Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS0

Col4a3, Collagen alpha-3(IV) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a3Q9QZS0 AC133654.1-201ENSMUST00000228411 672 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
Col4a3Q9QZS0 Gm22507-201ENSMUST00000082773 160 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
Col4a3Q9QZS0 Vmn2r-ps83-201ENSMUST00000173787 2368 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
Col4a3Q9QZS0 Gm8935-202ENSMUST00000105727 1959 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
Col4a3Q9QZS0 Olfr595-ps1-201ENSMUST00000118180 954 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
Col4a3Q9QZS0 Gm13676-201ENSMUST00000122185 591 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
Col4a3Q9QZS0 Gm14770-201ENSMUST00000122197 312 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
Col4a3Q9QZS0 Gm14126-201ENSMUST00000122345 395 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
Col4a3Q9QZS0 Gm24467-201ENSMUST00000157887 126 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
Col4a3Q9QZS0 Gm23415-201ENSMUST00000175519 83 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
Col4a3Q9QZS0 Tmem167-ps1-201ENSMUST00000191236 214 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
Col4a3Q9QZS0 Gm42533-201ENSMUST00000196247 157 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
Col4a3Q9QZS0 Gm42454-201ENSMUST00000196805 1181 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
Col4a3Q9QZS0 Gm43979-201ENSMUST00000203179 475 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
Col4a3Q9QZS0 Gm43978-201ENSMUST00000203491 451 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
Col4a3Q9QZS0 Gm44332-201ENSMUST00000203712 433 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
Col4a3Q9QZS0 AC122367.2-201ENSMUST00000220987 534 ntTSL 2 BASIC1.39□□□□□ -2.19
Col4a3Q9QZS0 Traj13-201ENSMUST00000103728 57 ntAPPRIS P1 BASIC1.38□□□□□ -2.19
Col4a3Q9QZS0 Gm14709-201ENSMUST00000121225 304 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
Col4a3Q9QZS0 1700046C09Rik-201ENSMUST00000139973 543 ntTSL 1 (best) BASIC1.38□□□□□ -2.19
Col4a3Q9QZS0 Gm26186-201ENSMUST00000157689 125 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
Col4a3Q9QZS0 Gm22963-201ENSMUST00000157960 91 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
Col4a3Q9QZS0 Gm25166-201ENSMUST00000158909 111 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
Col4a3Q9QZS0 Gm3298-201ENSMUST00000165289 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.38□□□□□ -2.19
Col4a3Q9QZS0 Gm17064-201ENSMUST00000167690 452 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
Col4a3Q9QZS0 Gm8206-202ENSMUST00000168733 516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.38□□□□□ -2.19
Col4a3Q9QZS0 Gm7346-201ENSMUST00000169661 476 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
Col4a3Q9QZS0 Gm22392-201ENSMUST00000177971 107 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
Col4a3Q9QZS0 Gm26713-201ENSMUST00000181827 627 ntTSL 1 (best) BASIC1.38□□□□□ -2.19
Col4a3Q9QZS0 Mir6540-201ENSMUST00000184886 108 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
Col4a3Q9QZS0 Gm37987-201ENSMUST00000194999 825 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
Col4a3Q9QZS0 Olfr783-ps1-201ENSMUST00000205105 441 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
Col4a3Q9QZS0 Gm45023-201ENSMUST00000207951 379 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
Col4a3Q9QZS0 Gm19233-201ENSMUST00000219772 936 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
Col4a3Q9QZS0 AC167977.1-201ENSMUST00000221384 234 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
Col4a3Q9QZS0 AC101945.3-201ENSMUST00000226568 153 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
Col4a3Q9QZS0 AC133156.1-202ENSMUST00000227284 363 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
Col4a3Q9QZS0 Olfr196-201ENSMUST00000077027 930 ntAPPRIS P1 BASIC1.38□□□□□ -2.19
Col4a3Q9QZS0 Mup-ps12-201ENSMUST00000126217 549 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
Col4a3Q9QZS0 Gm23469-201ENSMUST00000157131 104 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
Col4a3Q9QZS0 Gm24942-201ENSMUST00000158328 114 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
Col4a3Q9QZS0 Gm26722-201ENSMUST00000181237 1048 ntTSL 5 BASIC1.37□□□□□ -2.19
Col4a3Q9QZS0 Gm27522-201ENSMUST00000183949 230 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
Col4a3Q9QZS0 Gm21294-201ENSMUST00000186443 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.37□□□□□ -2.19
Col4a3Q9QZS0 Gm20888-202ENSMUST00000186890 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.37□□□□□ -2.19
Col4a3Q9QZS0 Gm21497-201ENSMUST00000189455 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.37□□□□□ -2.19
Col4a3Q9QZS0 Gm20811-201ENSMUST00000190500 553 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
Col4a3Q9QZS0 Gm43994-201ENSMUST00000203809 227 ntTSL 5 BASIC1.37□□□□□ -2.19
Col4a3Q9QZS0 Gm43897-201ENSMUST00000204019 309 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
