Protein–RNA interactions for Protein: P0DMN7

Amd1, S-adenosylmethionine decarboxylase proenzyme 1, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Amd1P0DMN7 Gm26622-201ENSMUST00000180520 298 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Amd1P0DMN7 Gm29370-202ENSMUST00000187476 499 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Amd1P0DMN7 1700063A18Rik-201ENSMUST00000190901 356 ntTSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
Amd1P0DMN7 Trav7d-2-201ENSMUST00000200127 337 ntAPPRIS P1 BASIC2.9□□□□□ -1.95
Amd1P0DMN7 Gm19252-201ENSMUST00000204705 305 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Amd1P0DMN7 Zfp813-ps-202ENSMUST00000204773 618 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
Amd1P0DMN7 Olfr662-ps1-201ENSMUST00000210704 396 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Amd1P0DMN7 Gm45730-201ENSMUST00000212560 395 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Amd1P0DMN7 Olfr927-ps1-201ENSMUST00000216759 782 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Amd1P0DMN7 Gm19563-201ENSMUST00000222031 270 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Amd1P0DMN7 Prl-203ENSMUST00000224228 888 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.9□□□□□ -1.95
Amd1P0DMN7 Gm23932-201ENSMUST00000082914 107 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Amd1P0DMN7 Gm22577-201ENSMUST00000083731 109 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Amd1P0DMN7 Gm813-201ENSMUST00000099663 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
Amd1P0DMN7 Vmn1r211-202ENSMUST00000228645 5447 ntAPPRIS P1 BASIC2.9□□□□□ -1.95
Amd1P0DMN7 Gm381-201ENSMUST00000117443 2037 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Amd1P0DMN7 Olfr1461-202ENSMUST00000207113 3481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Amd1P0DMN7 Gm12128-201ENSMUST00000131013 2914 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
Amd1P0DMN7 Olfr811-202ENSMUST00000215058 2508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Amd1P0DMN7 Gm15084-201ENSMUST00000178585 1502 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Amd1P0DMN7 Fam111a-203ENSMUST00000144662 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Amd1P0DMN7 Gm26147-201ENSMUST00000104479 114 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Amd1P0DMN7 Mir743b-201ENSMUST00000104751 77 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Amd1P0DMN7 Gm5483-201ENSMUST00000114858 414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
Amd1P0DMN7 Gm15381-201ENSMUST00000121501 1156 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Amd1P0DMN7 Gm12023-201ENSMUST00000145182 520 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Amd1P0DMN7 Gm24504-201ENSMUST00000157679 100 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Amd1P0DMN7 Ear10-201ENSMUST00000159175 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
Amd1P0DMN7 Gm20543-201ENSMUST00000174200 726 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Amd1P0DMN7 Gm26061-201ENSMUST00000175584 108 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Amd1P0DMN7 Gm25397-201ENSMUST00000176951 92 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Amd1P0DMN7 Gm9022-202ENSMUST00000183285 483 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Amd1P0DMN7 Gtpbp4-ps4-201ENSMUST00000184813 258 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Amd1P0DMN7 Gm29012-201ENSMUST00000187882 469 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Amd1P0DMN7 Gm18956-201ENSMUST00000192857 480 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Amd1P0DMN7 Mir7116-201ENSMUST00000195956 70 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Amd1P0DMN7 Gm36831-201ENSMUST00000196485 631 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Amd1P0DMN7 Gm44391-201ENSMUST00000198490 93 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Amd1P0DMN7 Gm44336-201ENSMUST00000203696 468 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Amd1P0DMN7 Gm44941-201ENSMUST00000204216 627 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Amd1P0DMN7 Olfr192-203ENSMUST00000206214 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Amd1P0DMN7 Fam81b-201ENSMUST00000208418 2760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Amd1P0DMN7 Olfr499-ps1-201ENSMUST00000208811 930 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Amd1P0DMN7 Gm45513-201ENSMUST00000210228 376 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Amd1P0DMN7 AC160031.2-201ENSMUST00000218242 274 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Amd1P0DMN7 Gm33680-201ENSMUST00000219336 576 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Amd1P0DMN7 Gm19326-201ENSMUST00000219818 326 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Amd1P0DMN7 1700015C15Rik-201ENSMUST00000221465 374 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
Amd1P0DMN7 S100z-201ENSMUST00000022186 399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
