Protein–RNA interactions for Protein: P41105

Rpl28, 60S ribosomal protein L28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl28P41105 Mup-ps14-201ENSMUST00000118437 532 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
Rpl28P41105 Gm12871-201ENSMUST00000118758 438 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
Rpl28P41105 Gm14292-201ENSMUST00000118761 456 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
Rpl28P41105 Gm11471-201ENSMUST00000121824 198 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
Rpl28P41105 Scgb1b26-ps-201ENSMUST00000121845 291 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
Rpl28P41105 Gm14770-201ENSMUST00000122197 312 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
Rpl28P41105 Mup-ps2-201ENSMUST00000142602 533 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
Rpl28P41105 Gm22535-201ENSMUST00000158174 119 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
Rpl28P41105 Gm24358-201ENSMUST00000158424 288 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
Rpl28P41105 Ighv1-78-201ENSMUST00000163670 294 ntAPPRIS P1 BASIC1.28□□□□□ -2.2
Rpl28P41105 Vmn1r77-201ENSMUST00000164446 921 ntAPPRIS P2 BASIC1.28□□□□□ -2.2
Rpl28P41105 Gm24656-201ENSMUST00000177548 132 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
Rpl28P41105 Gm25194-201ENSMUST00000177987 79 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
Rpl28P41105 Gm9892-201ENSMUST00000182415 992 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
Rpl28P41105 Gm28000-201ENSMUST00000184380 85 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
Rpl28P41105 Gm5329-201ENSMUST00000186898 463 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
Rpl28P41105 Gm28643-201ENSMUST00000188811 356 ntTSL 5 BASIC1.28□□□□□ -2.2
Rpl28P41105 Gm38044-201ENSMUST00000192964 487 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
Rpl28P41105 Gm23370-202ENSMUST00000197008 129 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
Rpl28P41105 Gm43026-201ENSMUST00000202972 325 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
Rpl28P41105 Gm44125-201ENSMUST00000203068 448 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
Rpl28P41105 Olfr746-202ENSMUST00000218546 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.28□□□□□ -2.2
Rpl28P41105 AC093316.1-201ENSMUST00000218793 529 ntTSL 5 BASIC1.28□□□□□ -2.2
Rpl28P41105 Gm7065-201ENSMUST00000222150 474 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
Rpl28P41105 Gm7214-201ENSMUST00000222428 272 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
Rpl28P41105 CT025579.1-201ENSMUST00000223779 366 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
Rpl28P41105 S100a11-201ENSMUST00000029515 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.28□□□□□ -2.2
Rpl28P41105 Olfr916-201ENSMUST00000081196 933 ntAPPRIS P1 BASIC1.28□□□□□ -2.2
Rpl28P41105 Gm22061-201ENSMUST00000082557 107 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
Rpl28P41105 Gm22974-201ENSMUST00000083301 103 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
Rpl28P41105 Vmn1r85-201ENSMUST00000094829 927 ntAPPRIS P1 BASIC1.28□□□□□ -2.2
Rpl28P41105 Olfr1253-204ENSMUST00000215988 6332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.27□□□□□ -2.21
Rpl28P41105 Vmn1r178-203ENSMUST00000226489 2644 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
Rpl28P41105 Gm26077-201ENSMUST00000104064 123 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
Rpl28P41105 Gm25529-201ENSMUST00000104850 92 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
Rpl28P41105 Gm14401-203ENSMUST00000108970 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.27□□□□□ -2.21
Rpl28P41105 Gm24907-201ENSMUST00000116932 128 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
Rpl28P41105 Gm15183-201ENSMUST00000118933 348 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
Rpl28P41105 Gm28305-201ENSMUST00000147249 365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.27□□□□□ -2.21
Rpl28P41105 Gm3025-201ENSMUST00000163454 489 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
Rpl28P41105 Gm17555-201ENSMUST00000164042 1113 ntAPPRIS P1 BASIC1.27□□□□□ -2.21
Rpl28P41105 Gm2878-201ENSMUST00000170173 486 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
Rpl28P41105 Vmn2r-ps33-201ENSMUST00000175691 904 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
Rpl28P41105 Gm26177-201ENSMUST00000178683 107 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
Rpl28P41105 Gm29600-201ENSMUST00000188687 377 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
Rpl28P41105 Gm37778-201ENSMUST00000191732 190 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
Rpl28P41105 Gm42672-201ENSMUST00000197821 352 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
Rpl28P41105 Gm43431-201ENSMUST00000198577 340 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
Rpl28P41105 Gm43083-201ENSMUST00000199594 476 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
Rpl28P41105 Gm45636-201ENSMUST00000210497 1064 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
