1-201ENSMUST00000213739 3813 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
Hoxd1Q01822 Dmd-203ENSMUST00000114000 14910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.13□□□□□ -1.91
Hoxd1Q01822 4930533N22Rik-201ENSMUST00000206433 3509 ntTSL 1 (best) BASIC3.13□□□□□ -1.91
Hoxd1Q01822 Vmn2r-ps83-201ENSMUST00000173787 2368 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
Hoxd1Q01822 Rictor-201ENSMUST00000061656 9312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.12□□□□□ -1.91
Hoxd1Q01822 Olfr924-202ENSMUST00000217350 3431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.12□□□□□ -1.91
Hoxd1Q01822 Gabra2-203ENSMUST00000197284 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.12□□□□□ -1.91
Hoxd1Q01822 Gm45662-201ENSMUST00000210054 2098 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
Hoxd1Q01822 Igkv1-110-201ENSMUST00000103321 401 ntAPPRIS P1 BASIC3.12□□□□□ -1.91
Hoxd1Q01822 Trav16n-201ENSMUST00000103633 353 ntAPPRIS ALT2 BASIC3.12□□□□□ -1.91
Hoxd1Q01822 Rpl30-ps10-201ENSMUST00000117119 347 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
Hoxd1Q01822 Rpl30-ps3-201ENSMUST00000117928 348 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
Hoxd1Q01822 Gm12191-201ENSMUST00000118307 348 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
Hoxd1Q01822 Gm9703-201ENSMUST00000119573 343 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
Hoxd1Q01822 Rpl30-ps11-201ENSMUST00000119630 345 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
Hoxd1Q01822 Rpl30-ps1-201ENSMUST00000119767 348 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
Hoxd1Q01822 Gm13692-201ENSMUST00000120774 371 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
Hoxd1Q01822 Gm11816-201ENSMUST00000142744 353 ntTSL 3 BASIC3.12□□□□□ -1.91
Hoxd1Q01822 Gm26149-201ENSMUST00000157432 108 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
Hoxd1Q01822 Mir1934-201ENSMUST00000158127 83 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
Hoxd1Q01822 Gm26400-201ENSMUST00000175012 85 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
Hoxd1Q01822 Gm23141-201ENSMUST00000178682 94 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
Hoxd1Q01822 Gm19498-201ENSMUST00000191128 331 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
Hoxd1Q01822 Olfr1070-ps1-201ENSMUST00000215939 388 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
Hoxd1Q01822 AC160865.1-201ENSMUST00000219873 151 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
Hoxd1Q01822 AC129202.2-201ENSMUST00000225123 177 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
Hoxd1Q01822 Gm2710-201ENSMUST00000073196 603 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
Hoxd1Q01822 Rpl30-ps8-201ENSMUST00000076166 345 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
Hoxd1Q01822 Gm10343-201ENSMUST00000096279 348 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
Hoxd1Q01822 Defb33-201ENSMUST00000098908 424 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.12□□□□□ -1.91
Hoxd1Q01822 Gm42639-201ENSMUST00000197061 1871 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
Hoxd1Q01822 Vmn2r42-205ENSMUST00000146278 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.11□□□□□ -1.91
Hoxd1Q01822 Vmn2r37-201ENSMUST00000072787 3081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.11□□□□□ -1.91
Hoxd1Q01822 Gm20345-201ENSMUST00000175839 2414 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
Hoxd1Q01822 Gm37143-201ENSMUST00000195180 3259 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
Hoxd1Q01822 Gm43404-201ENSMUST00000200424 2534 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
Hoxd1Q01822 Gm23941-201ENSMUST00000101953 107 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
Hoxd1Q01822 Gm25272-201ENSMUST00000104293 128 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
Hoxd1Q01822 Gm25967-201ENSMUST00000157168 147 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
Hoxd1Q01822 Gm22098-201ENSMUST00000157930 85 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
Hoxd1Q01822 Gm23581-201ENSMUST00000158531 63 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
Hoxd1Q01822 Gm4761-201ENSMUST00000178086 582 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
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