Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUK3

Cln8, Protein CLN8, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cln8Q9QUK3 Gm38311-201ENSMUST00000192945 165 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
Cln8Q9QUK3 Gm37743-201ENSMUST00000194645 376 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
Cln8Q9QUK3 Gm42425-201ENSMUST00000197756 565 ntTSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
Cln8Q9QUK3 Trav14-1-201ENSMUST00000198297 399 ntAPPRIS P1 BASIC2.23□□□□□ -2.05
Cln8Q9QUK3 Gm44324-201ENSMUST00000198517 135 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
Cln8Q9QUK3 Gm17906-201ENSMUST00000202480 901 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
Cln8Q9QUK3 Gm44519-201ENSMUST00000206486 122 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
Cln8Q9QUK3 AC112274.2-201ENSMUST00000218436 170 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
Cln8Q9QUK3 AC122393.3-201ENSMUST00000226343 1059 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
Cln8Q9QUK3 AC165284.1-201ENSMUST00000228614 458 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
Cln8Q9QUK3 Ear2-201ENSMUST00000074839 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
Cln8Q9QUK3 Mir423-201ENSMUST00000083584 109 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
Cln8Q9QUK3 1700008P02Rik-201ENSMUST00000091364 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
Cln8Q9QUK3 Gm10343-201ENSMUST00000096279 348 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
Cln8Q9QUK3 Gm3563-201ENSMUST00000172963 1628 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
Cln8Q9QUK3 Gm37296-201ENSMUST00000192728 2922 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
Cln8Q9QUK3 Gm13343-201ENSMUST00000116474 105 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
Cln8Q9QUK3 Gm12793-201ENSMUST00000119268 292 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
Cln8Q9QUK3 Gm25808-201ENSMUST00000122784 284 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
Cln8Q9QUK3 Gm14333-201ENSMUST00000130484 264 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
Cln8Q9QUK3 Gm2830-201ENSMUST00000140330 385 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
Cln8Q9QUK3 Gm24393-201ENSMUST00000158135 97 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
Cln8Q9QUK3 Gm24212-201ENSMUST00000158258 132 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
Cln8Q9QUK3 Gm24922-201ENSMUST00000158511 102 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
Cln8Q9QUK3 4930473D10Rik-201ENSMUST00000161975 487 ntTSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
Cln8Q9QUK3 BC028528-205ENSMUST00000171519 447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
Cln8Q9QUK3 Vmn1r-ps86-201ENSMUST00000174052 547 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
Cln8Q9QUK3 Gm23144-201ENSMUST00000180226 107 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
Cln8Q9QUK3 Mir6402-201ENSMUST00000183406 80 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
Cln8Q9QUK3 Gm43804-201ENSMUST00000198280 456 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
Cln8Q9QUK3 Gm44961-201ENSMUST00000207450 196 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
Cln8Q9QUK3 Gm45101-201ENSMUST00000208327 232 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
Cln8Q9QUK3 Gm45387-201ENSMUST00000209792 632 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
Cln8Q9QUK3 Gm45459-201ENSMUST00000209882 442 ntTSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
Cln8Q9QUK3 Olfr1114-ps1-201ENSMUST00000213896 456 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
Cln8Q9QUK3 AC116726.2-201ENSMUST00000217629 986 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
Cln8Q9QUK3 AC155927.1-201ENSMUST00000220114 1200 ntTSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
Cln8Q9QUK3 AC154527.5-201ENSMUST00000224448 496 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
Cln8Q9QUK3 Olfr823-201ENSMUST00000081469 948 ntAPPRIS P1 BASIC2.22□□□□□ -2.05
Cln8Q9QUK3 Zfp972-201ENSMUST00000081529 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
Cln8Q9QUK3 Gm25586-201ENSMUST00000082499 112 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
Cln8Q9QUK3 Gm22974-201ENSMUST00000083301 103 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
Cln8Q9QUK3 n-R5s197-201ENSMUST00000083302 119 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
Cln8Q9QUK3 1110057P08Rik-201ENSMUST00000089097 465 ntAPPRIS P1 BASIC2.22□□□□□ -2.05
Cln8Q9QUK3 Gm23741-201ENSMUST00000097237 171 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
Cln8Q9QUK3 Rex2-201ENSMUST00000075775 3993 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.22□□□□□ -2.05
Cln8Q9QUK3 Olfr394-202ENSMUST00000214284 5562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
Cln8Q9QUK3 Gm43663-201ENSMUST00000198643 1505 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
Cln8Q9QUK3 Ifi203-202ENSMUST00000081216 3610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