Rpl28P41105 Gm19709-201ENSMUST00000215403 482 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
Rpl28P41105 AC168062.2-201ENSMUST00000228907 422 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
Rpl28P41105 Mucl2-201ENSMUST00000037685 639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.27□□□□□ -2.21
Rpl28P41105 Gm22265-201ENSMUST00000082947 116 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
Rpl28P41105 Mir300-201ENSMUST00000083485 79 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
Rpl28P41105 Gm23040-201ENSMUST00000083869 163 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
Rpl28P41105 Olfr987-201ENSMUST00000099929 1075 ntAPPRIS P1 BASIC1.27□□□□□ -2.21
Rpl28P41105 Gm42635-201ENSMUST00000200266 2571 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
Rpl28P41105 Olfr67-201ENSMUST00000183254 3851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.27□□□□□ -2.21
Rpl28P41105 Vmn2r-ps83-201ENSMUST00000173787 2368 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
Rpl28P41105 Gm23551-201ENSMUST00000116852 121 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
Rpl28P41105 Gm12765-201ENSMUST00000117273 615 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
Rpl28P41105 Gm12941-201ENSMUST00000117934 220 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
Rpl28P41105 Gm2003-201ENSMUST00000118537 636 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
Rpl28P41105 Gm6664-201ENSMUST00000119138 468 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
Rpl28P41105 Gm15452-201ENSMUST00000119877 240 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
Rpl28P41105 Gm14898-201ENSMUST00000120202 645 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
Rpl28P41105 Gm15536-201ENSMUST00000121411 114 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
Rpl28P41105 Gm22386-201ENSMUST00000158192 129 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
Rpl28P41105 Gm25658-201ENSMUST00000158472 128 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
Rpl28P41105 Gm17063-201ENSMUST00000168135 456 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
Rpl28P41105 Olfr306-ps1-201ENSMUST00000174677 743 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
Rpl28P41105 Gm21744-201ENSMUST00000178403 662 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
Rpl28P41105 Gm21171-201ENSMUST00000180048 673 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
Rpl28P41105 Gm23648-201ENSMUST00000180301 107 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
Rpl28P41105 1810026B05Rik-201ENSMUST00000183916 432 ntTSL 3 BASIC1.26□□□□□ -2.21
Rpl28P41105 Gm27979-201ENSMUST00000185126 56 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
Rpl28P41105 Gm29413-201ENSMUST00000186019 880 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
Rpl28P41105 Gm28870-201ENSMUST00000187033 880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.26□□□□□ -2.21
Rpl28P41105 Gm28700-201ENSMUST00000187614 579 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
Rpl28P41105 Gm29639-201ENSMUST00000188375 580 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
Rpl28P41105 Gm28843-201ENSMUST00000189198 678 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
Rpl28P41105 Gm29546-201ENSMUST00000191171 678 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
Rpl28P41105 Gm37533-201ENSMUST00000193848 545 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
Rpl28P41105 Mir497-201ENSMUST00000200557 84 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
Rpl28P41105 4930401A07Rik-201ENSMUST00000214657 746 ntTSL 1 (best) BASIC1.26□□□□□ -2.21
Rpl28P41105 AC144671.1-201ENSMUST00000215265 99 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
Rpl28P41105 AC122225.1-201ENSMUST00000215641 369 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
Rpl28P41105 Gm18242-201ENSMUST00000218455 542 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
Rpl28P41105 AC152951.1-201ENSMUST00000218907 266 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
Rpl28P41105 Gm25130-201ENSMUST00000082650 156 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
Rpl28P41105 Gm22443-201ENSMUST00000082890 107 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
Rpl28P41105 Gm23506-201ENSMUST00000083077 107 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
Rpl28P41105 Mir301-201ENSMUST00000083655 86 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
Rpl28P41105 Zfp966-201ENSMUST00000108949 2939 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.26□□□□□ -2.21
Rpl28P41105 Olfr1018-202ENSMUST00000214416 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.26□□□□□ -2.21
Rpl28P41105 Gm42536-201ENSMUST00000197562 1613 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
Rpl28P41105 Mir344e-201ENSMUST00000104677 66 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
Rpl28P41105 Cypt15-201ENSMUST00000115114 519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.25□□□□□ -2.21
Rpl28P41105 Gm14932-201ENSMUST00000117112 453 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
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