Protein–RNA interactions for Protein: P97350

Pkp1, Plakophilin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 728 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp1P97350 Gm38071-201ENSMUST00000195792 3378 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Pkp1P97350 9230113P08Rik-201ENSMUST00000176049 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
Pkp1P97350 Rpl30-ps10-201ENSMUST00000117119 347 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Pkp1P97350 Gm12191-201ENSMUST00000118307 348 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Pkp1P97350 Gm12803-201ENSMUST00000118907 821 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Pkp1P97350 Gm9703-201ENSMUST00000119573 343 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Pkp1P97350 Rpl30-ps1-201ENSMUST00000119767 348 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Pkp1P97350 Gm23183-201ENSMUST00000122595 323 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Pkp1P97350 Gm25270-201ENSMUST00000122606 138 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Pkp1P97350 Gm15718-201ENSMUST00000131085 311 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
Pkp1P97350 Ssxb6-201ENSMUST00000138642 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
Pkp1P97350 1700047A11Rik-202ENSMUST00000153552 622 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
Pkp1P97350 Rpl30-ps2-201ENSMUST00000160070 291 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Pkp1P97350 Vmn1r-ps68-201ENSMUST00000174638 399 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Pkp1P97350 Gm26870-201ENSMUST00000181242 1170 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
Pkp1P97350 Mir6916-201ENSMUST00000184514 63 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Pkp1P97350 Gm29414-201ENSMUST00000185379 448 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
Pkp1P97350 Gm28399-201ENSMUST00000186221 318 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Pkp1P97350 Gm28572-201ENSMUST00000187444 318 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Pkp1P97350 Gm8242-202ENSMUST00000193056 475 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Pkp1P97350 Gm44012-201ENSMUST00000204154 424 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
Pkp1P97350 Gm19140-201ENSMUST00000209790 421 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Pkp1P97350 Gm45455-202ENSMUST00000211156 630 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
Pkp1P97350 Gm34408-201ENSMUST00000222104 655 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
Pkp1P97350 Gm4945-201ENSMUST00000075152 453 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Pkp1P97350 Rpl30-ps8-201ENSMUST00000076166 345 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Pkp1P97350 Olfr1204-201ENSMUST00000078631 930 ntAPPRIS P1 BASIC2.84□□□□□ -1.95
Pkp1P97350 Gm10343-201ENSMUST00000096279 348 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Pkp1P97350 Olfr1132-202ENSMUST00000216082 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.96
Pkp1P97350 A930027P06Rik-201ENSMUST00000221298 2975 ntBASIC2.84□□□□□ -1.96
Pkp1P97350 Esp34-201ENSMUST00000173055 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.96
Pkp1P97350 Esp34-202ENSMUST00000178654 1413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.96
Pkp1P97350 Zfp932-207ENSMUST00000187241 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
Pkp1P97350 Olfr1309-205ENSMUST00000216948 5168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
Pkp1P97350 Olfr218-203ENSMUST00000216603 3623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
Pkp1P97350 Gm10486-201ENSMUST00000101647 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
Pkp1P97350 Gm13614-201ENSMUST00000117306 503 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Pkp1P97350 Sult2a-ps3-201ENSMUST00000117899 428 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Pkp1P97350 Gm13085-201ENSMUST00000118356 171 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Pkp1P97350 Rpl23a-ps13-201ENSMUST00000120350 441 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Pkp1P97350 Gm23583-201ENSMUST00000158533 289 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Pkp1P97350 Tcrg-C3-201ENSMUST00000164407 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
Pkp1P97350 Gm21754-201ENSMUST00000177550 479 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Pkp1P97350 Gm21776-201ENSMUST00000177676 1083 ntAPPRIS P1 BASIC2.83□□□□□ -1.96
Pkp1P97350 Gm24264-201ENSMUST00000179835 94 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Pkp1P97350 Gm21913-201ENSMUST00000179880 1083 ntAPPRIS P1 BASIC2.83□□□□□ -1.96
Pkp1P97350 Gm27520-201ENSMUST00000184872 81 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Pkp1P97350 Olfr468-ps1-201ENSMUST00000207203 593 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Pkp1P97350 AC109214.2-201ENSMUST00000220089 358 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Pkp1P97350 Olfr769-201ENSMUST00000050915 1084 ntAPPRIS P1 BASIC2.83□□□□□ -1.96