Cln8Q9QUK3 Gm9218-201ENSMUST00000121068 2694 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
Cln8Q9QUK3 Gm12225-201ENSMUST00000117995 298 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
Cln8Q9QUK3 Gm8858-201ENSMUST00000118259 342 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
Cln8Q9QUK3 Dnaic1-202ENSMUST00000119127 500 ntTSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
Cln8Q9QUK3 Gm11410-201ENSMUST00000120053 1143 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
Cln8Q9QUK3 Gm13424-201ENSMUST00000122301 354 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
Cln8Q9QUK3 n-R5s216-201ENSMUST00000122755 112 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
Cln8Q9QUK3 Gm11842-201ENSMUST00000130117 556 ntTSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
Cln8Q9QUK3 Gm25621-201ENSMUST00000157223 114 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
Cln8Q9QUK3 Gm23588-201ENSMUST00000157659 99 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
Cln8Q9QUK3 Gm24436-201ENSMUST00000157889 302 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
Cln8Q9QUK3 Vmn1r-ps47-201ENSMUST00000176694 907 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
Cln8Q9QUK3 Gm21746-201ENSMUST00000177612 543 ntAPPRIS P1 BASIC2.21□□□□□ -2.06
Cln8Q9QUK3 Gm24925-201ENSMUST00000178157 107 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
Cln8Q9QUK3 Gm22633-201ENSMUST00000179834 107 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
Cln8Q9QUK3 Snord116l14-201ENSMUST00000179875 94 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
Cln8Q9QUK3 Gm21913-201ENSMUST00000179880 1083 ntAPPRIS P1 BASIC2.21□□□□□ -2.06
Cln8Q9QUK3 Gm23379-201ENSMUST00000180026 107 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
Cln8Q9QUK3 Gm11395-201ENSMUST00000181011 499 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
Cln8Q9QUK3 Mir6338-201ENSMUST00000183389 109 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
Cln8Q9QUK3 Gm28356-202ENSMUST00000187566 858 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
Cln8Q9QUK3 Gm28597-201ENSMUST00000187664 666 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
Cln8Q9QUK3 Gm29335-201ENSMUST00000188361 459 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
Cln8Q9QUK3 Gm37353-201ENSMUST00000194497 313 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
Cln8Q9QUK3 Gm19202-201ENSMUST00000198096 808 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
Cln8Q9QUK3 Gm44818-201ENSMUST00000206608 358 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
Cln8Q9QUK3 Gm45288-201ENSMUST00000210236 151 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
Cln8Q9QUK3 Gm4224-201ENSMUST00000211557 1594 ntTSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
Cln8Q9QUK3 AL935138.1-201ENSMUST00000215309 196 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
Cln8Q9QUK3 Olfr962-ps1-201ENSMUST00000217332 442 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
Cln8Q9QUK3 AC157654.1-201ENSMUST00000224130 820 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
Cln8Q9QUK3 Olfr769-201ENSMUST00000050915 1084 ntAPPRIS P1 BASIC2.21□□□□□ -2.06
Cln8Q9QUK3 mt-Atp6-201ENSMUST00000082408 681 ntAPPRIS P1 BASIC2.21□□□□□ -2.06
Cln8Q9QUK3 AC153967.1-201ENSMUST00000219333 3190 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
Cln8Q9QUK3 Vmn1r87-202ENSMUST00000211249 1835 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.21□□□□□ -2.06
Cln8Q9QUK3 Gm45178-201ENSMUST00000207744 4110 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
Cln8Q9QUK3 Lrrc19-201ENSMUST00000053419 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
Cln8Q9QUK3 Thoc2-201ENSMUST00000047037 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
Cln8Q9QUK3 Snora36b-201ENSMUST00000104383 132 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
Cln8Q9QUK3 Gm9732-201ENSMUST00000111874 492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
Cln8Q9QUK3 Klra10-201ENSMUST00000112020 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
Cln8Q9QUK3 Gm13510-201ENSMUST00000118659 429 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
Cln8Q9QUK3 Gm12770-201ENSMUST00000121734 462 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
Cln8Q9QUK3 1700071G01Rik-201ENSMUST00000146728 367 ntTSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
Cln8Q9QUK3 Gm23124-201ENSMUST00000157650 107 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
Cln8Q9QUK3 Gm24959-201ENSMUST00000157924 146 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
Cln8Q9QUK3 Gm17521-201ENSMUST00000165345 468 ntAPPRIS P1 BASIC2.2□□□□□ -2.06
Cln8Q9QUK3 Ccdc152-201ENSMUST00000165386 798 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
Cln8Q9QUK3 Gm17538-201ENSMUST00000168236 327 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
Cln8Q9QUK3 Gm22166-201ENSMUST00000178419 121 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
Cln8Q9QUK3 Gm23288-201ENSMUST00000179213 121 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.6 ms