Protein–RNA interactions for Protein: B1ASB6

Spocd1, SPOC domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 936 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spocd1B1ASB6 Gm25175-201ENSMUST00000178712 79 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
Spocd1B1ASB6 Gm23922-201ENSMUST00000178792 79 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
Spocd1B1ASB6 Gm22450-201ENSMUST00000179641 107 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
Spocd1B1ASB6 Gm24657-201ENSMUST00000180085 79 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
Spocd1B1ASB6 Gm22996-201ENSMUST00000180236 79 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
Spocd1B1ASB6 Mir7047-201ENSMUST00000184595 64 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
Spocd1B1ASB6 Gm34732-201ENSMUST00000195441 445 ntTSL 3 BASIC4.43□□□□□ -1.7
Spocd1B1ASB6 Gm42526-201ENSMUST00000198956 393 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
Spocd1B1ASB6 Gm44470-201ENSMUST00000203913 142 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
Spocd1B1ASB6 AC126673.3-201ENSMUST00000223414 3829 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
Spocd1B1ASB6 CT025689.3-201ENSMUST00000223817 301 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
Spocd1B1ASB6 AC133598.4-202ENSMUST00000225267 469 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
Spocd1B1ASB6 Ccl5-201ENSMUST00000035938 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
Spocd1B1ASB6 Gm23239-201ENSMUST00000083006 181 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
Spocd1B1ASB6 Gm26071-201ENSMUST00000083261 107 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
Spocd1B1ASB6 Mir10a-201ENSMUST00000083585 110 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
Spocd1B1ASB6 Gm24521-201ENSMUST00000083958 107 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
Spocd1B1ASB6 Olfr814-203ENSMUST00000216966 3819 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.43□□□□□ -1.7
Spocd1B1ASB6 Gm42486-201ENSMUST00000200369 3486 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
Spocd1B1ASB6 Olfr933-202ENSMUST00000216238 4475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.42□□□□□ -1.7
Spocd1B1ASB6 Olfr1019-202ENSMUST00000213515 3031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.42□□□□□ -1.7
Spocd1B1ASB6 9330158H04Rik-201ENSMUST00000101535 3174 ntTSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
Spocd1B1ASB6 Gm23472-201ENSMUST00000101806 191 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
Spocd1B1ASB6 Gm11065-201ENSMUST00000111462 228 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
Spocd1B1ASB6 Gm14564-201ENSMUST00000122159 294 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
Spocd1B1ASB6 Gm12958-201ENSMUST00000141242 674 ntTSL 3 BASIC4.42□□□□□ -1.7
Spocd1B1ASB6 Gm11240-201ENSMUST00000142047 751 ntTSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
Spocd1B1ASB6 Gm24481-201ENSMUST00000157210 102 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
Spocd1B1ASB6 Gm23782-201ENSMUST00000157939 120 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
Spocd1B1ASB6 Gm25748-201ENSMUST00000175487 70 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
Spocd1B1ASB6 Gm24497-201ENSMUST00000177868 191 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
Spocd1B1ASB6 1700067G17Rik-201ENSMUST00000186180 603 ntTSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
Spocd1B1ASB6 Gm44174-201ENSMUST00000205022 141 ntTSL 2 BASIC4.42□□□□□ -1.7
Spocd1B1ASB6 Fth-ps3-201ENSMUST00000210405 358 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
Spocd1B1ASB6 Olfr1101-202ENSMUST00000214411 3235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.42□□□□□ -1.7
Spocd1B1ASB6 Olfr875-202ENSMUST00000215128 2039 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.42□□□□□ -1.7
Spocd1B1ASB6 Olfr769-202ENSMUST00000215453 4143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.42□□□□□ -1.7
Spocd1B1ASB6 AC154313.1-201ENSMUST00000217755 3841 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
Spocd1B1ASB6 CT010449.1-201ENSMUST00000220624 153 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
Spocd1B1ASB6 Gm25813-201ENSMUST00000082748 191 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
Spocd1B1ASB6 Gm24950-201ENSMUST00000082768 191 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
Spocd1B1ASB6 Gm23444-201ENSMUST00000082922 191 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
Spocd1B1ASB6 Gm23971-201ENSMUST00000083317 191 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
Spocd1B1ASB6 Gm23849-201ENSMUST00000083833 191 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
Spocd1B1ASB6 Gm26316-201ENSMUST00000083886 191 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
Spocd1B1ASB6 Rnu2-10-201ENSMUST00000084010 191 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
Spocd1B1ASB6 Atad1-201ENSMUST00000070210 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
Spocd1B1ASB6 Gprc6a-203ENSMUST00000219286 2574 ntTSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
