Protein–RNA interactions for Protein: B1AS29

Grik3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik3B1AS29 Gm25119-201ENSMUST00000158815 88 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
Grik3B1AS29 Gm7097-201ENSMUST00000161841 491 ntTSL 3 BASIC3.13□□□□□ -1.91
Grik3B1AS29 Mir7093-201ENSMUST00000184195 101 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
Grik3B1AS29 Gm27245-201ENSMUST00000184385 376 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
Grik3B1AS29 Gm20937-202ENSMUST00000189084 811 ntTSL 1 (best) BASIC3.13□□□□□ -1.91
Grik3B1AS29 Gm18982-201ENSMUST00000198118 529 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
Grik3B1AS29 Gm44223-201ENSMUST00000204854 114 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
Grik3B1AS29 Gm45455-202ENSMUST00000211156 630 ntTSL 1 (best) BASIC3.13□□□□□ -1.91
Grik3B1AS29 AC167721.1-201ENSMUST00000217088 279 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
Grik3B1AS29 AC158981.3-202ENSMUST00000228906 523 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
Grik3B1AS29 Olfr166-202ENSMUST00000213531 4205 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.13□□□□□ -1.91
Grik3B1AS29 Rag2-201ENSMUST00000044031 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.13□□□□□ -1.91
Grik3B1AS29 Pak3-205ENSMUST00000112868 8163 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.12□□□□□ -1.91
Grik3B1AS29 Csn1s2b-202ENSMUST00000101057 1668 ntTSL 1 (best) BASIC3.12□□□□□ -1.91
Grik3B1AS29 Olfr1318-202ENSMUST00000214063 3556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.12□□□□□ -1.91
Grik3B1AS29 Gm7853-201ENSMUST00000100708 478 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
Grik3B1AS29 Btf3l4-201ENSMUST00000102739 723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.12□□□□□ -1.91
Grik3B1AS29 Gm25848-201ENSMUST00000116790 144 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
Grik3B1AS29 Gm15175-201ENSMUST00000117629 132 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
Grik3B1AS29 Gm11556-201ENSMUST00000120751 288 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
Grik3B1AS29 Gm13596-201ENSMUST00000153354 292 ntTSL 5 BASIC3.12□□□□□ -1.91
Grik3B1AS29 Gm22141-201ENSMUST00000157403 277 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
Grik3B1AS29 Gm22098-201ENSMUST00000157930 85 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
Grik3B1AS29 Gm22136-201ENSMUST00000158751 268 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
Grik3B1AS29 Gm16043-201ENSMUST00000160030 616 ntTSL 3 BASIC3.12□□□□□ -1.91
Grik3B1AS29 Gm23862-201ENSMUST00000180342 94 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
Grik3B1AS29 Gm26871-203ENSMUST00000181060 355 ntTSL 1 (best) BASIC3.12□□□□□ -1.91
Grik3B1AS29 Gm26928-201ENSMUST00000182674 572 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
Grik3B1AS29 Gm28755-201ENSMUST00000185773 199 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
Grik3B1AS29 Gm18291-201ENSMUST00000190791 301 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
Grik3B1AS29 Gm43115-201ENSMUST00000196244 160 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
Grik3B1AS29 Gm43393-201ENSMUST00000200147 194 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
Grik3B1AS29 Gm43955-201ENSMUST00000204332 142 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
Grik3B1AS29 Gm45344-201ENSMUST00000211610 341 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
Grik3B1AS29 Gm24037-201ENSMUST00000082871 180 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
Grik3B1AS29 Mir181a-1-201ENSMUST00000083631 87 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
Grik3B1AS29 Gm13757-202ENSMUST00000179450 4383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.12□□□□□ -1.91
Grik3B1AS29 Wnk3-201ENSMUST00000096285 8551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.12□□□□□ -1.91
Grik3B1AS29 Gm2026-201ENSMUST00000109007 1621 ntTSL 1 (best) BASIC3.11□□□□□ -1.91
Grik3B1AS29 Olfr1289-201ENSMUST00000120021 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.11□□□□□ -1.91
Grik3B1AS29 Gm21897-201ENSMUST00000178312 1500 ntAPPRIS P1 BASIC3.11□□□□□ -1.91
Grik3B1AS29 n-R5s202-201ENSMUST00000104517 114 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
Grik3B1AS29 Gm13343-201ENSMUST00000116474 105 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
Grik3B1AS29 Gm14355-201ENSMUST00000117352 264 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
Grik3B1AS29 Gm11386-201ENSMUST00000117761 347 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
Grik3B1AS29 Gm15936-201ENSMUST00000118706 460 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
Grik3B1AS29 Gm13339-201ENSMUST00000120651 510 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
Grik3B1AS29 Gm14736-201ENSMUST00000121470 336 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
Grik3B1AS29 Gm13210-201ENSMUST00000121483 273 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
