Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXD8

Limd1, LIM domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 668 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Limd1Q9QXD8 Vmn2r20-201ENSMUST00000172199 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Limd1Q9QXD8 Senp7-202ENSMUST00000089360 4802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Limd1Q9QXD8 Olfr1197-202ENSMUST00000213118 2899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Limd1Q9QXD8 Rnf213-201ENSMUST00000093902 16716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Limd1Q9QXD8 Vmn1r169-204ENSMUST00000227932 2745 ntAPPRIS P1 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Limd1Q9QXD8 Oog1-202ENSMUST00000222112 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Limd1Q9QXD8 Olfr992-203ENSMUST00000214895 2222 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Limd1Q9QXD8 Vmn1r206-202ENSMUST00000227244 3970 ntAPPRIS P1 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Limd1Q9QXD8 Igkv14-100-201ENSMUST00000103325 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Limd1Q9QXD8 Traj25-201ENSMUST00000103716 57 ntAPPRIS P1 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Limd1Q9QXD8 Gm23013-201ENSMUST00000104146 106 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Limd1Q9QXD8 Gm10444-201ENSMUST00000126708 148 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Limd1Q9QXD8 Gm23331-201ENSMUST00000157423 108 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Limd1Q9QXD8 Ubl5-209ENSMUST00000161882 489 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Limd1Q9QXD8 Gm16404-201ENSMUST00000177739 468 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Limd1Q9QXD8 Gm6660-201ENSMUST00000179149 468 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Limd1Q9QXD8 Gm14598-201ENSMUST00000180109 468 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Limd1Q9QXD8 Gm14625-201ENSMUST00000180231 468 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Limd1Q9QXD8 Gm28702-201ENSMUST00000188276 253 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Limd1Q9QXD8 AC156790.5-201ENSMUST00000227075 231 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Limd1Q9QXD8 Olfr681-201ENSMUST00000098157 948 ntAPPRIS P1 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Limd1Q9QXD8 Cul4b-203ENSMUST00000115118 3344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Limd1Q9QXD8 Olfr1507-203ENSMUST00000206062 2803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Limd1Q9QXD8 Nlrp4d-201ENSMUST00000182420 2946 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Limd1Q9QXD8 2310001H17Rik-203ENSMUST00000181517 3981 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Limd1Q9QXD8 Gm42486-201ENSMUST00000200369 3486 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Limd1Q9QXD8 Olfr790-202ENSMUST00000203966 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Limd1Q9QXD8 Gria2-201ENSMUST00000075316 10371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
Limd1Q9QXD8 Gm43844-201ENSMUST00000202926 5605 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Limd1Q9QXD8 Mir1b-201ENSMUST00000117012 122 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Limd1Q9QXD8 Gm15350-201ENSMUST00000135138 569 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Limd1Q9QXD8 Gm25965-201ENSMUST00000157170 93 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Limd1Q9QXD8 Obox4-ps37-201ENSMUST00000177223 276 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Limd1Q9QXD8 Gm28612-201ENSMUST00000189214 416 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Limd1Q9QXD8 Gm37050-201ENSMUST00000193464 466 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Limd1Q9QXD8 Gm18982-201ENSMUST00000198118 529 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Limd1Q9QXD8 Gm42526-201ENSMUST00000198956 393 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Limd1Q9QXD8 Gm17779-201ENSMUST00000213395 394 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Limd1Q9QXD8 AC173345.2-201ENSMUST00000222795 153 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Limd1Q9QXD8 AC183092.1-201ENSMUST00000224301 153 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Limd1Q9QXD8 Gm23462-201ENSMUST00000083264 104 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Limd1Q9QXD8 Gm24164-201ENSMUST00000093663 104 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Limd1Q9QXD8 Olfr657-203ENSMUST00000215454 2397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Limd1Q9QXD8 AC126673.1-201ENSMUST00000223208 3856 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Limd1Q9QXD8 Gm34885-201ENSMUST00000217440 4070 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
Limd1Q9QXD8 Huwe1-202ENSMUST00000112622 14168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
Limd1Q9QXD8 Synpr-207ENSMUST00000223583 3362 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Limd1Q9QXD8 Usp46-201ENSMUST00000068058 4557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
Limd1Q9QXD8 2810474O19Rik-208ENSMUST00000189837 5469 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