Spocd1B1ASB6 Znf41-ps-201ENSMUST00000122051 2413 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
Spocd1B1ASB6 Elavl2-208ENSMUST00000107120 4191 ntTSL 5 BASIC4.42□□□□□ -1.7
Spocd1B1ASB6 Gm37498-201ENSMUST00000193524 4002 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
Spocd1B1ASB6 Zfp85-202ENSMUST00000144183 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
Spocd1B1ASB6 Gm36989-201ENSMUST00000193225 2160 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
Spocd1B1ASB6 Olfr165-202ENSMUST00000206110 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC4.41□□□□□ -1.7
Spocd1B1ASB6 Mir592-201ENSMUST00000102113 96 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
Spocd1B1ASB6 Gm26418-201ENSMUST00000104275 137 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
Spocd1B1ASB6 Gm24987-201ENSMUST00000104453 134 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
Spocd1B1ASB6 Rpl31-ps5-201ENSMUST00000118086 375 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
Spocd1B1ASB6 Gm15313-201ENSMUST00000119179 282 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
Spocd1B1ASB6 Gm13581-201ENSMUST00000120675 278 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
Spocd1B1ASB6 Gm15949-201ENSMUST00000129485 126 ntTSL 3 BASIC4.41□□□□□ -1.7
Spocd1B1ASB6 Gm26337-201ENSMUST00000178000 79 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
Spocd1B1ASB6 Mir6540-201ENSMUST00000184886 108 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
Spocd1B1ASB6 Trdv1-202ENSMUST00000187163 334 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.41□□□□□ -1.7
Spocd1B1ASB6 Ighv1-32-201ENSMUST00000195149 351 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
Spocd1B1ASB6 Gm29926-201ENSMUST00000201443 660 ntTSL 3 BASIC4.41□□□□□ -1.7
Spocd1B1ASB6 AC154276.2-201ENSMUST00000227707 309 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
Spocd1B1ASB6 Spink1-201ENSMUST00000025381 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
Spocd1B1ASB6 Mir32-201ENSMUST00000083610 70 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
Spocd1B1ASB6 Olfr728-202ENSMUST00000213685 7087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.41□□□□□ -1.7
Spocd1B1ASB6 Neurod4-201ENSMUST00000061571 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
Spocd1B1ASB6 Uty-205ENSMUST00000143286 5083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
Spocd1B1ASB6 Gm45792-201ENSMUST00000207795 4268 ntTSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
Spocd1B1ASB6 Adam29-201ENSMUST00000053441 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
Spocd1B1ASB6 Olfr194-203ENSMUST00000216519 3705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.41□□□□□ -1.7
Spocd1B1ASB6 Olfr107-202ENSMUST00000215894 2512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.7
Spocd1B1ASB6 Gm37788-201ENSMUST00000193958 2705 ntBASIC4.4□□□□□ -1.7
Spocd1B1ASB6 Olfr715b-202ENSMUST00000215713 3879 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.7
Spocd1B1ASB6 Olfr706-202ENSMUST00000213918 4828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.7
Spocd1B1ASB6 Pde1a-205ENSMUST00000102654 4122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.7
Spocd1B1ASB6 Gm21033-201ENSMUST00000208590 2608 ntBASIC4.4□□□□□ -1.7
Spocd1B1ASB6 Gm9343-201ENSMUST00000209016 2609 ntBASIC4.4□□□□□ -1.7
Spocd1B1ASB6 Gm11718-201ENSMUST00000119942 537 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
Spocd1B1ASB6 Gm15799-201ENSMUST00000120899 289 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
Spocd1B1ASB6 Gm26148-201ENSMUST00000157430 68 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
Spocd1B1ASB6 Gm24537-201ENSMUST00000157950 102 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
Spocd1B1ASB6 Gm25615-201ENSMUST00000177836 94 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
Spocd1B1ASB6 Gm6651-201ENSMUST00000189471 271 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
Spocd1B1ASB6 Gm4644-201ENSMUST00000197587 400 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
Spocd1B1ASB6 Gm40331-201ENSMUST00000198430 217 ntTSL 3 BASIC4.4□□□□□ -1.71
Spocd1B1ASB6 AC165293.1-201ENSMUST00000219669 329 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
Spocd1B1ASB6 AC173345.1-201ENSMUST00000222837 306 ntTSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.71
Spocd1B1ASB6 Gm22061-201ENSMUST00000082557 107 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
Spocd1B1ASB6 Gm23454-201ENSMUST00000083332 133 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
Spocd1B1ASB6 Mir370-201ENSMUST00000083499 79 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
Spocd1B1ASB6 Mir132-201ENSMUST00000083603 66 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
Spocd1B1ASB6 n-R5s54-201ENSMUST00000083837 112 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
Spocd1B1ASB6 Mup1-201ENSMUST00000084548 776 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.4□□□□□ -1.71
Spocd1B1ASB6 Olfr263-202ENSMUST00000215804 3963 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.71
Spocd1B1ASB6 Usp34-208ENSMUST00000180046 12200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 134 ms