Grik3B1AS29 Gm15065-201ENSMUST00000121699 273 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
Grik3B1AS29 Gm14333-201ENSMUST00000130484 264 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
Grik3B1AS29 Rps15a-ps5-201ENSMUST00000132586 393 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
Grik3B1AS29 Gm13794-201ENSMUST00000148637 468 ntTSL 3 BASIC3.11□□□□□ -1.91
Grik3B1AS29 Gm24419-201ENSMUST00000157875 332 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
Grik3B1AS29 Gm21797-201ENSMUST00000177579 543 ntAPPRIS P1 BASIC3.11□□□□□ -1.91
Grik3B1AS29 Gm21767-201ENSMUST00000178689 543 ntAPPRIS P1 BASIC3.11□□□□□ -1.91
Grik3B1AS29 Gm21822-201ENSMUST00000179302 543 ntAPPRIS P1 BASIC3.11□□□□□ -1.91
Grik3B1AS29 Gm27532-201ENSMUST00000183726 113 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
Grik3B1AS29 Gm28534-201ENSMUST00000187744 676 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
Grik3B1AS29 Gm33354-201ENSMUST00000195448 906 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
Grik3B1AS29 Gm36551-201ENSMUST00000196787 300 ntTSL 5 BASIC3.11□□□□□ -1.91
Grik3B1AS29 Gm6135-201ENSMUST00000198726 372 ntTSL 2 BASIC3.11□□□□□ -1.91
Grik3B1AS29 Gm32222-201ENSMUST00000203296 298 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
Grik3B1AS29 Gm44266-201ENSMUST00000205235 500 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
Grik3B1AS29 AC144942.1-201ENSMUST00000220425 597 ntTSL 5 BASIC3.11□□□□□ -1.91
Grik3B1AS29 AC104832.1-201ENSMUST00000222938 550 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
Grik3B1AS29 CT009713.9-201ENSMUST00000223604 389 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
Grik3B1AS29 AC155167.3-201ENSMUST00000226349 217 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
Grik3B1AS29 Olfr769-201ENSMUST00000050915 1084 ntAPPRIS P1 BASIC3.11□□□□□ -1.91
Grik3B1AS29 Efcab9-201ENSMUST00000054327 754 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.11□□□□□ -1.91
Grik3B1AS29 Defb39-201ENSMUST00000075504 252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.11□□□□□ -1.91
Grik3B1AS29 Olfr299-202ENSMUST00000217253 4479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.11□□□□□ -1.91
Grik3B1AS29 Olfr355-202ENSMUST00000213574 3610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.11□□□□□ -1.91
Grik3B1AS29 Esp34-201ENSMUST00000173055 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.1□□□□□ -1.91
Grik3B1AS29 Esp34-202ENSMUST00000178654 1413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.1□□□□□ -1.91
Grik3B1AS29 Gm38211-201ENSMUST00000192814 7217 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
Grik3B1AS29 Gm38706-201ENSMUST00000182397 2617 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
Grik3B1AS29 Olfr786-202ENSMUST00000204529 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.1□□□□□ -1.91
Grik3B1AS29 Ifi203-201ENSMUST00000042228 3754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.1□□□□□ -1.91
Grik3B1AS29 Olfr722-201ENSMUST00000053290 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.1□□□□□ -1.91
Grik3B1AS29 Gm25970-201ENSMUST00000157165 86 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
Grik3B1AS29 Gm22225-201ENSMUST00000157358 278 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
Grik3B1AS29 Vmn2r-ps58-201ENSMUST00000173044 242 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
Grik3B1AS29 Gm25243-201ENSMUST00000174912 207 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
Grik3B1AS29 Gm24168-201ENSMUST00000178825 107 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
Grik3B1AS29 Mir6353-201ENSMUST00000183596 113 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
Grik3B1AS29 Gm27505-201ENSMUST00000185071 110 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
Grik3B1AS29 4930584F24Rik-203ENSMUST00000197091 954 ntTSL 1 (best) BASIC3.1□□□□□ -1.91
Grik3B1AS29 Gm43521-201ENSMUST00000197838 255 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
Grik3B1AS29 Gm43107-201ENSMUST00000198729 255 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
Grik3B1AS29 Gm9967-203ENSMUST00000206903 408 ntTSL 3 BASIC3.1□□□□□ -1.91
Grik3B1AS29 Olfr546-ps1-201ENSMUST00000210328 326 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
Grik3B1AS29 AC174457.1-201ENSMUST00000215932 226 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
Grik3B1AS29 AC117202.3-201ENSMUST00000228532 310 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
Grik3B1AS29 n-R5s40-201ENSMUST00000082475 124 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
Grik3B1AS29 Gm13479-201ENSMUST00000130773 4722 ntTSL 1 (best) BASIC3.1□□□□□ -1.91
Grik3B1AS29 Olfr902-202ENSMUST00000213105 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.1□□□□□ -1.91
Grik3B1AS29 Atp11c-205ENSMUST00000154051 6039 ntTSL 5 BASIC3.1□□□□□ -1.91
Grik3B1AS29 Zfp729b-201ENSMUST00000012873 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.91
Grik3B1AS29 Vmn1r185-206ENSMUST00000227479 6525 ntAPPRIS P1 BASIC3.09□□□□□ -1.91
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