Protein–RNA interactions for Protein: O35085

Arx, Homeobox protein ARX, mousemouse

Predictions only

Length 564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ArxO35085 Gm28257-201ENSMUST00000185244 463 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
ArxO35085 Gm28304-201ENSMUST00000185977 312 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
ArxO35085 Gm29256-201ENSMUST00000189094 312 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
ArxO35085 Gm28484-201ENSMUST00000190606 312 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
ArxO35085 Gm43635-201ENSMUST00000202533 352 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
ArxO35085 Gm31717-201ENSMUST00000213044 668 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
ArxO35085 AC174459.2-201ENSMUST00000226036 160 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
ArxO35085 Cdh19-201ENSMUST00000094626 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
ArxO35085 AC153964.1-201ENSMUST00000219677 3142 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
ArxO35085 Mgat4c-201ENSMUST00000020039 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
ArxO35085 Olfm3-201ENSMUST00000051309 3928 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
ArxO35085 Gm9921-201ENSMUST00000173293 4399 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
ArxO35085 Gm13439-201ENSMUST00000117541 409 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
ArxO35085 Gm29397-201ENSMUST00000185205 333 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
ArxO35085 Gm29097-201ENSMUST00000190273 422 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
ArxO35085 Gm38991-201ENSMUST00000205504 138 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
ArxO35085 Gm15101-201ENSMUST00000178818 1502 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
ArxO35085 Olfr58-202ENSMUST00000215112 2454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
ArxO35085 Oog1-202ENSMUST00000222112 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
ArxO35085 Olfr1245-202ENSMUST00000217402 2610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
ArxO35085 Olfr110-201ENSMUST00000168318 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
ArxO35085 AC142245.1-201ENSMUST00000226611 1505 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
ArxO35085 Gm37498-201ENSMUST00000193524 4002 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
ArxO35085 Znrd1-201ENSMUST00000113669 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
ArxO35085 Gm23098-201ENSMUST00000157552 299 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
ArxO35085 Gm23262-201ENSMUST00000158323 168 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
ArxO35085 A930005H10Rik-205ENSMUST00000187055 436 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
ArxO35085 Gm28920-201ENSMUST00000189957 699 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
ArxO35085 Igkv1-108-201ENSMUST00000198926 298 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
ArxO35085 Gm32222-201ENSMUST00000203296 298 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
ArxO35085 Gm44543-201ENSMUST00000209136 396 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
ArxO35085 Olfr1070-ps1-201ENSMUST00000215939 388 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
ArxO35085 Olfr746-201ENSMUST00000080616 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.35□□□□□ -1.55
ArxO35085 Gm23510-201ENSMUST00000083083 163 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
ArxO35085 Gm23679-201ENSMUST00000083161 119 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
ArxO35085 Gm26165-201ENSMUST00000083791 138 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
ArxO35085 Cntn6-201ENSMUST00000089215 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
ArxO35085 Cysltr1-202ENSMUST00000113480 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
ArxO35085 Vmn1r47-202ENSMUST00000227229 6733 ntAPPRIS P1 BASIC5.34□□□□□ -1.55
ArxO35085 Vmn1r47-204ENSMUST00000228680 6717 ntAPPRIS P1 BASIC5.34□□□□□ -1.55
ArxO35085 Vmn1r-ps125-201ENSMUST00000117767 290 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
ArxO35085 Ppp1r2-ps7-201ENSMUST00000140102 609 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
ArxO35085 Gm15008-201ENSMUST00000147429 460 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
ArxO35085 Gm22816-201ENSMUST00000157450 117 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
ArxO35085 Gm17100-201ENSMUST00000168963 272 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
ArxO35085 Gm38171-201ENSMUST00000195716 478 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
ArxO35085 Gm42739-201ENSMUST00000200687 226 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
ArxO35085 Gm45392-201ENSMUST00000210441 214 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
ArxO35085 Gm9712-201ENSMUST00000210842 311 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