Limd1Q9QXD8 Olfr165-202ENSMUST00000206110 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Limd1Q9QXD8 Ptprc-203ENSMUST00000182283 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
Limd1Q9QXD8 Olfr556-202ENSMUST00000213485 3825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
Limd1Q9QXD8 Olfr1484-204ENSMUST00000216014 3842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
Limd1Q9QXD8 Xirp2-202ENSMUST00000112347 11979 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
Limd1Q9QXD8 Trim12c-201ENSMUST00000059037 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
Limd1Q9QXD8 Gm13787-201ENSMUST00000120422 168 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Limd1Q9QXD8 Gm14916-201ENSMUST00000121904 204 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Limd1Q9QXD8 Gm22601-201ENSMUST00000157595 250 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Limd1Q9QXD8 Gm23496-201ENSMUST00000157741 248 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Limd1Q9QXD8 Olfr468-ps1-201ENSMUST00000207203 593 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Limd1Q9QXD8 Gm18015-201ENSMUST00000214879 316 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Limd1Q9QXD8 Gm23722-201ENSMUST00000083002 130 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Limd1Q9QXD8 2410141K09Rik-201ENSMUST00000091541 288 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
Limd1Q9QXD8 Gm19541-201ENSMUST00000184488 2868 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
Limd1Q9QXD8 Gm19744-204ENSMUST00000188936 4533 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
Limd1Q9QXD8 Olfr639-202ENSMUST00000215653 6570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
Limd1Q9QXD8 AC154481.2-201ENSMUST00000222526 3175 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Limd1Q9QXD8 Gm28168-201ENSMUST00000191265 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
Limd1Q9QXD8 Olfr1348-207ENSMUST00000209029 2696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
Limd1Q9QXD8 Olfr847-202ENSMUST00000216839 2385 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
Limd1Q9QXD8 Gpr21-201ENSMUST00000065441 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
Limd1Q9QXD8 Hrnr-202ENSMUST00000093774 11187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
Limd1Q9QXD8 Gm37628-201ENSMUST00000194644 5440 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Limd1Q9QXD8 Mir551b-201ENSMUST00000102165 98 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Limd1Q9QXD8 Igkv1-110-201ENSMUST00000103321 401 ntAPPRIS P1 BASIC4.86□□□□□ -1.63
Limd1Q9QXD8 Gm23651-201ENSMUST00000116755 120 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Limd1Q9QXD8 Gm9157-201ENSMUST00000117673 225 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Limd1Q9QXD8 Gm22883-201ENSMUST00000157376 106 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Limd1Q9QXD8 Gm37431-201ENSMUST00000195102 111 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Limd1Q9QXD8 Gm44485-201ENSMUST00000199569 137 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Limd1Q9QXD8 Eif4e-206ENSMUST00000200239 526 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
Limd1Q9QXD8 Olfr454-ps1-201ENSMUST00000205206 348 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Limd1Q9QXD8 Gm35405-201ENSMUST00000218754 400 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Limd1Q9QXD8 AC160756.1-201ENSMUST00000227266 235 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Limd1Q9QXD8 Sprr2e-201ENSMUST00000068399 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
Limd1Q9QXD8 Steap2-209ENSMUST00000164219 10089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
Limd1Q9QXD8 AC144772.3-201ENSMUST00000228829 3126 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Limd1Q9QXD8 Gm42583-201ENSMUST00000202678 6700 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Limd1Q9QXD8 Gpm6a-201ENSMUST00000033915 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Limd1Q9QXD8 Erv3-201ENSMUST00000040941 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Limd1Q9QXD8 Tdo2-201ENSMUST00000029645 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Limd1Q9QXD8 AC158605.2-201ENSMUST00000220287 2726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Limd1Q9QXD8 Usp9x-201ENSMUST00000089302 11887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Limd1Q9QXD8 Olfr1228-202ENSMUST00000215447 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Limd1Q9QXD8 Olfr986-204ENSMUST00000218134 3487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Limd1Q9QXD8 Gm44439-201ENSMUST00000203379 3592 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Limd1Q9QXD8 Olfr699-202ENSMUST00000215952 3669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Limd1Q9QXD8 Snora64-201ENSMUST00000104521 134 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Limd1Q9QXD8 Gm12760-201ENSMUST00000117861 482 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Limd1Q9QXD8 Gm25290-201ENSMUST00000122796 144 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
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