Pkp1P97350 Gm23614-201ENSMUST00000082598 107 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Pkp1P97350 Gm24045-201ENSMUST00000083113 98 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Pkp1P97350 Vmn1r76-203ENSMUST00000226947 8145 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
Pkp1P97350 Cp-202ENSMUST00000091309 4029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
Pkp1P97350 Olfr299-202ENSMUST00000217253 4479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
Pkp1P97350 Vmn2r71-201ENSMUST00000172338 2568 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
Pkp1P97350 Ogn-201ENSMUST00000021822 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
Pkp1P97350 Olfr218-202ENSMUST00000215844 3410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
Pkp1P97350 Gm44821-201ENSMUST00000208212 2002 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Pkp1P97350 Gm9009-201ENSMUST00000117321 326 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Pkp1P97350 Gm24959-201ENSMUST00000157924 146 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Pkp1P97350 Gm27490-201ENSMUST00000184754 128 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Pkp1P97350 Gm38167-201ENSMUST00000195704 1178 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Pkp1P97350 Gm42647-201ENSMUST00000195939 459 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Pkp1P97350 Gm30784-201ENSMUST00000204491 794 ntTSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
Pkp1P97350 Gm7495-201ENSMUST00000215099 426 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Pkp1P97350 AC117202.3-201ENSMUST00000228532 310 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Pkp1P97350 Ear14-201ENSMUST00000049559 468 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Pkp1P97350 Olfr235-201ENSMUST00000073507 1079 ntAPPRIS P1 BASIC2.82□□□□□ -1.96
Pkp1P97350 Olfr1095-201ENSMUST00000099874 927 ntAPPRIS P1 BASIC2.82□□□□□ -1.96
Pkp1P97350 Zc3h14-201ENSMUST00000021399 1430 ntTSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
Pkp1P97350 Muc16-204ENSMUST00000208663 25437 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
Pkp1P97350 Gm9218-201ENSMUST00000121068 2694 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Pkp1P97350 Olfr352-202ENSMUST00000217325 3337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
Pkp1P97350 Gm25728-201ENSMUST00000104525 159 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Pkp1P97350 Gm13541-201ENSMUST00000119519 283 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Pkp1P97350 Spink2-203ENSMUST00000121825 643 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
Pkp1P97350 Gm14364-201ENSMUST00000129209 267 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Pkp1P97350 Mir3076-201ENSMUST00000175415 60 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Pkp1P97350 Gm23862-201ENSMUST00000180342 94 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Pkp1P97350 Gm26968-201ENSMUST00000182894 481 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Pkp1P97350 Mir7013-201ENSMUST00000183540 72 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Pkp1P97350 Mir6353-201ENSMUST00000183596 113 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Pkp1P97350 Gm27245-201ENSMUST00000184385 376 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Pkp1P97350 Mir6371-201ENSMUST00000184470 111 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Pkp1P97350 Gm29597-201ENSMUST00000188035 308 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Pkp1P97350 Gm29335-201ENSMUST00000188361 459 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Pkp1P97350 1700010I02Rik-202ENSMUST00000188525 430 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
Pkp1P97350 Gm6059-201ENSMUST00000196903 340 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Pkp1P97350 Gm43239-201ENSMUST00000200131 201 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Pkp1P97350 Gm7039-201ENSMUST00000205138 346 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Pkp1P97350 Olfr1430-ps1-201ENSMUST00000207422 917 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Pkp1P97350 Olfr1009-201ENSMUST00000055517 945 ntAPPRIS P1 BASIC2.81□□□□□ -1.96
Pkp1P97350 Gm25853-201ENSMUST00000082793 132 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Pkp1P97350 Gm37598-201ENSMUST00000194506 1301 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Pkp1P97350 Adgrg4-204ENSMUST00000153784 9329 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
Pkp1P97350 Gm37402-201ENSMUST00000194525 5000 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Pkp1P97350 Gm37788-201ENSMUST00000193958 2705 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Pkp1P97350 Olfr1370-204ENSMUST00000215806 4322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
Pkp1P97350 Olfr1240-202ENSMUST00000216123 4603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
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