ArxO35085 Gm35101-201ENSMUST00000219218 243 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
ArxO35085 AC123533.1-201ENSMUST00000227782 446 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
ArxO35085 Mir496a-201ENSMUST00000093627 79 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
ArxO35085 Olfr1369-ps1-204ENSMUST00000215207 3794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
ArxO35085 Vmn1r216-203ENSMUST00000228389 10213 ntAPPRIS P1 BASIC5.34□□□□□ -1.55
ArxO35085 Gm7903-201ENSMUST00000113172 3677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
ArxO35085 Gm5128-201ENSMUST00000113173 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
ArxO35085 Plek-202ENSMUST00000102881 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
ArxO35085 Zfp979-201ENSMUST00000037565 2558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
ArxO35085 Btbd35f3-201ENSMUST00000140300 1943 ntAPPRIS P1 BASIC5.33□□□□□ -1.56
ArxO35085 Gm24582-201ENSMUST00000103967 103 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
ArxO35085 Gm15010-201ENSMUST00000117153 407 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
ArxO35085 Gm11698-201ENSMUST00000117948 455 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
ArxO35085 Gm14586-201ENSMUST00000119571 408 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
ArxO35085 Gm14714-201ENSMUST00000119743 439 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
ArxO35085 Gm11448-201ENSMUST00000120427 450 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
ArxO35085 Gm15466-201ENSMUST00000122299 333 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
ArxO35085 Cldn34-ps-201ENSMUST00000145498 600 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
ArxO35085 Gm24751-201ENSMUST00000157844 102 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
ArxO35085 Gm23047-201ENSMUST00000177661 94 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
ArxO35085 Ighv6-5-201ENSMUST00000179796 297 ntAPPRIS P1 BASIC5.33□□□□□ -1.56
ArxO35085 Gm27883-201ENSMUST00000183941 102 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
ArxO35085 AC164161.1-201ENSMUST00000214076 639 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
ArxO35085 1700010L04Rik-201ENSMUST00000032872 330 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
ArxO35085 Gm25793-201ENSMUST00000083287 107 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
ArxO35085 Gm18751-201ENSMUST00000185777 2013 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
ArxO35085 Ntrk3-201ENSMUST00000039431 19703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
ArxO35085 4930524B17Rik-201ENSMUST00000200755 1870 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
ArxO35085 Olfr1130-202ENSMUST00000216580 2648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
ArxO35085 Zfp987-201ENSMUST00000091878 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
ArxO35085 Gm15058-201ENSMUST00000117689 458 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
ArxO35085 Gm11460-201ENSMUST00000118200 361 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
ArxO35085 Gm12876-201ENSMUST00000120975 408 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
ArxO35085 Gm24908-201ENSMUST00000157294 127 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
ArxO35085 Gm24846-201ENSMUST00000158033 108 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
ArxO35085 Gm8292-201ENSMUST00000162574 396 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
ArxO35085 Mir5134-201ENSMUST00000175529 78 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
ArxO35085 Gm29512-201ENSMUST00000185544 315 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
ArxO35085 Gm28110-201ENSMUST00000185782 315 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
ArxO35085 Gm28263-201ENSMUST00000185884 400 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
ArxO35085 Gm29057-201ENSMUST00000186468 315 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
ArxO35085 Gm6802-202ENSMUST00000186566 126 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
ArxO35085 Gm29661-201ENSMUST00000186781 315 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
ArxO35085 Gm28737-201ENSMUST00000186808 315 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
ArxO35085 Gm29118-201ENSMUST00000186908 315 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
ArxO35085 Gm28433-201ENSMUST00000187085 315 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
ArxO35085 Gm28759-201ENSMUST00000187621 315 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
ArxO35085 Gm28831-201ENSMUST00000187739 315 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
ArxO35085 Gm28200-201ENSMUST00000187778 315 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
ArxO35085 Snhg14-207ENSMUST00000188162 770 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
ArxO35085 Gm28752-201ENSMUST00000188340 315 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.2 ms