Amd1P0DMN7 AC127371.1-202ENSMUST00000228923 306 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Amd1P0DMN7 Gm23615-201ENSMUST00000082602 65 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Amd1P0DMN7 Gm24045-201ENSMUST00000083113 98 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Amd1P0DMN7 Slco1a4-203ENSMUST00000165990 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
Amd1P0DMN7 Gm45039-201ENSMUST00000209181 3477 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Amd1P0DMN7 Gm37320-201ENSMUST00000192781 4953 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Amd1P0DMN7 Olfr235-203ENSMUST00000214551 2240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Amd1P0DMN7 Gm37661-201ENSMUST00000191863 1550 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Amd1P0DMN7 Olfr913-201ENSMUST00000081095 2441 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Amd1P0DMN7 Gm14823-201ENSMUST00000117698 238 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Amd1P0DMN7 Olfr1169-ps1-201ENSMUST00000121437 233 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Amd1P0DMN7 Gm25107-201ENSMUST00000122472 129 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Amd1P0DMN7 Gm8121-201ENSMUST00000153583 499 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Amd1P0DMN7 Gm13853-201ENSMUST00000155496 557 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Amd1P0DMN7 Gm22037-201ENSMUST00000157280 296 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Amd1P0DMN7 Krtap27-1-201ENSMUST00000165580 646 ntAPPRIS P1 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Amd1P0DMN7 Gm7925-201ENSMUST00000166690 401 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Amd1P0DMN7 Gm20450-201ENSMUST00000173652 147 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Amd1P0DMN7 Gm18520-201ENSMUST00000174783 658 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Amd1P0DMN7 Rpl31-ps7-201ENSMUST00000180629 379 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Amd1P0DMN7 Gm28008-201ENSMUST00000184021 186 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Amd1P0DMN7 Gm29330-201ENSMUST00000190032 699 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Amd1P0DMN7 AC129541.1-201ENSMUST00000226940 523 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Amd1P0DMN7 Defa25-201ENSMUST00000095425 279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
Amd1P0DMN7 Gm23741-201ENSMUST00000097237 171 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Amd1P0DMN7 Gm816-201ENSMUST00000191156 2456 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
Amd1P0DMN7 Samd9l-201ENSMUST00000120087 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
Amd1P0DMN7 Olfr1447-203ENSMUST00000216989 2586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Amd1P0DMN7 AC154481.2-201ENSMUST00000222526 3175 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Amd1P0DMN7 Scai-201ENSMUST00000038874 10709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
Amd1P0DMN7 Gm32693-201ENSMUST00000196538 2402 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
Amd1P0DMN7 Pak3-202ENSMUST00000112863 8657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
Amd1P0DMN7 Gm44846-201ENSMUST00000207127 3243 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Amd1P0DMN7 Gm14001-201ENSMUST00000118847 247 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Amd1P0DMN7 Gm14883-201ENSMUST00000120179 157 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Amd1P0DMN7 Gm23886-201ENSMUST00000122684 313 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Amd1P0DMN7 Gm23169-201ENSMUST00000157157 112 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Amd1P0DMN7 Gm22085-201ENSMUST00000158344 110 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Amd1P0DMN7 Gm16569-201ENSMUST00000160526 314 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Amd1P0DMN7 Gm24019-201ENSMUST00000178620 107 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Amd1P0DMN7 Gm26243-201ENSMUST00000179260 107 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Amd1P0DMN7 Gm23793-201ENSMUST00000179396 117 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Amd1P0DMN7 Mir7k-201ENSMUST00000184115 110 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Amd1P0DMN7 Mir6372-201ENSMUST00000185114 109 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Amd1P0DMN7 Gm36992-201ENSMUST00000195463 428 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
Amd1P0DMN7 Gm45772-201ENSMUST00000212961 240 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Amd1P0DMN7 Gm5023-201ENSMUST00000217442 587 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Amd1P0DMN7 5430401H09Rik-201ENSMUST00000218145 1076 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
Amd1P0DMN7 AC122905.2-201ENSMUST00000220325 269 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Amd1P0DMN7 Gm46367-202ENSMUST00000222771 501 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
Amd1P0DMN7 Snord68-201ENSMUST00000082516 86 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 1225 ms