Col4a3Q9QZS0 Gm18268-201ENSMUST00000208445 943 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
Col4a3Q9QZS0 CAAA01090811.1-201ENSMUST00000216828 277 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
Col4a3Q9QZS0 Gm26439-201ENSMUST00000082592 106 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
Col4a3Q9QZS0 Olfr1002-201ENSMUST00000099920 957 ntAPPRIS P1 BASIC1.37□□□□□ -2.19
Col4a3Q9QZS0 Vmn1r75-202ENSMUST00000226622 6638 ntAPPRIS P2 BASIC1.37□□□□□ -2.19
Col4a3Q9QZS0 Gm43498-201ENSMUST00000202002 1486 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
Col4a3Q9QZS0 Gm5583-201ENSMUST00000174328 1519 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
Col4a3Q9QZS0 Olfr67-201ENSMUST00000183254 3851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.37□□□□□ -2.19
Col4a3Q9QZS0 Gm381-201ENSMUST00000117443 2037 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
Col4a3Q9QZS0 Gm14517-201ENSMUST00000119040 337 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
Col4a3Q9QZS0 Klrc2-204ENSMUST00000119533 717 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC1.36□□□□□ -2.19
Col4a3Q9QZS0 Gm9440-201ENSMUST00000119667 539 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
Col4a3Q9QZS0 Gm25107-201ENSMUST00000122472 129 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
Col4a3Q9QZS0 Gm24381-201ENSMUST00000122697 104 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
Col4a3Q9QZS0 Gm25768-201ENSMUST00000158570 98 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
Col4a3Q9QZS0 Gm20534-201ENSMUST00000172957 172 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
Col4a3Q9QZS0 Gm22693-201ENSMUST00000175049 442 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
Col4a3Q9QZS0 Gm35570-201ENSMUST00000198730 681 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
Col4a3Q9QZS0 Gm44088-201ENSMUST00000204595 237 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
Col4a3Q9QZS0 Gm9068-201ENSMUST00000217393 455 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
Col4a3Q9QZS0 1700011B04Rik-211ENSMUST00000222690 394 ntTSL 5 BASIC1.36□□□□□ -2.19
Col4a3Q9QZS0 Olfr790-203ENSMUST00000215067 2659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.36□□□□□ -2.19
Col4a3Q9QZS0 Olfr58-202ENSMUST00000215112 2454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.36□□□□□ -2.19
Col4a3Q9QZS0 Gm7648-201ENSMUST00000173036 1658 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
Col4a3Q9QZS0 Gm23435-201ENSMUST00000157183 156 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
Col4a3Q9QZS0 Gm22885-201ENSMUST00000157410 107 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
Col4a3Q9QZS0 Gm22390-201ENSMUST00000157588 325 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
Col4a3Q9QZS0 Spink14-202ENSMUST00000162265 542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.35□□□□□ -2.19
Col4a3Q9QZS0 Esp15-201ENSMUST00000178929 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.35□□□□□ -2.19
Col4a3Q9QZS0 Gm27582-201ENSMUST00000184084 126 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
Col4a3Q9QZS0 Gm28448-201ENSMUST00000188547 428 ntTSL 5 BASIC1.35□□□□□ -2.19
Col4a3Q9QZS0 Gm18546-201ENSMUST00000197245 676 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
Col4a3Q9QZS0 Gm17937-201ENSMUST00000197908 742 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
Col4a3Q9QZS0 Gm42774-201ENSMUST00000198854 283 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
Col4a3Q9QZS0 Gm43680-201ENSMUST00000199466 340 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
Col4a3Q9QZS0 Gm43659-201ENSMUST00000200894 628 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
Col4a3Q9QZS0 Gm44520-201ENSMUST00000205447 802 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
Col4a3Q9QZS0 Lilr4b-211ENSMUST00000219661 1143 ntTSL 1 (best) BASIC1.35□□□□□ -2.19
Col4a3Q9QZS0 Vmn1r78-203ENSMUST00000228664 8100 ntAPPRIS P1 BASIC1.35□□□□□ -2.19
Col4a3Q9QZS0 Olfr867-202ENSMUST00000212098 4228 ntTSL 3 BASIC1.35□□□□□ -2.19
Col4a3Q9QZS0 Gm6096-201ENSMUST00000105172 456 ntAPPRIS P1 BASIC1.35□□□□□ -2.19
Col4a3Q9QZS0 Olfr379-ps1-201ENSMUST00000117349 934 ntAPPRIS P1 BASIC1.35□□□□□ -2.19
Col4a3Q9QZS0 Gm14677-201ENSMUST00000117866 486 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
Col4a3Q9QZS0 Gm13239-201ENSMUST00000119920 637 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
Col4a3Q9QZS0 Gm3104-201ENSMUST00000171004 473 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
Col4a3Q9QZS0 Gm25312-201ENSMUST00000178972 107 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
Col4a3Q9QZS0 Gm28151-201ENSMUST00000189404 951 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
Col4a3Q9QZS0 Gm28986-201ENSMUST00000189682 678 ntTSL 5 BASIC1.35□□□□□ -2.19
Col4a3Q9QZS0 Gm17935-201ENSMUST00000196649 772 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
Col4a3Q9QZS0 Gm43142-201ENSMUST00000198670 361 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
Col4a3Q9QZS0 AC129202.1-201ENSMUST00000224895 526 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.5 ms